Perbezaan antara perpustakaan cDNA dan genomik

Perbezaan utama - CDNA vs Perpustakaan Genomik
 

Terdapat dua jenis utama perpustakaan DNA yang dibina oleh saintis menggunakan teknik kejuruteraan genetik. Itu adalah perpustakaan cDNA dan perpustakaan genomik. The Perbezaan utama Antara cDNA dan perpustakaan genomik ialah Perpustakaan cDNA mengandungi DNA pelengkap yang diklonkan jumlah mRNA organisma manakala perpustakaan DNA genomik mengandungi serpihan klon seluruh genom organisma. Perpustakaan DNA Genomik lebih besar daripada perpustakaan cDNA.

Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Perpustakaan CDNA
3. Apa itu Perpustakaan Genomik
4. Perbandingan sampingan - CDNA vs Perpustakaan Genomik
5. Ringkasan

Apa itu perpustakaan genomik?

Perpustakaan DNA Genomik adalah koleksi klon yang mengandungi serpihan jumlah DNA genomik organisma. Ia mengandungi seluruh DNA genomik organisma itu, termasuk urutan pengekodan dan bukan pengekodan. Pembinaan perpustakaan genomik dilakukan oleh teknologi DNA rekombinan diikuti dengan pengklonan (kejuruteraan genetik). Terdapat pelbagai langkah yang terlibat dalam pembinaan seperti yang ditunjukkan dalam Rajah 01. Proses bermula dengan pengasingan DNA genomik. Menggunakan protokol pengekstrakan DNA yang sesuai, jumlah DNA genomik organisma harus diasingkan. Kemudian DNA harus ditukar ke dalam saiz yang boleh diurus atau ke dalam serpihan tertentu oleh endonucleases sekatan (enzim pemotongan DNA). DNA berpecah harus dimasukkan ke dalam vektor menggunakan ligase DNA (DNA menyertai enzim). Vektor adalah organisma mereplikasi diri. Plasmid dan bacteriophages biasanya digunakan vektor dalam teknologi DNA rekombinan. Vektor bersuara ini dikenali sebagai molekul DNA rekombinan kerana mereka membawa urutan DNA sendiri dan dimasukkan. Vektor rekombinan ditambah kepada bakteria tuan rumah dan dibuat untuk pengambilan vektor rekombinan di dalam sel bakteria. Bakteria dengan vektor rekombinan (plasmid) harus ditanam dalam medium budaya. Semasa pendaraban bakteria, DNA bakteria, bersama -sama dengan plasmid rekombinan, meniru genom mereka dan menghasilkan klon. Klon ini mengandungi seluruh genom organisma sumber. Oleh itu, ia dipanggil perpustakaan genomik. Plasmid boleh dipisahkan dengan mudah dari DNA kromosom bakteria untuk membina perpustakaan genomik organisma itu. Sekiranya organisma tertentu mengandungi gen yang berminat, mudah untuk mengesannya di perpustakaan genom dengan hibridisasi menggunakan probe molekul (penanda).

Perpustakaan genomik penting untuk mengkaji struktur dan fungsi genomik, gen tertentu, lokasi gen, pemetaan gen, mutasi, penjujukan gen, pengenalpastian gen terapeutik novel dan lain -lain.

Rajah_1: Pembinaan perpustakaan genomik

Apa itu perpustakaan cDNA?

Perpustakaan cDNA adalah koleksi klon DNA pelengkap (cDNA) yang disintesis dari jumlah mRNA organisma. Prosedur pembinaan melibatkan langkah yang berbeza. Penyucian Jumlah mRNA dari organisma adalah langkah pertama yang terlibat. MRNA terpencil diubah menjadi helai cDNA dengan proses yang disebut transkripsi terbalik. Transkripsi terbalik difasilitasi oleh enzim yang disebut transkripase terbalik. Ia menggunakan primer 3 'kecil dan memulakan sintesis pelengkap cDNA pertama untuk template mRNA Strand. Hasil cDNA terkandas berganda diubah menjadi serpihan yang lebih kecil menggunakan endonucleases sekatan dan dimasukkan ke dalam vektor yang sesuai. Molekul rekombinan yang dibina ini kemudiannya dimasukkan ke dalam organisma tuan rumah dan ditanam dalam medium budaya untuk menghasilkan klon. Koleksi klon yang mengandungi serpihan cDNA organisma dikenali sebagai perpustakaan cDNA. MRNA matang yang dihiris sepenuhnya tidak mengandungi kawasan intron dan pengawalseliaan. Oleh itu serpihan bukan pengekodan tidak terdapat di perpustakaan cDNA tidak seperti di perpustakaan genomik.

Perpustakaan cDNA adalah penting untuk analisis kawasan pengekodan, fungsi gen, ekspresi gen dll.

Rajah_2: Pembinaan perpustakaan cDNA

Apakah perbezaan antara perpustakaan cDNA dan genomik?

Ringkasan - Perpustakaan CDNA dan Genomik

Perpustakaan Genomik mewakili populasi klon yang mengandungi DNA genomik yang berpecah -belah dari organisma. Perpustakaan cDNA mewakili populasi klon yang mengandungi DNA pelengkap dari jumlah mRNA organisma. Klon cDNA hanya mengandungi urutan yang terdapat dalam mRNA manakala klon genomik mengandungi urutan keseluruhan genom. Inilah perbezaan antara perpustakaan cDNA dan genomik.

Rujukan:
1. Haneef, Deena T Kochunnijazir. "Perbezaan antara perpustakaan genomik dan cDNA."Perbezaan antara perpustakaan genomik dan cDNA. N.p., n.d. Web. 15 Feb. 2017
2. Stekel, Dov J., Yoav git, dan Francesco Falciani. "Perbandingan ekspresi gen dari pelbagai perpustakaan cDNA."Penyelidikan Genom. Cold Spring Harbour Laboratory Press, dec. 2000. Web. 16 Feb. 2017
3. "Skrin Perpustakaan Genomik untuk Gen yang Terlibat dalam Toleransi N-Butanol di Escherichia Coli."Skrin Perpustakaan Genomik untuk Gen yang Terlibat dalam Toleransi N-Butanol di Escherichia Coli. N.p., n.d. Web. 16 Feb. 2017

Ihsan gambar:
1. "Pembentukan Perpustakaan CDNA" oleh PhD Dre di bahasa Inggeris Wikipedia (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Pembinaan Perpustakaan Genomik" oleh Aluquette - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia