Perbezaan antara exome dan transkrip

Perbezaan antara exome dan transkrip

Perbezaan utama - exome vs transkrip
 

Gen mengandungi kawasan pengekodan dan bukan pengekodan di dalamnya. Urutan pengekodan dikenali sebagai exon, dan urutan bukan pengekodan dikenali sebagai intron.  Urutan nukleotida dari exon gen mewakili kod genetik gen untuk mensintesis protein tertentu. Oleh itu, exon kekal dalam molekul mRNA. Jumlah rantau exon genom dikenali sebagai exome, dan ia merupakan bahagian penting dari genom. Kod genetik gen ditukar kepada kod genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk pengeluaran protein. Keseluruhan molekul mRNA yang diterjemahkan dalam sel atau populasi sel pada satu masa dikenali sebagai transkrip. Perbezaan utama antara exome dan transkrip adalah bahawa exome mewakili urutan kawasan exon genom manakala Transkrip mewakili jumlah mRNA sel atau tisu pada masa tertentu.

Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa yang Exome
3. Apa itu transkrip
4. Perbandingan sampingan - exome vs transkrip
5. Ringkasan

Apa yang Exome?

Gen terdiri daripada exon, intron dan urutan pengawalseliaan. Exon adalah kawasan gen yang disalin ke dalam urutan mRNA semasa transkripsi. Intron dan kawasan bukan pengekodan lain dikeluarkan semasa transkripsi. Urutan nukleotida exon menentukan kod genetik gen yang mensintesis kod protein tertentu. Hanya exon yang kekal dalam mRNA protein. Koleksi exon dalam genom dikenali sebagai exome organisma. Ia mewakili sebahagian daripada genom yang dinyatakan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ia adalah bahagian pengekodan protein genom manusia.

Rajah 01: exome

Apa itu transkrip?

Transkrip adalah pengumpulan semua transkrip pengekodan dan pengekodan protein (RNA) dalam tisu tertentu. Transkrip mewakili pengumpulan jumlah molekul mRNA yang dinyatakan oleh gen dalam sel atau tisu. Transkrip sel boleh diubah dengan transkrip jenis sel lain. Transkrip juga dinamik - ia berubah dengan masa sebagai tindak balas kepada rangsangan dalaman dan luaran. Walaupun dalam tisu yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkrip boleh berubah selepas beberapa minit.

Transkrip berbeza dari exome organisma. Transkrip termasuk hanya urutan exome yang dinyatakan. Walaupun exome sel tetap sama, transkrip berbeza di antara sel kerana ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau tisu. Hanya gen penting yang dinyatakan dalam sel dan tisu yang berbeza. Ekspresi gen adalah proses spesifik tisu atau jenis sel. Ia dikawal oleh pelbagai faktor termasuk faktor persekitaran. Oleh itu, transkrip boleh berbeza dengan keadaan persekitaran luaran.

Transkrip digunakan sebagai pendahulu untuk kajian proteomik. Semua protein diperoleh daripada urutan mRNA. Pengubahsuaian translasi dapat mengakibatkan perubahan protein. Walau bagaimanapun, transkrip memberikan maklumat asas penting untuk kajian proteomik.

Rajah 02: Transkrip sel stem embrio

Apakah perbezaan antara exome dan transkrip?

Exome vs transkrip

Exome adalah koleksi kawasan pengekodan protein gen. Transkrip adalah pengumpulan semua RNA yang ditranskripsikan termasuk mRNA.
Contoh
Exome dikaji menggunakan sampel DNA. Transkrip dikaji menggunakan sampel RNA.
Kaedah Kajian
Penjujukan keseluruhan exome adalah kaedah mengkaji exome. Penjujukan RNA adalah kaedah mengkaji transkrip.

Ringkasan -Exome vs Transcriptome

Exon adalah urutan pengekodan gen dan menentukan urutan mRNA protein. Koleksi urutan pengekodan ini (exon) dikenali sebagai exome organisma. Gen disalin ke molekul mRNA sebelum membuat protein. Jumlah molekul mRNA sel atau tisu pada bila -bila masa dikenali sebagai transkrip. Transkrip mewakili gen yang secara aktif dinyatakan dalam mRNA pada bila -bila masa. Transkrip adalah sel dan tisu khusus dan memberi kesan kepada keadaan persekitaran. Ini adalah perbezaan antara exome dan transkrip.

Rujukan:
1.Sarah et al, "Penangkapan yang disasarkan dan penjujukan secara besar -besaran dari dua belas orang Exomes."Alam. U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, 10 Sept. 2009. Web. 01 Apr. 2017
2.Mutz et al. "Analisis transkrip menggunakan penjujukan generasi akan datang."Elsevier: Pencari Artikel. N.p., Sept. 2012. Web. 01 Apr. 2017

Ihsan gambar:
1."Transkrip sel Pluripotent" oleh Grskovic, m. dan Ramalho-santos, m., Transkrip Pluripotent (10 Oktober 2008), Stembook, ED. Komuniti Penyelidikan Sel Stem, Stembook, DOI/10.3824/STEMBOOK.1.24.1, http: // www.Stembook.org. - [1] Direct Systembook Rajah 2 Transkrip sel pluripoten.Grskovic, m. dan Ramalho-santos, m., Transkrip Pluripotent (10 Oktober 2008), Stembook, ED. Komuniti Penyelidikan Sel Stem, Stembook, DOI/10.3824/STEMBOOK.1.24.1, (CC oleh 3.0) melalui Commons Wikimedia