Apakah perbezaan antara cis dan splicing trans

The Perbezaan utama antara cis dan splicing trans adalah splicing cis adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan introns dan bergabung dengan exon yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sementara trans-splicing adalah mekanisme intermolecular yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan exon yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama.

Splicing RNA adalah bentuk pemprosesan RNA sebelum sintesis protein. Dalam proses ini, transkrip RNA pra-messenger yang baru dibuat berubah menjadi RNA utusan matang. RNA Messenger matang membantu menghasilkan molekul protein. Semasa splicing RNA, intron (kawasan bukan pengekodan) dikeluarkan, dan exon (kawasan pengekodan) disatukan untuk membuat mRNA matang. CI dan Splicing Trans adalah dua jenis mekanisme splicing RNA.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu splicing cis
3. Apa itu Splicing Trans
4. Persamaan -CIS dan Trans Splicing
5. Cis vs splicing trans dalam bentuk jadual
6. Ringkasan -CIS vs Trans Splicing

Apa itu splicing cis?

Splicing CIS adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menyertai exon yang berada dalam transkrip RNA yang sama. Splicing CIS biasa memproses molekul RNA tunggal. Splicing cis adalah proses splicing tipikal pra mRNA yang dijalankan oleh spliceosomes. Di intron, tapak penderma (5 'akhir intron), tapak cawangan (berhampiran 3' akhir intron) dan tapak penerima (3 'akhir intron) sangat penting untuk splicing. Tapak Donor Splice merangkumi urutan invarian GU pada akhir 5 'intron. Tapak Penerim. Hulu dari urutan Ag, terdapat rantau yang dipanggil rantau pyrimidine (saluran polypyrimidine). Selanjutnya hulu dari saluran polypyrimidine, terdapat titik cawangan yang merangkumi nukleotida adenosin. Nukleotida ini terlibat dalam pembentukan lariat.

Rajah 01: CIS dan Trans Splicing

Spliceosomes utama adalah U1, U2, U4, U5 dan U6. Antara mereka, U1 dan U2 sangat penting. Dalam splicing cis, U1 mengikat ke tapak bersejarah 5 ', dan U2 mengikat ke titik cawangan berhampiran tapak sambatan 3'. U5/U4/U6 mengikat exon di tapak 5 ', dengan U6 mengikat ke U2. Kemudian, U1 dibebaskan. U5 beralih dari exon ke intron, dan u6 mengikat di tapak sambatan 5 '. Tambahan pula, U4 juga dikeluarkan. U6/U2 memangkin transesterifikasi, menjadikan 5 'akhir intron ligate ke nukleotida pada intron. Ini mencetuskan pembentukan lariat. Dalam pembentukan lariat, U5 mengikat exon di tapak berselerak 3 ', dan tapak 5' dipotong. Pada fasa akhir splicing, u2/u5/u6 tetap terikat pada lariat, dan tapak 3 'dipotong. Di samping itu, exon disambungkan menggunakan hidrolisis ATP dalam fasa ini.

Apa itu Splicing Trans?

Trans Splicing adalah mekanisme intermolecular yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan exon yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Dalam trans-splicing, tidak ada tapak sambatan 5 'pada molekul pra mRNA untuk protein U1 untuk mengikat. Sebaliknya, RNA Splice Leader (SL) RNA ditransfisikan ke urutan dalam Outron.

Rajah 02: Splicing trans

Outron adalah rantau mRNA pra antara 5 'cap dan tapak sambatan trans.  Walau bagaimanapun, protein U2 mengikat ke tapak sambatan 3 'biasanya. Setelah mengeluarkan Outron, Exon Pemimpin Splice (SL) disambungkan ke exon pertama pada mRNA pra. Tambahan pula, trans-splicing adalah mekanisme yang diperhatikan dalam mikroorganisma tertentu seperti protis kelas Kinetoplastae untuk menyatakan gen.

Apakah persamaan antara cis dan splicing trans?

• CI dan Splicing Trans adalah dua jenis mekanisme splicing RNA.
• Dalam kedua -dua mekanisme, intron dikeluarkan.
• Juga, dalam kedua -dua mekanisme, exon bergabung untuk membentuk mRNA matang.
• Kedua -dua mekanisme terdapat dalam eukariota.
• Mekanisme ini tidak hadir dalam prokariot.

Apakah perbezaan antara cis dan splicing trans?

Splicing CIS adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menyertai exon yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sementara trans-splicing adalah mekanisme intermolecular yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan exon yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara cis dan splicing trans. Tambahan pula, dalam splicing cis, intron dikeluarkan untuk membentuk mRNA matang. Sebaliknya, dalam intren splicing trans atau outron dikeluarkan untuk membentuk mRNA matang.

Infographic berikut menyenaraikan perbezaan antara cis dan splicing trans dalam bentuk tabular untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -CIS vs Trans Splicing

Splicing RNA adalah bentuk pemprosesan RNA sebelum proses sintesis protein. CI dan Splicing Trans adalah dua jenis mekanisme splicing RNA yang terdapat dalam eukariota. Splicing CIS adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menyertai exon yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sementara trans-splicing adalah mekanisme intermolecular yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan exon yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Oleh itu, ini menyimpulkan perbincangan perbezaan antara CIS dan trans splicing.

Rujukan:

1. "Splicing RNA: intron, exon dan spliceosome."Nature News, Nature Publishing Group.
2. "Splicing Trans."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.

Ihsan gambar:

1. "Trans-splicing" von AB-AB (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Rajah-trans-splicing" oleh JMRR-UAM-Kerja Sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia