Apakah perbezaan antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks
The Perbezaan utama Antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks adalah analisis fluks metabolik adalah teknik fluxomics pengimejan untuk menganalisis kadar pengeluaran dan penggunaan metabolit dalam sistem biologi, manakala analisis keseimbangan fluks adalah teknik fluxomik matematik untuk menganalisis aliran metabolit melalui rangkaian metabolik.
Fluxomics merujuk kepada pelbagai pendekatan yang digunakan untuk menentukan kadar tindak balas metabolik dalam sistem biologi. Kepentingan fluksomik ialah fluks metabolik biasanya menentukan fenotip selular. Fluks metabolik adalah penukaran metabolit dalam rangkaian metabolik. Terdapat dua teknologi analisis fluxomics atau fluks penting. Mereka adalah analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah analisis fluks metabolik
3. Apakah analisis keseimbangan fluks
4. Persamaan -Analisis Fluks Metabolik dan Analisis Imbangan Fluks
5. Analisis Fluks Metabolik vs Analisis Baki Fluks Dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan -Analisis Fluks Metabolik vs Analisis Baki Fluks
Apakah analisis fluks metabolik?
Analisis Fluks Metabolik (MFA) adalah teknik fluxomics pengimejan yang menganalisis kadar pengeluaran dan penggunaan metabolit dalam sistem biologi. Teknik ini membolehkan kuantifikasi metabolit pada tahap intraselular. Oleh itu, teknik ini menjelaskan metabolisme pusat sel. Dalam analisis fluks metabolik, 13Kaedah berasaskan fluxomics biasanya digunakan untuk analisis fluks. Dalam 13C fluxomics, prekursor metabolik diperkaya dengan 13C Sebelum pengenalan ke dalam sistem biologi. Kemudian, menggunakan teknik pengimejan seperti spektrometri massa dan spektroskopi resonans magnetik nuklear, tahap penggabungan 13C ke metabolit diukur.
Rajah 01: Analisis Fluks Metabolik
Di samping itu, fluks metabolik boleh diukur dengan stoikiometri. Dalam analisis fluks metabolik, model stoikiometri dan kaedah spektrometri massa menentukan pemindahan moieties yang mengandungi pengesan isotop dari satu metabolit ke dalam rangkaian metabolik. Oleh itu, teknik ini dapat memperoleh maklumat mengenai keseluruhan rangkaian metabolik dan fenotip selular. Tambahan pula, analisis fluks metabolik mempunyai banyak aplikasi. Teknik ini dapat menentukan batas keupayaan sistem biologi dalam menghasilkan ejen biokimia seperti etanol. Di samping itu, teknik ini dapat meramalkan tindak balas terhadap penambahan gen atau kalah mati.
Apakah analisis keseimbangan fluks?
Analisis Imbangan Flux (FBA) adalah teknik fluxomics matematik yang menganalisis aliran metabolit melalui rangkaian metabolik. Ia dilakukan melalui proses dua langkah. Dalam langkah pertama, tindak balas metabolik diwakili secara matematik dalam bentuk matriks berangka yang mengandungi pekali stoikiometrik bagi setiap reaksi. Koefisien stoikiometrik ini mengenakan kekangan pada model sistem. Dengan memberikan kekangan seperti ini, kemungkinan penyelesaian penyelesaian kepada sistem dikurangkan. Dalam langkah kedua, berikutan penambahan kekangan, model sistem dioptimumkan. Analisis keseimbangan fluks mengira aliran metabolit dalam rangkaian metabolik dengan menggunakan mekanisme di atas. Oleh itu, adalah mungkin untuk meramalkan kadar pertumbuhan organisma atau kadar pengeluaran metabolit penting bioteknologi melalui FBA.
Rajah 02: Analisis keseimbangan fluks
Sumber untuk analisis keseimbangan flux termasuk pangkalan data Bigg, Cobra Toolbox, dan Fasimu (metabolomik perisian simulasi FBA). Analisis keseimbangan fluks mempunyai pelbagai kegunaan dalam kajian fisiologi, usaha pengisian jurang, dan biologi sintetik skala genom. Tambahan pula, FBA juga boleh digunakan untuk meramalkan hasil cofactors penting seperti ATP, NADH, atau NADPH.
Persamaan antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks
- Analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks adalah teknologi analisis fluks.
- Kedua -dua teknik itu berada dalam bidang biologi sistem
- Teknik -teknik ini dapat menentukan fluks metabolik dalam sistem biologi.
- Teknik ini mempunyai aplikasi yang luas.
- Kedua -dua teknik dapat menentukan fenotip sel.
Perbezaan antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks
Analisis fluks metabolik adalah teknik fluxomics pengimejan yang digunakan untuk menganalisis kadar pengeluaran dan penggunaan metabolit dalam sistem biologi, manakala analisis keseimbangan fluks adalah teknik fluxomik matematik yang menganalisis aliran metabolit melalui rangkaian metabolik. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks. Tambahan pula, analisis fluks metabolik menggunakan spektrometri massa atau resonans magnetik nuklear untuk menentukan fluks metabolik, manakala analisis keseimbangan fluks menggunakan matriks matematik (berangka) untuk menentukan fluks metabolik.
Infographic berikut menyenaraikan perbezaan antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks dalam bentuk tabular untuk perbandingan sampingan.
Ringkasan -Analisis Fluks Metabolik vs Analisis Baki Fluks
Teknologi Analisis Flux (Fluxomics) digunakan untuk menentukan kadar tindak balas metabolik dalam sistem biologi. Terdapat dua teknologi analisis fluks utama. Mereka adalah analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks. Analisis fluks metabolik adalah teknik fluxomics pengimejan untuk menganalisis kadar pengeluaran dan penggunaan metabolit dalam sistem biologi, manakala analisis keseimbangan fluks adalah teknik fluxomik matematik untuk menganalisis aliran metabolit melalui rangkaian metabolik. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara analisis fluks metabolik dan analisis keseimbangan fluks.
Rujukan:
1. "Analisis fluks metabolik."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.
2. Orth, Jeffrey D, et al. "Apakah analisis keseimbangan fluks?"Bioteknologi Alam, u.S. Perpustakaan Perubatan Negara, Mar. 2010.
Ihsan gambar:
1. "Interaksi metabolik antara astrocytes dan neuron dengan reaksi utama" dari rajah dalam artikel jurnal (lihat sumber). Penulis Artikel: Tunahan Cakir, Selma Alsan, Hale Saybasili, Ata Akin, Kutlu Ulgen - Cakir, Tunahan; Selma Alsan, Hale Saybasili, Ata Akin, Kutlu Ulgen (2007). "Rekonstruksi dan analisis fluks gandingan antara laluan metabolik astrocytes dan neuron: aplikasi untuk hipoksia serebrum" - Biologi Teoritis dan Pemodelan Perubatan 4 (1): 48. Doi: 10.1186/1742-4682-4-48. ISSN 1742-4682. Diperoleh pada 2007-12-17 (CC oleh 2.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Hasil Matematik FBA" oleh Thomasf2811 - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
