Perbezaan antara primer rawak dan oligo dt

The Perbezaan utama antara primer rawak dan oligo dt ialah Primer rawak adalah campuran semua urutan oligonukleotida hexamer yang mungkin, manakala primer Oligo DT terdiri daripada regangan 12-18 deoxythymidines 12-18.

Transkripsi terbalik adalah mekanisme di mana cDNA boleh disintesis menggunakan mRNA atau mana -mana spesies RNA. Untuk menghasilkan cDNA, enzim transkripase terbalik dan komponen lain yang diperlukan harus disediakan, terutama templat dan primer. Primer adalah urutan DNA pendek yang direka khusus untuk penguatan urutan sasaran. Primer rawak dan primer oligo dt adalah dua jenis primer biasa yang digunakan dalam transkripsi terbalik. Oleh itu, primer rawak atau primer oligo dt adalah urutan oligonukleotida DNA pendek yang diperlukan untuk transkripase terbalik untuk memulakan transkripsi terbalik. Bergantung pada templat RNA, primer yang sesuai dapat dipilih dari kedua -dua jenis primer ini.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu primer rawak 
3. Apa itu oligo dt
4. Persamaan antara primer rawak dan oligo dt
5. Perbandingan sampingan - primer rawak vs oligo dt dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu primer rawak?

Primer Rawak adalah campuran oligonukleotida yang mewakili semua urutan hexamer yang mungkin. Urutan primer primer rawak adalah 5 ' - d (nnnnnn) -3' n = g, a, t atau c. Oleh itu, primer rawak boleh digunakan untuk penguatan DNA atau RNA tunggal-stranded oleh polimerase DNA atau transkrip terbalik, masing-masing. Selain itu, campuran primer rawak mampu menguatkan semua kawasan RNA untuk menghasilkan cDNA. Oleh itu, ia menghasilkan pelbagai panjang cDNA.

Rajah 01: Primer rawak

Paling penting, campuran primer rawak tidak menunjukkan kekhususan templat. Ia tidak mampu membezakan mRNA dan spesies RNA yang lain. Dan, ia menyebarkan dengan spesies RNA dalam sampel. Walau bagaimanapun, campuran primer rawak sesuai untuk transkripsi terbalik RNA tanpa poli (a) ekor, seperti rRNA, tRNA, RNA bukan pengekodan, RNA kecil, mRNA prokariotik dan lain-lain., RNA yang terdegradasi, dan RNA dengan struktur sekunder yang diketahui.

Apa itu oligo dt?

Oligo Dt Primer adalah peregangan 12 - 18 deoxythymine (dt). Urutan primer boleh diwakili sebagai 5'-D (TTT TTT TTT TTT TTT TTT) -3. Ia digunakan untuk pengeluaran cDNA dari mRNA yang mengandungi ekor poli (a). Pada asasnya, ia bertindak sebagai primer untuk reaksi yang dikatalisis oleh transkripase terbalik. Semasa transkripsi terbalik, oligo dt primer anneals dengan ekor poli-adenilasi yang ditemui pada akhir 3 'kebanyakan mRNA eukariotik dan memulakan proses.

Rajah 02: Transkripsi terbalik menggunakan Oligo Dt Primer

Tidak seperti primer rawak, oligo dt primer tidak sesuai untuk RNA atau RNA yang terdegrad.

Apakah persamaan antara primer rawak dan oligo dt?

• Primer Rawak dan Oligo DT Primer adalah dua jenis primer yang digunakan dalam transkripsi terbalik dan membuat cDNA.
• Menggunakan primer rawak dan primer oligo dt bersama -sama meningkatkan sensitiviti sintesis cDNA.
• Mereka adalah urutan nukleotida pendek tunggal.

Apakah perbezaan antara primer rawak dan oligo dt?

Primer Rawak adalah urutan oligonukleotida pendek yang terdiri daripada urutan rawak. Sementara itu, Oligo Dt Primer adalah helai pendek yang terdiri daripada 12 hingga 18 deoxythymidine. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara primer rawak dan oligo dt. Urutan primer rawak adalah 5 ' - d (nnnnnn) -3' n = g, a, t atau c. Sedangkan urutan oligo dt primer adalah 5'-d (ttt ttt ttt ttt ttt ttt) -3 '. Oleh itu, kita boleh menganggap ini sebagai perbezaan lain antara primer rawak dan oligo dt.

Lebih -lebih lagi, primer rawak tidak menunjukkan kekhususan templat, dan mereka menyebarkan dengan spesies RNA, sementara primer oligo dt menunjukkan kekhususan untuk poli (a) ekor mRNA eukariotik.

Infographic di bawah meringkaskan perbezaan antara primer rawak dan oligo dt.

Ringkasan - Primer Rawak vs Oligo Dt

Primer Rawak dan Oligo DT Primer adalah dua jenis primer yang digunakan dalam sintesis cDNA. Primer rawak terdiri daripada campuran oligonukleotida, yang mewakili semua urutan hexamer yang mungkin, sementara oligo dt primer adalah urutan tunggal terkandas 12 hingga 18 deoxythymidine. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara primer rawak dan oligo dt. Di samping struktur sekunder. Oleh itu, primer rawak tidak menunjukkan kekhususan templat manakala primer oligo dt menunjukkan kekhususan ke arah mRNA eukariotik yang mengandungi poli (a) ekor.

Rujukan:

1. "Persediaan transkripsi terbalik: Thermo Fisher Scientific - AS."Persediaan transkripsi terbalik | Thermo Fisher Scientific - AS, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Primers Revcomp" oleh Zephyris - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "RT PCR Model" oleh Lokeshthimmana - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia