Perbezaan antara dntp dan ddntp

The Perbezaan utama antara dntp dan ddntp ialah dntp atau deoxyribonukleotida adalah blok bangunan DNA dan mempunyai 3-Oh kumpulan pada struktur gula pentose manakala ddntp atau dideoxynucleoside triphosphates adalah nukleotida yang kekurangan 3-Oh kumpulan dan mereka digunakan dalam teknik penjujukan DNA dideoxy sanger untuk menghasilkan urutan DNA panjang yang berbeza.

dntp dan ddntp adalah nukleotida. DNTP merujuk kepada nukleotida deoxyribose. Mereka adalah blok bangunan DNA. DNTPs digunakan untuk mensintesis DNA. DNTP, sebaliknya, merujuk kepada dideoxynucleoside triphosphates. Ia digunakan dalam penjujukan sanger untuk menamatkan sintesis DNA dengan panjang yang berbeza. Mereka kekurangan kumpulan oh pada kedudukan 3 ʹ. Hidrogen hadir pada kedudukan 3 ʹ bukan kumpulan oh. Oleh itu, DDNTPs tidak dapat membentuk ikatan fosfodiester dengan nukleotida seterusnya. DNTP mampu menjalankan sintesis DNA, sementara DDNTP mampu menamatkan pempolimeran DNA.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu dntp 
3. Apa itu DDNTP
4. Persamaan antara dntp dan ddntp
5. Perbandingan sampingan - dntp vs ddntp dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu dntp?

DNTP bermaksud deoxyribose nukleotida atau deoxyribonukleotida. Ia adalah blok bangunan DNA. Terdapat empat jenis dntps. Mereka adalah DATP, DTTP, DCTP dan DGTP. Mereka dinamakan mengikut pangkalan nitrogen Purine atau Pyrimidine: Adenine (A), Guanine (G), Thymine (T) dan Cytosine (C).

Rajah 01: dntp

Adenine dan guanine adalah asas purine manakala timin dan sitosin adalah pangkalan pyrimidine. Gula pentos dntp adalah deoxyribose. Terdapat juga kumpulan fosfat. Oleh itu, DNTP terdiri daripada tiga komponen: asas nitrogen, gula deoksiribose dan kumpulan fosfat. DNTP ini bergabung antara satu sama lain melalui ikatan phosphodiester. Di DNTPS, terdapat kumpulan OH yang dilampirkan pada kedudukan 3 ʹ gula pentosa yang diperlukan untuk membentuk pautan dengan kumpulan fosfat yang dilampirkan pada karbon 5 ʹ gula nukleotida seterusnya. Oleh kerana semua dntps mempunyai kumpulan 3 ʹ -OH ini, mereka mampu mensintesis dan memanjangkan helai DNA. Oleh itu, dntp bertindak sebagai unit pengulangan asas DNA dan bahan kimia gen. Sintesis DNA selalu berlangsung dari 5 hingga 3 ʹ.

Apa itu DDNTP?

Sanger Sequencing adalah kaedah penjujukan DNA generasi pertama yang dibangunkan oleh Frederick Sanger dan kolejnya pada tahun 1977. Ia juga dikenali sebagai penjujukan rantaian rantaian atau penjujukan dideoxy kerana prinsip asas kaedah ini adalah penamatan rantai menggunakan didexynucleoside triphosphates (DDNTPS). DDNTPs adalah nukleotida yang digunakan dalam penjujukan sanger. Penjujukan sanger didasarkan pada penggabungan selektif DDNTP dan penamatan sintesis DNA semasa in vitro Replikasi DNA. Keistimewaan DDNTPS adalah bahawa mereka kekurangan kumpulan 3 ʹ-oh pada gula pentosa untuk meneruskan pembentukan ikatan fosfodiester antara kumpulan fosfat 5 ʹ dalam nukleotida bersebelahan. Oleh itu, apabila DDNTP dilampirkan pada helai yang memanjangkan, pemanjangan rantai berhenti dan menamatkan dari titik itu. DDNTPs bertindak sebagai perencat rantaian rantaian polimerase DNA semasa kaedah penjujukan sanger.

Rajah 02: ddntp

Terdapat empat DDNTP: DDATP, DDCTP, DDGTP dan DDTTP yang digunakan dalam penjujukan Sanger. Nukleotida ini menghentikan proses replikasi DNA apabila mereka dimasukkan ke dalam helai DNA yang semakin meningkat. Akibatnya, penjujukan Sanger menghasilkan pelbagai panjang DNA pendek. Elektroforesis gel kapilari digunakan untuk mengatur helai DNA pendek ini dengan saiz mereka di gel. DDNTPS secara radioaktif atau dilabelkan dengan warna yang berbeza untuk memudahkan menganalisis urutan DNA. Dengan menganalisis gel, urutan nukleotida helai DNA yang tidak diketahui dapat ditentukan.

Apakah persamaan antara dntp dan ddntp?

• Kedua -dua DNTP dan DDNTP digunakan dalam penjujukan Sanger.
• Terdapat empat jenis dntps dan ddntps.
• Mereka terdiri daripada tiga komponen: asas nitrogen, gula deoksiribose dan kumpulan fosfat.

Apakah perbezaan antara dntp dan ddntp?

DNTP adalah salah satu daripada empat jenis deoxyribonukleotida yang membina blok DNA. DDNTP adalah salah satu daripada empat jenis triphosphat dideoxyribonucleoside yang digunakan dalam teknik penjujukan sanger. DNTP mempunyai kumpulan 3 ʹ-oh pada gula pentosa manakala DDNTP tidak mempunyai kumpulan 3 ʹ-oh pada gula pentosa. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara dntp dan ddntp. Selain itu, DNTP menjalankan pempolimeran DNA sementara DDNTPs menamatkan pempolimeran DNA. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan utama antara dntp dan ddntp.

Infographic di bawah menyenaraikan perbezaan antara DNTP dan DDNTP dalam bentuk jadual.

Ringkasan -dntp vs ddntp

DNTP biasa membina blok DNA manakala DDNTPs adalah nukleotida yang digunakan dalam teknik penjujukan sanger. dntp mempunyai 3 ʹ-oh manakala ddntp tidak mempunyai 3 ʹ-oh. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara dntp dan ddntp. Selain itu, DNTP boleh mensintesis helai DNA manakala DDNTP dapat menamatkan pempolimeran DNA. Oleh itu, DDNTPs digunakan dalam penjujukan sanger untuk menghasilkan helai DNA yang berbeza dengan pelbagai panjang. Semasa penjujukan Sanger, kedua -dua DNTP dan DDNTP disertakan.

Rujukan:

1. "Dideoxynucleotide."Wikipedia, Yayasan Wikimedia, 12 Julai 2020, boleh didapati di sini.
2. "Struktur dan fungsi DNA."Lumen, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Desoxyribonucleotides" par Bionet - Personel Travail (CC0) melalui Wikimedia Commons

2. "Penamatan dideooksi pemanjangan DNA en" oleh Michał Sobkowski - Kerja Sendiri (CC oleh 3.0) melalui Commons Wikimedia