Apakah perbezaan antara MLVA dan MLST

The Perbezaan utama antara MLVA dan MLST adalah bahawa MLVA menggunakan polimorfisme urutan DNA berulang berulang untuk mencirikan spesies mikrob, sementara MLST menggunakan polimorfisme urutan DNA serpihan dalaman pelbagai gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikroba.

Menaip mikrob biasanya digunakan untuk menentukan sumber dan laluan jangkitan. Ia mengesahkan atau memerintah wabak. Menaip mikrob juga mengesan transmisi silang patogen yang berkaitan dengan penjagaan kesihatan dan mengiktiraf strain yang ganas. Selain itu, menaip mikrob menilai keberkesanan langkah -langkah kawalan spesies mikrob patogen. MLVA dan MLST adalah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam menaip mikrob.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu MLVA 
3. Apa itu MLST
4. Persamaan -MLVA dan MLST
5. Mlva vs mlst dalam bentuk jadual
6. Ringkasan -MLVA vs MLST

Apa itu MLVA?

Analisis Loci VNTR berganda (MLVA) adalah kaedah biologi molekul yang menggunakan polimorfisme urutan DNA berulang berulang untuk mencirikan spesies mikroba. Ia adalah kaedah yang digunakan untuk analisis genetik spesies mikrob tertentu.

Semasa langkah pertama MLVA, setiap lokus VNTR yang disasarkan dikuatkan oleh PCR dengan mengapit primer khusus wilayah. Kemudian serpihan yang diperoleh adalah saiz yang dipisahkan oleh elektroforesis pada sequencer kapilari. Genotyping setiap lokus dan hasil yang disusun dari setiap sampel membolehkan mencirikan mikroorganisma yang spesiesnya dikenali. Ia juga membolehkan mengenal pasti subspesies melalui menaip alel dan perbandingan dengan pangkalan data MLVA.

Rajah 01: MLVA

Kaedah MLVA ini lebih selektif daripada kaedah MLST. Selain itu, kaedah MLVA tidak memerlukan langkah penjujukan DNA. Oleh itu, ia memungkinkan untuk membezakan subspesies atau spesies clonal.

Apa itu MLST?

Menaip urutan multilocus (MLST) adalah teknik yang menggunakan polimorfisme urutan DNA serpihan dalaman pelbagai gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikroba. MLST adalah teknik dalam analisis genetik untuk menaip pelbagai lokus.

Rajah 02: MLST

Ia adalah jenis penaipan penjujukan yang digunakan sebagai teknik rujukan untuk membezakan strain spesies mikrob yang berlainan. Kaedah ini berdasarkan penjujukan gen pengemasan. Gen pengemasan biasanya menyandikan protein penting agen mikrob seperti bakteria. Urutan gen pengemasan ini mempunyai kekhususan yang menyampaikan polimorfisme yang stabil dari masa ke masa. Oleh itu, perbezaan dalam urutan gen pengemasan cukup untuk membezakan strain antara satu sama lain. Selain itu, skim MLST pertama yang akan dibangunkan adalah Neisseria meningitidis, Ejen penyebab meningitis dan septikemia meningokokus. Sejak pengenalannya, MLST telah digunakan bukan sahaja untuk patogen manusia tetapi juga untuk patogen tumbuhan.

Apakah persamaan antara MLVA dan MLST?

• MLVA dan MLST adalah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam menaip mikrob.
• Kedua -dua teknik boleh digunakan untuk analisis filogenetik mikrob.
• Kedua -dua teknik ini berdasarkan polimorfisme genetik.
• Mereka boleh digunakan untuk mengesan penyakit manusia yang menyebabkan patogen mikroba.
• Kedua -dua teknik ini harus dilakukan oleh ahli biologi molekul yang mahir.

Apakah perbezaan antara MLVA dan MLST?

MLVA adalah teknik yang menggunakan polimorfisme urutan DNA berulang berulang untuk mencirikan spesies mikrob. Sementara itu, MLST adalah teknik yang menggunakan polimorfisme urutan DNA serpihan dalaman pelbagai gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikroba. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara MLVA dan MLST. Selain itu, kaedah MLVA lebih selektif daripada kaedah MLST.

Infographic di bawah membentangkan perbezaan antara MLVA dan MLST dalam bentuk jadual untuk perbandingan bersebelahan.

Ringkasan -MLVA vs MLST

MLVA dan MLST adalah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam menaip mikrob. MLVA menggunakan polimorfisme urutan DNA berulang berulang untuk mencirikan spesies mikrob, sementara MLST menggunakan polimorfisme urutan DNA serpihan dalaman pelbagai gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikroba. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara MLVA dan MLST.

Rujukan:

1. "Analisis berulang Tandem-Repeat-Variable-Number (MLVA) berganda (MLVA)."Pusat Kawalan dan Pencegahan Penyakit, Pusat Kawalan dan Pencegahan Penyakit, 16 Feb. 2016.
2. "Penaipan urutan multilocus."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.

Ihsan gambar:

1. "1993 48 Kameido Mengasingkan Genotip" (CC0) melalui Picryl
2. "FMICB-04-00414-G001 (14424086445)" oleh angka phylogeny-FMICB-04-00414-G001 (CC oleh 2.0) melalui Commons Wikimedia