Perbezaan antara NGS dan WGS

The Perbezaan utama antara NGS dan WGS adalah penjujukan generasi akan datang (NGS) adalah teknologi penjujukan generasi kedua yang selari secara besar-besaran yang tinggi, kos rendah, dan cepat, manakala penjujukan keseluruhan genom (WGS) adalah kaedah yang komprehensif untuk menganalisis keseluruhan DNA genom pada satu masa dengan menggunakan teknik penjujukan seperti penjujukan sanger, pendekatan senapang patah atau penjujukan ngs tinggi.

Dalam beberapa dekad yang lalu, pemahaman genom manusia dan haiwan lain telah meningkat secara besar -besaran kerana penemuan teknik penjujukan cepat dan alat bioinformatik. Teknik penjujukan konvensional seperti penjujukan sanger mempunyai batasan mereka, yang menyeru pembangunan kaedah penjujukan cepat baru seperti penjujukan generasi akan datang (NGS) dan penjujukan nanopore. Teknik penjujukan keseluruhan genom (WGS) adalah pendekatan baru-baru ini yang telah digunakan dalam banyak projek penyelidikan genomik, seperti 100,000 projek genom oleh Genomic England, UK. Oleh itu, NGS dan WGS adalah dua kaedah penjujukan yang sedang dimasukkan dalam banyak projek genomik.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu NGS 
3. Apa itu WGS
4. Persamaan - NGS dan WGS
5. Ngs vs wgs dalam bentuk jadual
6. Ringkasan - NGS vs WGS

Apa itu NGS?

NGS (penjujukan generasi akan datang) adalah teknologi penjujukan generasi kedua secara besar-besaran yang tinggi, kos rendah, dan cepat. Tidak ada definisi yang tepat untuk penjujukan generasi akan datang. Tetapi kita dapat membezakannya dengan jelas dari teknik penjujukan berasaskan kapilari konvensional. Penjujukan generasi akan datang membolehkan penjujukan molekul DNA dengan saiz keseluruhan lebih besar daripada 1 juta pasang asas dalam satu percubaan. Ia menawarkan pilihan kelajuan yang tidak pernah berlaku sebelum ini, seperti membenarkan penjujukan DNA pelbagai individu pada masa yang sama. Ini dicapai dengan mengurangkan jumlah tindak balas penjujukan individu. Selain itu, ini juga membatasi saiz instrumen dan meminimumkan kos reagen setiap reaksi.

Rajah 01: Platform NGS

NGS adalah kaedah penjujukan pendek yang telah merevolusikan bidang penyelidikan biologi. Tambahan pula, NGS digunakan dalam pelbagai bidang seperti penjujukan genom de novo, penjujukan keseluruhan genom, analisis transkrip, rNA kecil dan penjujukan RNA mikro, resequencing yang disasarkan, dan penjujukan keseluruhan exome.

Apa itu WGS?

WGS (penjujukan keseluruhan genom) adalah kaedah yang komprehensif untuk menganalisis keseluruhan DNA genom sel pada satu masa dengan menggunakan teknik penjujukan seperti penjujukan sanger, pendekatan senapang patah, atau penjujukan NGS yang tinggi. Ia juga dikenali sebagai penjujukan genom penuh atau penjujukan genom lengkap. Penjujukan keseluruhan genom memerlukan penjujukan semua DNA kromosom organisma serta DNA dalam mitokondria, dan untuk tumbuhan, DNA dalam kloroplas pada satu masa. WGS membolehkan saintis membaca urutan tepat semua huruf yang membentuk set lengkap DNA. WGS Menggunakan Platform NGS dijangka merevolusikan Persediaan Klinikal.

Rajah 02: WGS vs penjujukan senapang hierarki

Penjujukan keseluruhan genom diperkenalkan kepada penjagaan klinikal pada tahun 2014. Tambahan pula, penerapan WGS melibatkan penjujukan gen di peringkat SNP untuk menentukan variasi fungsional dalam kajian persatuan, campur tangan terapeutik dalam perubatan yang diperibadikan, biologi evolusi, analisis genomik perbandingan, mutasi dan kajian semula, kajian persatuan yang jarang berlaku, dan meramalkan kerentanan penyakit dan ubat -ubatan respons.

Apakah persamaan antara NGS dan WGS?

• NGS dan WGS adalah dua teknik penjujukan.
• Kedua -dua teknik sama ada urutan DNA atau RNA.
• Teknik ini baru dan boleh dipercayai.
• Kedua -duanya digunakan dalam mendiagnosis penyakit dan penemuan dadah.

Apakah perbezaan antara NGS dan WGS?

NGS adalah teknologi penjujukan generasi kedua yang selari secara besar-besaran yang tinggi, kos rendah, dan cepat, sementara WGS adalah kaedah yang komprehensif untuk menganalisis seluruh DNA genomik sel pada satu masa dengan menggunakan teknik penjujukan seperti penjujukan sanger, senapang Pendekatan atau penjujukan NGS yang tinggi. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara NGS dan WGS. Selain itu, NGS hanya terdiri daripada kaedah penjujukan generasi kedua manakala WGS terdiri daripada kaedah penjujukan generasi pertama, kedua, dan ketiga.

Jadual berikut membentangkan perbezaan antara dan NGS dan WGS dalam bentuk tabular untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -NGS vs WGS

Dalam beberapa dekad yang lalu, teknik penjujukan yang berbeza secara rutin telah digunakan dalam penyelidikan molekul kontemporari. Dan walaupun mereka adalah alat yang sangat kuat untuk banyak aplikasi klinikal. NGS dan WGS adalah dua kaedah penjujukan yang sedang dimasukkan dalam banyak projek genomik.   NGS adalah teknologi penjujukan generasi kedua yang tinggi, kos rendah, dan cepat. Sebaliknya, WGS adalah kaedah menganalisis keseluruhan DNA genomik atau DNA genomik penuh sel pada satu masa dengan menggunakan teknik penjujukan seperti penjujukan sanger, pendekatan senapang patah, atau penjujukan ngs tinggi. Jadi, ini adalah ringkasan perbezaan antara NGS dan WGS.

Rujukan:

1. Behjati, Sam, dan Patrick S Tarpey. "Apakah penjujukan generasi akan datang?"Arkib penyakit pada zaman kanak -kanak. Edisi Pendidikan dan Amalan, BMJ Publishing Group.
2. "Penjujukan genom keseluruhan."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.

Ihsan gambar:

1. "Penjujukan Generasi ke -2" oleh Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski, dan Andrzej Tretyn - Jurnal Genetik Gunaan - Jilid 52 - Isu 4 (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Penjejakan senapang genom keseluruhan berbanding jujukan senapang hierarki" oleh Commins, J., Toft, c., Tambang, m. A. - "Kaedah Biologi Komputasi dan Aplikasi mereka kepada Genomik Perbandingan Bakteria Simbiotik Endocellular Serangga" Biol. Prosedur dalam talian (2009). Diakses melalui SpringerImages. (CC BY-SA 2.5) Melalui Wikimedia Commons