Perbezaan antara synteny dan kollinearity

The Perbezaan utama antara synteny dan kollinearity adalah bahawa Synteny adalah penyetempatan fizikal loci genetik pada kromosom yang sama dalam spesies, manakala kollinearity adalah penyetempatan fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza yang memelihara urutan yang sama.

Synteny dan Collinearity adalah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Kedua -dua istilah menggambarkan corak penyetempatan gen pada kromosom dalam spesies yang berbeza. Pengaturan gen yang berkaitan di antara taksiran adalah maklumat yang berharga apabila menyimpulkan keturunan gen yang dikongsi bersama. Synteny merujuk kepada penyetempatan fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies. Collinearity merujuk kepada penyetempatan fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza yang memelihara urutan yang sama. Oleh itu, ia adalah satu bentuk sintetik.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Synteny 
3. Apa itu kollinear
4. Persamaan antara synteny dan collinearity
5. Perbandingan sampingan - Synteny vs collinearity dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu Synteny?

Dalam spesies yang berbeza, terdapat satu set gen yang terletak pada kromosom yang sama. Dan, penyetempatan fizikal gen ini pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza dikenali sebagai sintetik. Juga, gen ini didapati sangat dekat antara satu sama lain pada satu kromosom. Susunan gen mungkin tidak semestinya sama. Tetapi, penyetempatan gen berhampiran satu sama lain pada kromosom yang sama berlaku di sintetik. Oleh itu, sintetik terutamanya menggambarkan corak pengedaran gen pada kromosom. Corak-corak penyetempatan gen ini menunjukkan hubungan antara spesies yang berbeza dan evolusi mereka. Walau bagaimanapun, sintetik boleh terganggu kerana penyusunan semula kromosom seperti translocations, penyongsangan dan gabungan kromosom, dan lain -lain. duplikasi, kerugian dan penggabungan homolog yang tidak sama rata.

Rajah 01: Synteny

Dipercayai bahawa semua gen yang dipautkan adalah syntenic. Walau bagaimanapun, tidak semua gen syntenik semestinya dikaitkan. Mereka mempunyai urutan kromosom biasa. Manusia mempunyai banyak gen sintenik dengan mamalia lain. Selain itu, banyak bijirin mempunyai gen sintenik.

Apa itu kollinear?

Collinearity adalah bentuk sintetik yang lebih spesifik di mana satu set gen terletak pada kromosom yang sama spesies yang berbeza dalam urutan yang sama seperti dalam spesies nenek moyang. Oleh itu, jika terdapat sisihan dari kollinearity, ia akan menjadi watak filogenetik yang lebih dipercayai kerana kollinearity menerangkan keturunan gen yang dikongsi bersama.

Rajah 02: kollinearity

Analisis Collinearity Multiway memberikan maklumat yang lebih dipercayai mengenai spesies yang berkaitan dan phylogeny mereka.

Apakah persamaan antara synteny dan kollinearity?

• Dalam kedua -dua synteny dan collinearity, satu set loci dalam dua spesies yang berbeza terletak pada kromosom yang sama.
• Istilah ini menggambarkan penyetempatan fizikal loci genetik pada kromosom yang sama.
• Collinearity adalah bentuk sintetik yang lebih spesifik.
• Kadang -kadang kedua -dua istilah digunakan secara bergantian dalam genomik.
• Sekiranya dua wilayah mempunyai keruntuhan, mereka jelas sintetik.
• Mereka berguna dalam menyimpulkan filogeni.

Apakah perbezaan antara synteny dan collinearity?

Synteny dan Collinearity adalah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Synteny merujuk kepada penyetempatan fizikal satu set gen dalam kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Collinearity adalah satu bentuk sintetik di mana set gen disusun bersama dalam urutan yang sama di antara spesies yang berbeza. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara synteny dan collinearity.

Ringkasan -Synteny vs collinearity

Istilah synteny dan collinearity merujuk kepada satu set gen yang terletak pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Malah, gen ini diselaraskan bersama dalam kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Synteny menerangkan penyetempatan fizikal gen set pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza, manakala kollinearity adalah bentuk sintetik yang lebih spesifik di mana set gen disusun bersama dalam urutan yang sama. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara synteny dan collinearity.

Rujukan:

1. "Synteny". En.Wikipedia.Org, 2020, boleh didapati di sini.
2. "Genomik dan genomik perbandingan". IntegratedBreeding.Bersih, 2020, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Synteny Mouse Manusia" oleh Sinha Au, Meller J. - BMC Bioinformatics. 2007 8 Mac; 8: 82 [PMID: 17343765] (CC oleh 2.0) melalui sscommons wikimedia