Perbezaan antara serine dan tyrosine recombinase

The Perbezaan utama Antara serine dan tyrosine recombinase ialah dalam Serine recombinase, serine adalah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan khusus tapak, Semasa dalam rekombinase tyrosine, tirosin adalah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa rekombinasi khusus tapak.

Rekombinasi khusus tapak (rekombinasi khusus tapak konservatif) adalah sejenis teknik rekombinasi genetik di mana pertukaran helai DNA berlaku antara segmen yang mempunyai tahap homologi tertentu. Rekombinasis khusus tapak mengawal proses rekombinasi khusus tapak. Enzim -enzim ini dikelompokkan kepada dua keluarga sebagai keluarga serine rekombinase dan keluarga rekombinase tyrosine. Nama-nama itu berasal dari residu asid amino nukleofilik yang dipelihara di atas dua kelas rekombinase yang digunakan untuk menyerang DNA dan yang menjadi kovalen dikaitkan dengannya semasa pertukaran helai di tapak rekombinasi khusus tapak.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah rekombinase serine
3. Apakah rekombinase tirosin
4. Persamaan antara serine dan tyrosine recombinase
5. Perbandingan sampingan - serine vs tyrosine recombinase dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apakah rekombinase serine?

Dalam kaedah rekombinasi khusus tapak, dua urutan DNA pendek ('tapak sasaran') dipotong pada titik tertentu di kedua-dua helai, dan hujungnya disambung semula kepada rakan kongsi baru. Teknologi rekombinasi khusus tapak adalah alat genomik dalam kejuruteraan genetik yang bergantung kepada enzim rekombinase untuk menggantikan bahagian sasaran DNA. Banyak sistem rekombinasi khusus tapak telah dijumpai untuk melaksanakan penyusunan semula DNA ini untuk tujuan yang berbeza. Tetapi semua enzim rekombinase ini tergolong dalam dua keluarga. Serine Recombinase adalah salah satu daripada mereka. Mereka boleh menengahi sehingga tiga jenis penyusunan semula DNA: integrasi, pengasingan dan penyongsangan.

Rajah 01: Serine recombinase

Rekombinase khusus tapak seperti serine recombinase melakukan penyusunan semula DNA dengan mengiktiraf dan mengikat urutan DNA pendek (tapak sasaran), di mana mereka memecah tulang belakang DNA. Kemudian, pertukaran dua helai DNA berlaku dan bergabung dengan helai DNA berlaku. Dalam serine recombinase, serine adalah asid amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa rekombinasi khusus tapak. Semasa belahan DNA, ikatan protein-DNA dibentuk melalui tindak balas transesterifikasi. Ikatan fosfodiester digantikan oleh ikatan fosfoserin antara kumpulan 5'phosphate di tapak belahan dan kumpulan hidroksil residu serine yang dipelihara. Bond baru menyimpan tenaga yang dibelanjakan dalam DNA yang terletak di tapak sasaran. Tenaga ini kemudiannya digunakan untuk menyertai semula DNA ke kumpulan hidroksil deoxyribose yang sepadan di laman web lain. Contoh rekombinase serina adalah resolvas serina/invertases dan integrasi serina.

Apakah rekombinase tirosin?

Tyrosine Recombinase adalah kelas enzim lain yang mengawal rekombinasi khusus tapak konservatif. Seperti yang diterangkan sebelum ini, rekombinase tyrosine juga menjalankan penyusunan semula DNA dengan cara yang sama dengan mengiktiraf dan mengikat ke urutan DNA pendek (tapak sasaran), di mana mereka mengepung tulang belakang DNA. Kemudian, bertukar -tukar dua helai DNA dan menyertai semula helai DNA berlaku.

Rajah 02: rekombinase tyrosine

Tetapi dalam rekombinase tyrosine, tirosin adalah asid amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa rekombinasi khusus tapak. Ciri umum kelas ini adalah residu tirosin nukleofilik yang diserang menyerang DNA-fosfat scassil untuk membentuk hubungan 3'-phosphotyrosine. Rekombinase tyrosine (A1) dan integrase tirosin (A2) adalah kumpulan enzim yang menonjol dalam keluarga enzim rekombinase tyrosine.

Apakah persamaan antara serine dan tyrosine recombinase?

• Mereka adalah kelas enzim rekombinase.
• Kedua-duanya mengawal semula rekombinasi khusus tapak.
• Mereka adalah protein.
• Tindak balas kimia asas adalah sama untuk kedua -duanya.
• Kedua -duanya memangkinkan tindak balas transesterifikasi.

Apakah perbezaan antara serine dan tyrosine recombinase?

Dalam rekombinase serine, serine adalah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan khusus tapak. Sebaliknya, dalam rekombinase tyrosine, tirosin adalah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa rekombinasi khusus tapak. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara serine dan tyrosine recombinase. Ciri umum serine recombinase adalah bahawa ia membentuk ikatan fosfoserin dengan DNA, manakala rekombinase tyrosine membentuk ikatan fosfotyrosin dengan DNA semasa proses rekombinasi khusus tapak.

Infographic di bawah menyenaraikan perbezaan antara serine dan tyrosine recombinase dalam bentuk jadual.

Ringkasan -Serine vs Tyrosine Recombinase

Rekombinasi boleh berlaku antara molekul DNA yang serupa seperti dalam rekombinasi homolog atau molekul yang berbeza seperti dalam rekombinasi bukan homologi. Rekombinasi khusus tapak adalah sejenis penggabungan genetik di mana pertukaran helai DNA berlaku antara segmen yang mempunyai sekurang-kurangnya tahap homologi urutan tertentu. Ia dikatalisasi oleh rekombinase. Kebanyakan rekombinase dikelompokkan kepada dua keluarga: serine recombinase dan tyrosine recombinase. Serine Recombinase menggunakan serine sebagai asid amino nukleofilik untuk menyerang DNA semasa proses penggabungan khusus tapak. Tyrosine Recombinase menggunakan tirosin sebagai asid amino nukleofilik untuk menyerang DNA semasa proses rekombinasi khusus tapak. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara serine dan tyrosine recombinase.

Rujukan:

1. "Penggabungan khusus tapak."Wikipedia, Yayasan Wikimedia, 30 Dis. 2020, boleh didapati di sini.
2. Grindley, Nigel D.F. "Mekanisme penggabungan khusus tapak."Ulasan tahunan, tersedia di sini.

Ihsan gambar:

1. "Surot" oleh Juergen Bode - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia

2. "STSWAP" oleh Juergen Bode - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia