Metabolit adalah molekul kecil yang terlibat dalam tindak balas metabolik dalam sel. Metabolit termasuk perantara metabolik, hormon, metabolit sekunder, molekul isyarat, dan lain -lain. Mereka adalah molekul berfungsi tindak balas biokimia sel. Satu set lengkap metabolit sampel biologi atau satu organisma dikenali sebagai metabolom. Metabolome adalah koleksi dinamik yang berubah setiap saat dalam badan. Metabolomik dan metabonomi adalah dua istilah yang berkaitan dengan kajian metabolom organisma. Perbezaan utama antara metabolomik dan metabonomi ialah Metabolomik lebih prihatin terhadap metabolisme endogen biasa dan profil metabolik di peringkat selular atau organ manakala Metabonomik lebih prihatin dengan memperluas profil metabolik dengan maklumat gangguan metabolisme akibat faktor persekitaran, penyakit, mikroorganisma usus dan membandingkan profil metabolik, dan lain -lain. Metabolomik terutamanya didorong oleh spektrometri massa, dan metabonomik menggunakan spektroskopi NMR untuk analisis metabolit.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah metabolomik
3. Apakah metabonomik
4. Perbandingan sampingan - Metabolomik vs Metabonomik
5. Ringkasan
Metabolomik adalah kajian proses metabolik yang berlaku dalam sel, biofluid, tisu atau organisma. Ia termasuk pengenalan dan kuantifikasi metabolit selular menggunakan alat analitik dan statistik yang baik. Metabolomik dianggap sebagai kajian penting kerana ia mendedahkan maklumat mengenai metabolisme organisma.
Untuk mengkaji substrat dan produk tindak balas metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis. Spektrometri massa mendedahkan jenis metabolit dan kepekatan mereka, mencerminkan keadaan biokimia sebenar sel atau tisu. Oleh itu, metabolomik boleh dianggap sebagai wakil terbaik fenotip molekul organisma. Metabolomik adalah teknologi OMIC molekul kecil organisma dan dibandingkan dengan kajian OMIC yang lain; Metabolomik sangat penting kerana ia secara langsung mencerminkan status semasa tindak balas biokimia sel.
Metabolomik juga boleh dianggap sebagai lanjutan proteomik kerana ia dihasilkan kerana aktiviti enzim yang protein seperti yang ditunjukkan dalam angka berikut.
Rajah 01: Skim Metabolomik
Metabonomik ditakrifkan sebagai pengukuran kuantitatif tindak balas metabolik multiparametrik pada masa tertentu berhubung dengan tekanan patofisiologi atau pengubahsuaian genetik. Ini biasanya digunakan untuk kajian yang dijalankan mengenai pemakanan manusia dan tindak balas terhadap ubat atau penyakit. Pendekatan ini dipelopori oleh Jeremy Nicholson di Imperial College, London dan ia telah digunakan dalam beberapa bidang termasuk toksikologi, diagnosis penyakit, pemakanan, dan lain -lain. Dari segi sejarah, metabonomik adalah salah satu kaedah pertama untuk menggunakan skop sistem biologi untuk kajian metabolisme.
Metabonomik lebih prihatin untuk membandingkan profil biokimia daripada mengenal pasti sebatian metabolik individu dalam metabolomik. Oleh itu, metabonomi boleh ditakrifkan sebagai subset metabolomik. Ini terutamanya menekankan perbandingan profil metabolik populasi yang berbeza berkenaan dengan penyakit, tekanan alam sekitar, pengubahsuaian genetik, pemakanan, ubat, dll. Kerana metabolit adalah penanda yang baik yang menandakan keadaan penyakit, kesan ubat, tekanan alam sekitar, pendedahan kepada toksin, dll.
Kajian metabonomik mendedahkan kedua -dua metabolit intrasel dan ekstraselular. Ia menggunakan teknik throughput yang tinggi untuk menganalisis sejumlah besar metabolit secara serentak dan berulang kali, membolehkan penyiasatan temporal status fisiologi sel. Ia juga mendedahkan korelasi antara metabolit dan status patologi organisma. Untuk menyokong kajian metabonomik, genomik dan proteomik boleh digunakan kerana ia saling berkaitan seperti yang ditunjukkan dalam angka di atas.
Metabolomik vs metabonomik | |
Metabolomik adalah kajian set lengkap metabolit organisma | Metabonomik adalah kajian kuantitatif tindak balas metabolik multiparametrik sistem hidup secara temporal untuk rangsangan patofisiologi atau pengubahsuaian genetik. |
Kebimbangan utama | |
Metabolomik lebih prihatin dengan profil metabolik dan mengenal pasti metabolit individu yang terdapat di dalam sel. | Metabonomik lebih prihatin dengan membandingkan metabolit atau profil metabolik populasi berhubung dengan pengubahsuaian genetik, penyakit, tekanan alam sekitar, rangsangan patologi, dadah, dll. |
Maklumat | |
Metabolomik terutamanya tertumpu pada metabolisme endogen. | Metabonomik tidak terhad kepada metabolisme endogen. Ia meluas untuk mencari maklumat mengenai gangguan metabolisme yang disebabkan oleh faktor dalaman dan luaran seperti corak pemakanan, toksin, proses penyakit, dan lain -lain. |
Alat analisis | |
Ia menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis utama | Metabonomik menggunakan spektroskopi NMR sebagai platform analisis utama. |
Metabolome mewakili set lengkap molekul kecil yang dipanggil metabolit yang terdapat dalam sel atau dalam organisma. Metabolomik adalah kajian keseluruhan metabolom untuk menghasilkan profil metabolik. Metabolomik membolehkan saintis mengukur status fisiologi sebenar sel atau organisma. Metabonomik adalah sebahagian daripada metabolomik yang meluas untuk mengekstrak maklumat mengenai tindak balas metabolik multiparametrik sistem hidup kepada rangsangan patofisiologi dan pengubahsuaian genetik. Metabonomik bukan hanya prihatin dengan profil metabolik individu seperti metabolomik; Ia membandingkan profil metabolik berhubung dengan faktor lain seperti tekanan alam sekitar, penyakit, toksin, dll. Kedua -dua metabolomik dan metabonomi melibatkan kajian metabolit organisma untuk mengukur status fisiologi sebenar sel. Oleh itu, kadang -kadang kedua -duanya dianggap sebagai sinonim, tanpa mempertimbangkan perbezaan antara metabolomik dan metabonomik.
Rujukan:
1. Roessner, Ute, dan Jairus Bowne. "Apa itu metabolomik."Bioteknik - Apa itu Metabolomik? N.p., Apr. 2009. Web. 24 Apr. 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomik dan metabonomi."Springer. Springer London, 01 Jan. 1970. Web. 25 Apr. 2017
Ihsan gambar:
1. "Skema Metabolomik" oleh LMAPS (Talk) - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia