Apakah perbezaan antara garis dan sines

Apakah perbezaan antara garis dan sines

The Perbezaan utama antara garis dan sines adalah garis (elemen nuklear yang diselaraskan panjang) adalah sejenis retrotransposon bukan LTR yang lebih lama manakala sines (unsur nuklear yang diselaraskan pendek) adalah sejenis retrotransposon bukan LTR yang lebih pendek.

Retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi ulangan terminal panjang (LTR). Walau bagaimanapun, ia mengandungi gen untuk transkripase terbalik, protein mengikat RNA, nukleus, dan domain ribonuclease. Retrotransposon bukan LTR mempunyai ulangan pendek. Ulang ini mempunyai urutan asas yang terbalik di sebelah antara satu sama lain. Selain itu, retrotransposon bukan LTR juga mempunyai ulangan langsung yang terdapat dalam transposon LRT.  Retrotransposon bukan LTR jatuh ke dalam dua kategori sebagai garis dan sine.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu baris 
3. Apa itu Sines
4. Persamaan -garis vs sine
5. Garis vs sine dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu baris?

Garisan (elemen nuklear yang diselaraskan panjang) lebih lama bukan retrotransposon LTR. Mereka meluas dalam genom eukariot. Mereka biasanya membuat 21.1% daripada genom manusia. Setiap baris sekitar 7000 pasang asas panjang. Garis boleh ditranskripsikan ke dalam mRNA dan diterjemahkan ke dalam protein yang boleh berfungsi sebagai enzim transkripase terbalik. Transkripase terbalik ini menghasilkan salinan DNA garis RNA. Salinan DNA ini boleh diintegrasikan ke dalam genom di laman web baru.

Rajah 01: Garis dan Sines

Genom manusia hanya mempunyai satu garis yang banyak disebut line-1. Elemen Line-1 adalah sekitar 6000 pasangan asas panjang. Terdapat kira-kira 100,000 elemen garis-1 dipenggal dalam genom manusia. Mutasi rawak boleh berlaku dalam garis. Oleh kerana mutasi rawak, garisan boleh merosot. Mereka tidak lagi disalin atau diterjemahkan. Selain itu, garisan dikelompokkan menjadi lima kumpulan utama seperti L1, RTE, R2, I dan Joki. Lima kumpulan ini selanjutnya subdivida ke dalam 28 lagi clade.

Garis biasanya disebarkan melalui mekanisme yang disebut Sasaran Mekanisme Transkripsi Reverse Primed (TPRT). Penyisipan garisan menyebabkan penyakit manusia seperti haemophilia A, kanser, gangguan Mendelian, dll. Hypomethylation garis juga mencetuskan jenis barah.

Apa itu Sines?

Sines (elemen nuklear yang diselingi pendek) adalah sejenis retrotransposon bukan LTR yang lebih pendek. Mereka berjumlah kira -kira 100 hingga 700 pasangan asas. Sines juga elemen DNA yang menguatkan diri mereka sepanjang genom eukariotik melalui perantaraan RNA. Sines membentuk kira -kira 13% daripada genom mamalia.  Kawasan dalaman sines berasal dari tRNA. Ia tetap sangat konservasi. Mereka sering hadir dalam banyak spesies vertebrata dan invertebrata. Variasi nombor salinan dan mutasi dalam sine boleh dimasukkan untuk membina klasifikasi spesies berasaskan phylogeny.

Sines boleh dikelompokkan menjadi tiga jenis utama: Core-Sines, V-Sines, dan Amnsines. Elemen Alu adalah sinus yang paling biasa di primata. Selain itu, terdapat lebih daripada 50 penyakit manusia yang berkaitan dengan penyisipan sines. Apabila mereka memasukkan dalam atau berhampiran exon, mereka boleh menyebabkan splicing yang tidak betul atau menukar bingkai bacaan. Ini membawa kepada fenotip penyakit seperti kanser payudara, kanser kolon, leukemia, haemophilia, fibrosis sista, kanser kolon, penyakit penyok, neurofibromatosis, dan lain -lain.

Apakah persamaan antara garis dan sines?

  • Talian dan Sinesare Dua jenis retrotransposon bukan LTR.
  • Kedua -duanya tidak mempunyai kawasan terminal yang panjang (LTR).
  • Kedua -duanya hanya dijumpai dalam eukariot.
  • Mereka berdua tidak autonomi.

Apakah perbezaan antara garis dan sines?

Garis adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang, sementara sine adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih pendek. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara garis dan sines. Tambahan pula, kod baris untuk enzim transkrip terbalik, sementara sinus tidak kod untuk enzim transkripase terbalik. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara garis dan sines.

Lebih banyak perbezaan antara garisan dan sines disenaraikan di bawah dalam bentuk jadual untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -Lines vs Sines

Retrotransposon terutamanya ditemui di semua eukariota tetapi tidak hadir dalam prokariot. Kira -kira, 37% daripada genom manusia mengandungi retrotransposon. Retrotransposon terutamanya dua jenis: LTR dan bukan LTR retrotransposon. Retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi ulangan terminal panjang (LTR), yang terdapat dalam retrotransposon LTR. Retrotransposon bukan LTR dibahagikan kepada dua kategori: garis dan sine. Garis adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang, sementara sine adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih pendek. Oleh itu, ini adalah ringkasan perbezaan antara garis dan sine.

Rujukan:

1. "Retrotransposon."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.
2. Hancks, Dustin C., dan Haig h. Kazazian. "Peranan untuk penyisipan retrotransposon dalam penyakit manusia."DNA Mudah Alih, Biomed Central, 6 Mei 2016.

Ihsan gambar:

1. "Line1s and Sines" oleh Mariuswalter - Kerja Sendiri (CC By -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia