Perbezaan antara shRNA dan siRNA

shrna vs siRNA

Semasa proses gangguan RNA (RNAi), ekspresi gen sasaran ditebang dengan kekhususan dan selektiviti yang tinggi. RNAi adalah proses semulajadi, dan ia melibatkan RNA yang mengganggu kecil (siRNA) dan RNA rambut pendek (shRNA) dan shRNA yang berfungsi. Pada masa ini, RNAi digunakan secara meluas sebagai alat untuk terapi kanser yang diperibadikan. Aplikasi RNAi pada dasarnya dilakukan dengan molekul siRNA berasaskan vektor yang disintesis secara kimia dan vektor. Walaupun kedua -dua molekul ini mempunyai hasil fungsi yang sama, mereka berbeza dalam struktur mereka; Oleh itu, mekanisme tindakan molekul, laluan RNA, dan kesan luar sasaran kedua-dua molekul ini juga berbeza.

shRNA

shRNA adalah urutan molekul RNA kecil yang membuat giliran rambut yang ketat yang boleh digunakan untuk membungkam ekspresi gen sasaran semasa RNAi. Ekspresi shRNA dicapai oleh vektor, yang boleh sama ada virus atau bakteria atau dengan penghantaran plasmid. Mereka disintesis dalam nukleus sel dan diangkut ke sitoplasma untuk proses selanjutnya. Molekul -molekul ini mempunyai laluan pematangan yang sama miRNA; Oleh itu sintesis miRNA telah memberikan asas untuk memahami sintesis shRNA. Sama ada RNA polimerase II atau III dapat menyalin shRNA melalui promotor RNA polimerase II atau III. Kelebihan penggunaan shRNA adalah bahawa mereka mempunyai kadar degradasi dan perolehan yang agak rendah. Kelemahannya adalah bahawa ia memerlukan vektor ekspresi, yang boleh menyebabkan beberapa masalah keselamatan.

siRNA

siRNA adalah molekul RNA terkandas berganda yang terdiri daripada 20-25 pasang asas panjang. Ini digunakan untuk penindasan gen dengan membungkam mana -mana gen dengan urutan nukleotida pelengkap dalam laluan RNAi. Knockdown gen oleh pemindahan siRNA sering tidak berjaya kerana kesan sementara; terutamanya dalam sel yang membahagikan dengan cepat dan penindasan tidak bertahan lebih lama. Untuk mengatasi masalah ini, siRNA diubahsuai dengan memperkenalkan struktur rambut pendek. Molekul yang diubah suai ini kemudian dikenali sebagai shRNA. shRNA harus ditukar kepada siRNA oleh dicer untuk meneruskan fungsi normalnya.

Apakah perbezaan antara shRNA dan siRNA?

• Tidak seperti siRNA, shRNA mempunyai struktur rambut tambahan. shRNA adalah versi siRNA yang diubah suai.

• shRNA memerlukan vektor ungkapan, sedangkan siRNA tidak.

• shRNA boleh digunakan untuk knockdown jangka panjang manakala siRNA hanya boleh digunakan untuk ketukan jangka pendek gen.

• Tidak seperti penindasan gen siRNA, penindasan shRNA tahan lama, dan jika ia dimasukkan melalui vektor virus yang sesuai, ia boleh menghasilkan kesan pembubaran gen kekal.

• Dicer dikehendaki menukar shRNA kembali ke molekul siRNA untuk melaksanakan fungsi normalnya.