Perbezaan antara genotip dan penjujukan
Perbezaan Utama - Genotyping vs Sequencing
Genotyping dan urutan adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan maklumat mengenai asid nukleik, terutamanya DNA organisma. Perbezaan utama antara genotip dan penjujukan ialah Genotyping adalah proses menentukan variasi genetik yang dimiliki oleh individu menggunakan penanda semasa penjujukan adalah penentuan urutan yang betul dari urutan nukleotida dalam serpihan yang diberikan DNA.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu genotip
3. Apa itu penjujukan
4. Perbandingan sampingan - Genotyping vs Sequencing
5. Ringkasan
Apa itu genotip?
Genotyping adalah penentuan solek genetik individu menggunakan urutan DNA dan penanda dan perbandingan dan pengenalpastian warisannya. Genotyping penting dalam biologi evolusi, biologi penduduk, taksonomi, ekologi, dan genetik organisma. Ia boleh dilakukan dengan teknik yang berbeza termasuk penjujukan DNA, tindak balas rantai polimerase, polimorfisme panjang serpihan sekatan (RFLP), pengesanan polimorfik yang diperkuat secara rawak, polimorfisme panjang serpihan yang diperkuatkan (AFLP), microarrays DNA, dan lain -lain.
Genotyping melibatkan penjujukan serpihan kecil tertentu urutan DNA dan penemuan keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain menggunakan penanda genetik. Ia menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di kalangan individu atau alel tertentu. Genotyping boleh digunakan untuk pelbagai organisma termasuk manusia. Ia juga boleh digunakan untuk mikroorganisma seperti virus, kulat dll. dan boleh digunakan untuk menentukan varian genetik mereka dengan profil rujukan. Dalam epidemiologi molekul dan mikrobiologi forensik, mengawal patogen, terutamanya mikroorganisma, dilakukan oleh maklumat yang diperolehi daripada genotip. Genotyping sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotip untuk mengesahkan keibuan dan ayah. Genotip akan mendedahkan alel gen yang dominan dan resesif yang menentukan ciri -ciri tertentu.
Rajah_1: Genotyping RFLP
Apa itu penjujukan?
Penjujukan adalah proses menentukan susunan nukleotida yang betul dalam serpihan DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua maklumat yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisma dikodkan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan beberapa ratus nukleotida asid nukleik panjang serpihan menyebabkan perkembangan prosedur menentukan urutan nukleotida yang tepat bagi serpihan DNA atau RNA yang diberikan. Jenis kaedah penjujukan yang berbeza boleh didapati hari ini. Kaedah penjujukan ini, bersama-sama dengan teknologi untuk pembinaan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom organisma, memudahkan penjujukan keseluruhan genom organisma itu, menjadikan analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, kawasan pengawalseliaan gen dll.
Jumlah genom banyak virus, beberapa bakteria, archaebacteria, ragi dan beberapa organisma lain telah disusun dan dipetakan. Projek Genom Manusia telah memungkinkan untuk menjentikkan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan draf pertamanya pada tahun 2003. Ini merupakan peristiwa penting dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia kini digunakan dalam sektor perubatan untuk mengenal pasti sebab -sebab genetik untuk penyakit yang jarang berlaku, risiko penyakit skrin pada bayi yang baru lahir, mengenal pasti butiran genetik kanser yang berbeza, membangunkan terapeutik baru, dan membangunkan alat diagnostik baru, dan lain -lain.
Di dunia tumbuhan, genom beras dan genom Arabidopsis telah disusun. Pengetahuan tentang urutan ini pasti akan merevolusikan pemahaman kita tentang cara sel dan organisma berfungsi.
Rajah_2: Autoradiograph of Sanger Sequencing
Apakah perbezaan antara genotip dan penjujukan?
Genotyping vs Sequencing | |
| Genotyping adalah proses menentukan komposisi genetik individu dan memeriksa kumpulan atau taksonomi organisma itu. | Penjujukan adalah proses menentukan susunan nukleotida yang tepat bagi serpihan DNA atau RNA yang diberikan. |
| Teknik | |
| RFLP, penjujukan gen, PCR, microarrays DNA, AFLP dll. | Penjujukan sanger, penjujukan gilbert, pyrosequencing, penjujukan generasi seterusnya, penjujukan senapang dan lain -lain. |
| Kebimbangan utama | |
| Ini lebih prihatin sama ada perbezaan genotip memberikan perbezaan fenotip sebenar. | Ini lebih prihatin terhadap susunan nukleotida dan perbezaan dan perubahannya dengan organisma lain. |
Ringkasan -Genotyping vs Sequencing
Genotyping dan urutan berguna untuk mengkaji maklumat genetik organisma. Genotyping adalah proses menentukan variasi genotip di kalangan individu dan mencari kategori mereka. Penjujukan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang betul dalam serpihan yang berminat atau kawasan DNA. Kedua -dua teknik memberikan maklumat penting mengenai gen dan genom.
Rujukan:
1. "Kaedah Genotyping."Kaedah dalam Biologi Molekul (Clifton, N.J.). U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, n.d. Web. 20 Feb. 2017.
2. Akey, j. M., D. Sosnoski, e. Parra, s. Dios, k. Heister, b. Su, c. Bonilla, l. Jin, dan m. D. Shriver. "Analisis lengkung lebur SNP (MCSNP ): Pendekatan bebas gel dan murah untuk genotip SNP."Bioteknik 30.2 (2001): 358-67. Web.
Ihsan gambar:
1. "Genotyping RFLP" oleh (tidak diketahui) - Institut Kesihatan Nasional (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia
2. "Pendarfluor Radioaktif" oleh Abizar di Bahasa Inggeris Wikipedia (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
