Perbezaan antara konsensus PCR dan Pan PCR

The Perbezaan utama Antara konsensus PCR dan Pan PCR ialah PCR konsensus selalu menargetkan kawasan yang dipelihara manakala Pan PCR mensasarkan kawasan berubah -ubah untuk mengenal pasti strain yang berbeza dari kumpulan

Reaksi rantai polimerase (PCR) adalah teknik penguatan gen yang terdiri daripada tiga langkah utama sebagai denaturasi, penyepuhlindapan dan lanjutan. Ini digunakan secara meluas dalam diagnostik dan pengenalan molekul. Teknik PCR dan Pan PCR konsensus berdasarkan sasaran primer yang digunakan setiap jenis PCR.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu PCR konsensus 
3. Apa itu Pan PCR
4. Persamaan antara konsensus PCR dan Pan PCR
5. Perbandingan sampingan - konsensus PCR vs pan PCR dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu PCR konsensus?

PCR Konsensus adalah teknik PCR yang mensasarkan rantau yang dipelihara untuk spesies atau genera tertentu. Oleh itu, kawasan yang sangat konservasi dipilih untuk penguatan. Melalui kaedah ini, organisma dapat dikenal pasti dan dibezakan berdasarkan konsensus mereka. Kaedah ini mengenal pasti rantau yang dipelihara untuk spesies tertentu. Sebagai contoh, rantau bakteria rRNA 16S kekal sebagai kawasan yang dipelihara di kalangan bakteria. Oleh itu, hanya satu set primer diperlukan untuk penguatan. Dalam kebanyakan keadaan, spesifik primer sejagat boleh digunakan untuk rantau yang dipelihara.

Rajah 01: Teknik PCR

Dengan mengikuti kaedah PCR konsensus, pencirian spesies dan hubungan evolusi dapat disimpulkan. Berdasarkan kecekapan penguatan organisma sampel tertentu, konsensus organisma ke arah kumpulan juga dapat disimpulkan. Selanjutnya, menjalankan konsensus PCR adalah penting dalam kajian filogenetik. Ia membolehkan pengenalpastian spesies dan menafsirkan sisihan organisma tertentu yang ditunjukkan dari segi nenek moyang yang sama.

Apa itu Pan PCR?

Pan PCR adalah mod multiplexing PCR. Dalam teknik ini, strain yang berbeza dikuatkan menggunakan pelbagai sasaran primer. Walau bagaimanapun, sasarannya boleh menjadi sasaran umum untuk kumpulan terikan. Oleh itu, di Pan PCR, lebih daripada dua set primer boleh digunakan pada satu masa. Ia boleh berlaku dalam satu kaedah tindak balas tiub atau sebagai kaedah tindak balas pelbagai tiub. Pan PCR lebih banyak memakan masa dan lebih kompleks berbanding dengan PCR konsensus. Oleh sebab ini, tafsiran keputusan PCR juga mungkin lebih kompleks dalam Pan PCR.

Aplikasi utama Pan PCR adalah dalam diagnostik molekul. Ia membolehkan membezakan antara jenis spesies yang berlainan dengan sasaran amplifikasi. Pan PCR adalah teknik yang ideal untuk mengenal pasti pelbagai jenis spesies tunggal yang menyebabkan penyakit. Dalam kebanyakan keadaan, automasi teknik Pan PCR untuk pelbagai keadaan kesihatan sangat penting dan teknik yang boleh dipercayai dan sangat berkesan.

Apakah persamaan antara konsensus PCR dan Pan PCR?

• Konsensus PCR dan Pan PCR adalah dua jenis teknik PCR.
• Kedua -dua prosedur mengikuti prosedur tiga langkah umum - denaturasi, penyepuhlindapan dan lanjutan.
• Mereka menggunakan primer yang sasaran khusus.
• Kedua -dua reaksi berlaku dalam penumpang haba.
• Reaksi ini boleh automatik.
• Kedua -duanya boleh digunakan dalam diagnostik molekul dan pengenalan; Walau bagaimanapun, ketepatannya berbeza -beza.
• Prosedur ini memerlukan pengesahan.

Apakah perbezaan antara konsensus PCR dan Pan PCR?

Kedua -dua konsensus dan Pan PCR mengikuti prosedur rutin yang sama. Walau bagaimanapun, perbezaan utama antara konsensus PCR dan Pan PCR berdasarkan sasaran primer setiap prosedur menggunakan. Walaupun PCR konsensus selalu menarget. Oleh kerana perbezaan ini, protokol reka bentuk primer, bilangan set primer yang digunakan, dan aplikasi tertentu berbeza -beza.

Infographic di bawah meringkaskan perbezaan antara konsensus PCR dan Pan PCR.

Ringkasan -Konsensus PCR vs Pan PCR

PCR, yang diperkenalkan oleh Mulli, memainkan peranan revolusi penting dalam aplikasi biologi molekul. Konsensus dan Pan PCR adalah dua jenis PCR berdasarkan kawasan sasaran primer mereka. Walaupun konsensus PCR mensasarkan kawasan yang dipelihara, Pan PCR mensasarkan kawasan berubah -ubah dan memainkan peranan penting dalam pengenalan ketegangan. Oleh kerana perbezaan asas ini antara PCR konsensus dan PAN PCR, fungsi spesifik setiap jenis PCR juga berbeza dari analisis filogenetik kepada pencirian molekul kepada diagnostik molekul.

Rujukan:

1. Merkelbach-Bruse, S, et al. "Reaksi rantai polimerase konsensus dan ujian imunosorben yang berkaitan dengan enzim untuk pengesanan papillomavirus manusia dan menaip spesimen serviks."Patologi Molekul Diagnostik: Jurnal Amerika Patologi Pembedahan, Bahagian B, U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, Mar. 1999, boleh didapati di sini.
2. Yang, Joy Y, et al. "Pan-PCR, kaedah pengiraan untuk mereka bentuk ujian bakterium-menaip berdasarkan data urutan genom keseluruhan."Jurnal Mikrobiologi Klinikal, Persatuan Amerika untuk Mikrobiologi, Mar. 2013, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Reaksi rantai polimerase" oleh Enzoklop - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia