Perbezaan antara ligase DNA T4 dan T7

Perbezaan utama - ligase DNA T4 vs T7

Ligase DNA adalah enzim penting yang digunakan dalam teknik biologi molekul. Ia berfungsi sebagai gam molekul untuk menyertai nukleotida dengan membentuk ikatan fosfodiester antara nukleotida. Ikatan fosfodiester dibentuk di antara 3 'hidroksil akhir gula dan kumpulan fosfat akhir 5'. Ligase DNA sangat penting dalam proses replikasi untuk menyertai serpihan Okazaki dari helai yang ketinggalan dan semasa mekanisme pembaikan DNA dan in vitro Eksperimen pengklonan untuk menyertai gen yang dikehendaki untuk genom vektor. Terdapat dua ligase DNA utama yang digunakan pada masa ini oleh ahli biologi molekul: ligase DNA T4 dan T7. Ligase DNA T4 adalah salah satu enzim pertama yang diasingkan dari bacteriophage T4. Ligase DNA T7, yang merupakan protein yang lebih kecil, adalah enzim yang diasingkan dari bacteriophage T7. Ini adalah perbezaan utama antara ligase DNA T4 dan T7.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah tindakan ligase DNA
3. Apakah ligase DNA T4
4. Apakah ligase DNA T7
4. Persamaan antara ligase DNA T4 dan T7
5. Perbandingan sampingan - ligase DNA T4 vs T7 dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apakah tindakan ligase DNA?

Ligation DNA berlaku dalam reaksi tiga langkah. Langkah pertama adalah serangan nukleofilik pada alpha-fosforus ATP yang menghasilkan enzim-adenilat kovalen pertengahan di mana amp dikaitkan dengan nitrogen rantaian sampingan terminal lysine. Dalam langkah kedua, serangan nukleofilik berlaku pada fosforus enzim-adenilat oleh substrat DNA yang ditamatkan 5'-fosfat, melepaskan lysine dan membentuk DNA-adenilat. Dalam langkah terakhir, DNA-adenylate diserang oleh 3'- OH dari satu lagi helai DNA, melepaskan amp dan menyertai polynucleotides.

Apakah ligase DNA T4?

T4 Ligase adalah ligase pertama yang diasingkan dan dikenal pasti oleh Meselson, Weigle, dan Kellenberger dan merupakan ligase komersial yang pertama dihasilkan. T4 DNA ligase adalah enzim bergantung ATP yang memangkinkan pembentukan ikatan fosfodiester. Ia adalah rantai polipeptida tunggal dengan 487 residu asid amino dan mempunyai berat molekul kira -kira 77 kDa. PH optimum untuk aktivitinya terletak pada julat 7.5 - 8.

Rajah 01: ligase DNA T4

Ligase DNA T4, seperti namanya, terdapat dalam bacteriophage T4 dan diasingkan apabila phage menghasilkan enzim apabila jangkitan dengan -E. coli. Enzim ini menyusu dupleks DNA terkandas berganda dengan hujung tumpul dan serpihan yang terikat harus berdekatan antara satu sama lain.

Apakah ligase DNA T7?

Ligase T7 adalah protein 41 kDa yang dihasilkan oleh bacteriophage T7 dan diasingkan dengan menjangkiti E. coli sel. Fungsi utama ligase T7 adalah untuk mengikat dupleks DNA melalui hubungan phosphodiester dan menyertai serpihan berdekatan DNA semasa eksperimen pengklonan. PH optimum untuk ligase DNA T7 terletak pada julat 7.0 - 7.2. Ligase T7 bergantung kepada ATP. Ligase DNA T7 juga mampu menyiapkan DNA dan hibrid RNA, yang menimbulkan konformasi yang tidak normal semasa transkripsi; Walau bagaimanapun, fenomena ini masih dalam penyelidikan oleh in vitro Kajian.

Apakah persamaan antara ligase DNA T4 dan T7?

Ligase DNA T4 dan T7 mengambil bahagian dalam tindak balas ligation dengan mengait dupleks DNA melalui pembentukan ikatan fosfodiester antara 3 'OH akhir dan 5 fosfat akhir fragmen DNA.
Kedua -dua enzim ligate tumpul mengakhiri dupleks DNA yang berdekatan antara satu sama lain.
Kedua -dua enzim itu bergantung kepada ATP.
Enzim ini diasingkan dengan menjangkiti E. coli sel dengan bacteriophage tertentu.
Aplikasi kedua -dua enzim termasuk:
- Pengklonan Molekul - Untuk mengikat gen yang menarik kepada vektor
- Pembaikan DNA - untuk membaiki niche terkandas berganda
- Replikasi DNA in vitro
- Reaksi rantai ligase

Apakah perbezaan antara ligase DNA T4 dan T7?

Ligase DNA T4 vs T7
T4 DNA Ligase Jenis ligase DNA yang diasingkan dari bacteriophage T4 dan terlibat dalam menyebarkan serpihan DNA bersebelahan melalui pembentukan ikatan phosphodiester.	Jenis ligase DNA T7 ligase DNA yang diasingkan dari bacteriophage T7 dan terlibat dalam ligasi serpihan DNA bersebelahan melalui pembentukan ikatan fosfodiester.
Saiz protein
Saiz ligase DNA T4 adalah 77 kDa - lebih besar berbanding dengan ligase T7 DNA.	Saiz ligase DNA T7 ialah 41 kDa.
PH optimum
julat pH yang berfungsi ligase DNA T4 ialah 7.5 - 8.0.	julat pH yang berfungsi ligase DNA T7 ialah 7.0 - 7.2.

Ringkasan -ligase DNA T4 vs T7

Ligase DNA adalah kelas enzim penting yang terlibat dalam pengklonan molekul untuk menghasilkan molekul DNA rekombinan yang mengandungi gen yang menarik. Reaksi ligation adalah tenaga yang menggunakan reaksi dan terdapat kajian penyelidikan novel yang dijalankan untuk meningkatkan ketepatan melalui modulasi ligase yang ada. Ligase DNA T4 dan T7 adalah dua jenis enzim ligase DNA penting yang digunakan dalam teknik biologi molekul. Ligase DNA T7 juga merupakan hasil penyelidikan yang berdasarkan ligase utama yang diasingkan dari T4 yang dijangkiti E. coli. T7 digambarkan lebih banyak kecekapan dan ketepatan dalam menjalankan fungsinya kerana saiznya yang lebih kecil. Ini adalah perbezaan antara ligase T4 dan T7.

Muat turun versi pdf T4 vs T7 DNA ligase

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian mengikut nota petikan. Sila muat turun versi pdf di sini perbezaan antara ligase T4 dan T7.

Rujukan:

1. "Ligase DNA, T4."DNA Ligase, T4 - Manual Enzim Worthington, tersedia di sini. Diakses pada 22 Ogos. 2017.
2. Doherty, Aidan J., et al. "Bacteriophage T7 DNA ligase overexpression, pemurnian, penghabluran, dan pencirian."Jurnal Kimia Biologi, 10 Mei 1996, boleh didapati di sini. Diakses pada 22 Ogos. 2017.