Perbezaan antara jujukan senapang genom hierarki dan keseluruhan

The Perbezaan utama antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom adalah bahawa Dalam penjujukan senapang hierarki, genom dipecah menjadi serpihan yang lebih besar sebelum penjujukan sementara, dalam penjujukan senapang genom keseluruhan, keseluruhan genom dipecah menjadi serpihan kecil untuk penjujukan.

Penjujukan adalah teknik penting dalam proses molekul, terutamanya dalam pengenalan spesies yang tepat. Malah, ia adalah teknik mengenal pasti urutan nukleotida yang tepat dalam gen atau genom. Terdapat banyak teknik untuk penjujukan. Sebahagian daripada ini termasuk kaedah Maxam Gilbert, kaedah Sanger dan kaedah Sanger automatik.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah penjujukan senapang hierarki
3. Apakah jujukan senapang genom keseluruhan
4. Persamaan antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom
5. Perbandingan sampingan - hierarki vs jujukan senapang genom keseluruhan dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apakah penjujukan senapang hierarki?

Penjujukan senapang hierarki adalah satu kaedah penjujukan. Ia juga dipanggil 'urutan atas'. Selanjutnya, kaedah ini terdiri daripada dua langkah: langkah pertama adalah penguatan genom, dan langkah kedua adalah pemecahan genom. Dalam kaedah ini, genom itu diserap ke dalam serpihan besar terlebih dahulu. Ia diikuti dengan pengklonan serpihan besar ini ke dalam pelbagai tuan rumah menggunakan vektor atau kromosom buatan. Kemudian, vektor rekombinan ini disusun ke dalam perpustakaan. Semasa penjujukan senapang patah, klon vektor rekombinan menjalani penjujukan secara individu. Serpihan dalam klon menjalani penghadaman sekatan untuk mengurangkan saiz genom, dengan itu menjalani penjujukan.

Rajah 01: penjujukan senapang hierarki

Semasa penjujukan senapang hierarki, potongan besar serpihan perlu diatur, sebelum penjujukan senapang patah. Ia berlaku dengan bantuan penanda molekul yang diperbadankan semasa proses pengklonan.

Penjujukan senapang hierarki mencipta peta gen resolusi rendah. Tetapi ia mewujudkan peta urutan yang diperintahkan. Oleh itu, ia mengambil masa yang lebih lama daripada penjujukan langsung. Seluruh proses kelewatan kerana penciptaan perpustakaan vektor rekombinan. Adakah ia juga teknik intensif buruh. Walau bagaimanapun, pada masa ini, teknik ini automatik untuk meringankan kerja.

Apakah jujukan senapang genom keseluruhan?

Penjejakan senapang patah genom keseluruhan adalah satu proses penjujukan langkah tunggal. Dalam proses ini, keseluruhan ricih genom berlaku terlebih dahulu. Berikutan ini, setiap serpihan kecil ini mengalami penjujukan secara rawak. Setelah selesai penjujukan, analisis urutan berlangsung. Semasa analisis urutan, urutan bertindih dikeluarkan, dan analisis bukan proses yang diperintahkan. Oleh itu, pemasangan urutan adalah proses yang kurang efisien berbanding dengan penjujukan senapang hierarki. Walau bagaimanapun, proses keseluruhan penjujukan senapang genom lebih cepat, dan analisis seluruh genom boleh berlaku pada satu contoh.

Apakah persamaan antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom?

• Jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom adalah dua pendekatan penjujukan.
• Kedua -duanya menjalani jujukan sanger atau kaedah penjujukan sanger automatik.
• Mereka terlibat dalam penjujukan serpihan DNA dan RNA.
• Selain itu, kedua -dua kaedah penting dalam diagnostik molekul dan tujuan penyelidikan.
• Pada masa ini, kedua-dua teknik adalah automatik atau berasaskan komputer.
• Kedua -dua teknik ini bergantung pada pemecahan genom.

Apakah perbezaan antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom?

Penjujukan senapang hierarki menghasilkan serpihan bersaiz yang lebih besar berbanding dengan penjujukan senapang patah genom, yang berfungsi dengan serpihan kecil urutan. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom. Di samping.

Tambahan pula, perbezaan lain antara jujukan senapang hirik dan seluruh genom adalah bahawa resolusi lebih tinggi dalam penjujukan senapang patah genom berbanding dengan penjujukan senapang hierarki.

Infographic di bawah meringkaskan perbezaan antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom.

Ringkasan -Hierarki vs Penjejakan Senapang Genom Seluruh

Jujukan senapang hierarki dan seluruh genom adalah dua teknik untuk mengiris genom besar. Urutan senapang hierarki adalah proses dua langkah penjujukan di mana genom dipecah menjadi serpihan yang lebih besar. Sebaliknya, penjujukan senapang patah genom adalah satu langkah penjujukan langkah di mana genom dipecah menjadi serpihan kecil dan disusun secara langsung. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara jujukan senapang hierarki dan keseluruhan genom. Selain itu, aspek teknikal mungkin berbeza antara kedua -dua teknik.

Rujukan:

1. Waterston, Robert H, et al. "Mengenai penjujukan genom manusia."Prosiding Akademi Sains Negara Amerika Syarikat, Akademi Sains Kebangsaan, 19 Mac. 2002, boleh didapati di sini.
2. Pal, Shital. "Penjujukan genom."LinkedIn Slideshare, 4 Nov. 2014, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Penjejakan senapang genom keseluruhan berbanding jujukan senapang hierarki" oleh Commins, J., Toft, c., Tambang, m. A. - "Kaedah biologi pengiraan dan aplikasi mereka kepada genomik perbandingan bakteria simbiotik endoselular serangga."Biol. Prosedur dalam talian (2009). Diakses melalui SpringerImages (CC BY-SA 2.5) Melalui Wikimedia Commons