Perbezaan antara proteomik dan metabolomik

The Perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik adalah Proteomik adalah kajian semua protein organisma manakala metabolomik adalah kajian semua metabolit organisma.

Genomik adalah kajian genetik solekan organisma. Proteomik dan metabolomik adalah dua sains omik yang berkaitan dengan genomik. Proteome merujuk kepada semua protein dalam sel atau organisma. Metabolome, sebaliknya, merujuk kepada semua metabolit organisma. Oleh itu, kajian proteome adalah proteomik manakala kajian metabolom adalah metabolomik. Kedua -dua proteomik dan metabolomik penting dalam diagnostik penyakit dan pencirian dan pemeriksaan organisma. Selain itu, kedua-duanya dihubungkan dalam banyak aspek biologi sel, terutamanya dalam isyarat sel, kemerosotan protein dan penjanaan dan pengubahsuaian pasca translasi.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu proteomik
3. Apakah metabolomik
4. Persamaan antara proteomik dan metabolomik
5. Perbandingan sampingan - Proteomik vs metabolomik dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu proteomik?

Proteome adalah jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Oleh itu, proteomik adalah kajian protein organisma. Dalam proteomik, ciri -ciri protein yang berbeza dianalisis. Oleh itu, proteomik terutamanya memberi tumpuan kepada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, pengubahsuaian, aplikasi dan kepentingan protein. Itulah sebabnya banyak projek penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.

Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein di Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Selepas kejayaan projek ini, para saintis beralih untuk mencirikan jumlah kandungan protein pada haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik sebagai protein adalah molekul pentadbiran kebanyakan aktiviti kerana harta pemangkin protein. Oleh itu, kajian keseluruhan protein dapat memberikan maklumat mengenai status kesihatan organisma. Selain itu, proteomik mempunyai banyak aplikasi dalam penjelasan genom, pengenalan penyakit dan diagnostik, menjalankan kajian ekspresi protein semasa percubaan dan pengubahsuaian protein dan kajian interaksi, dan lain -lain.

Rajah 01: Proteomik

Terdapat teknik yang berbeza yang terlibat dalam proteomik, termasuk pengekstrakan jumlah protein, pemisahan mereka menggunakan elektroforesis gel 2D, penjujukan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri massa dan analisis sifat struktur dan fungsi protein menggunakan Perisian berasaskan komputer dan alat bioinformatik.

Apakah metabolomik?

Metabolomik adalah kajian semua metabolit dalam sel, tisu atau organisma. Ia termasuk pengenalan dan kuantifikasi metabolit selular menggunakan alat analisis dan statistik yang berbeza. Metabolomik adalah kajian penting kerana ia mendedahkan maklumat mengenai metabolisme organisma.

Rajah 02: Metabolomik

Untuk mengkaji substrat dan produk tindak balas metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis. Spektrometri massa menghasilkan metabolit dan kepekatan mereka, mencerminkan keadaan biokimia sebenar sel atau tisu. Oleh itu, metabolomik boleh dianggap sebagai perwakilan terbaik fenotip molekul organisma. Di samping itu, metabolomik boleh dianggap sebagai lanjutan proteomik kerana kebanyakan metabolit dihasilkan kerana aktiviti enzim yang merupakan protein.

Apakah persamaan antara proteomik dan metabolomik?

• Proteomik dan metabolomik adalah dua sains omik yang berkaitan dengan genomik.
• Metabolomik boleh dianggap sebagai lanjutan proteomik.
• Proteome dan metabolome berkait rapat dengan banyak kajian.

Apakah perbezaan antara proteomik dan metabolom?

Proteomik adalah kajian berskala besar protein termasuk struktur dan fungsi mereka, dalam sel atau organisma. Sementara itu, metabolomik adalah kajian profil metabolit dalam sel, tisu atau organisma di bawah satu set syarat. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutamanya merangkumi set lengkap protein manakala metabolomik terutamanya menyangkut set lengkap metabolit, termasuk pelbagai molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik sebatian eksogen, dan lain -lain. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Infographic di bawah meringkaskan perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Ringkasan -Proteomics vs Metabolomics

Organisma hidup boleh dikaji menggunakan genom, protein dan metabolit mereka. Genomik, proteomik dan metabolomik adalah tiga bidang yang mengkaji solekan genetik, protein dan metabolit sel atau organisma, masing-masing. Proteomik adalah penting kerana ia adalah gambaran dinamik kedua -dua gen dan persekitaran. Metabolomik sangat penting kerana ia secara langsung mencerminkan status semasa tindak balas biokimia sel atau status metabolik organisma. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Rujukan:

1. P, Surat. "Bagaimana metabolom dan protein berkaitan?"Berita, 26 Feb. 2019, boleh didapati di sini.
2. Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. Teknologi "Kajian SAC 'Omic': Genomik, Transkrip, Proteomik dan Metabolomik."Obstetrik dan Ginekologi, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 Julai 2011, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Proteomik" oleh XXL7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - dipindahkan dari EN.Wikibooks ke Commons. (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Skema Metabolomik" oleh LMAPS (Talk) - Saya mencipta karya ini sepenuhnya oleh diri saya sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia