Perbezaan antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah

Perbezaan antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah

The Perbezaan utama Antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah terletak pada kaedah kelakuan mereka. Klon dengan kaedah penjujukan klon melibatkan pemetaan kromosom dan pengklonan sebelum penjujukan manakala klon oleh penjujukan senapang menghilangkan kedua -dua pemetaan kromosom dan langkah kloning semasa penjujukan.

Klon oleh penjujukan klon dan klon oleh penjujukan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom moden. Klon dengan penjujukan klon adalah kaedah penjujukan yang lebih dipercayai. Walau bagaimanapun, kaedah klon oleh penjujukan senapang lebih cepat dan lebih murah. Artikel ini memberi tumpuan kepada perbezaan halus antara klon oleh penjujukan klon dan jujukan senapang patah.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah klon dengan penjujukan klon 
3. Apa itu klon dengan penjujukan senapang patah
4. Persamaan antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah
5. Perbandingan sampingan - Klon oleh Clone Sequencing vs Serpus Pistol dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apakah klon dengan penjujukan klon?

Klon dengan penjujukan klon adalah kaedah penjujukan genom. Ia memerlukan pemetaan setiap kromosom sebelum pemisahan DNA. Selepas pemetaan, DNA harus dipecah menjadi serpihan panjang 150 kilobase. Serpihan ini kemudiannya siap untuk penjujukan. Langkah seterusnya ialah penyisipan serpihan DNA ke dalam kromosom buatan bakteria (BACs) dan kemudian ke dalam sel bakteria. Oleh kerana serpihan kini berada di dalam sel bakteria, setiap kali bakteria membahagikan, serpihan DNA yang dimasukkan juga membahagikan dan menghasilkan banyak salinan yang sama. Kemudian, DNA klon bakteria individu dipecah menjadi 500 pasang asas serpihan panjang. Mereka lebih kecil dan bertindih. Seterusnya, penjujukan berlaku dengan penyisipan serpihan ini menjadi vektor dengan urutan DNA yang diketahui. Bermula dari urutan vektor yang diketahui, penjujukan berterusan sehingga urutan yang tidak diketahui.

Setelah menamatkan penjujukan, perlu mengenal pasti bidang urutan bertindih. Selepas itu, menyertai serpihan berlaku untuk membentuk serpihan yang lebih besar pada mulanya dibentangkan dalam BACS. Seterusnya, pemasangan serpihan yang lebih besar ke dalam kromosom berlaku mengikut peta genom.

Rajah 01: klon dengan penjujukan klon

Kelebihan penting klon oleh penjujukan klon adalah bahawa peta genom yang telah disediakan membantu pemasangan serpihan yang lebih besar. Tetapi, kelemahan kaedah penjujukan ini adalah bahawa ia memakan masa untuk menghasilkan peta genom dan membuat klon. Walau bagaimanapun, ini adalah kaedah yang disukai semasa 'Projek Genom Manusia'.

Apa itu klon dengan penjujukan senapang patah?

Klon oleh jujukan senapang patah adalah kaedah penjujukan yang secara rawak memecahkan urutan DNA ke dalam banyak serpihan kecil dan memasang semula urutan dengan mengamati kawasan bertindih. Genom mamalia yang lebih besar sukar untuk mengklonkan urutan dan berkumpul. Ia disebabkan oleh kerumitan dan saiz struktur mereka. Walaupun klon oleh kaedah penjujukan klon boleh dipercayai, ia memerlukan masa yang lama untuk urutan genom organisma kompleks. Oleh itu, klon oleh penjujukan senapang patah telah menjadi kaedah penjujukan yang lebih murah yang boleh dilakukan dengan lebih cepat. Oleh itu, saintis moden bergantung pada kaedah penjujukan ini untuk menangani genom kompleks.

Rajah 02: Klon oleh penjujukan senapang patah

Semasa klon dengan kaedah penjujukan senapang patah, tiada pemetaan genom konvensional dan langkah pengklonan berlaku. Pada mulanya, keseluruhan genom dipecah menjadi saiz yang berbeza -beza dari 20 kilobase hingga 300 kilobases. Seterusnya, penjujukan berlaku. Kemudian, menggunakan perisian komputer yang canggih, perlu memasang serpihan dengan melihat kawasan bertindih.

Klon dengan penjujukan senapang membantu meningkatkan ketepatan urutan genom sedia ada. Kelebihan utama kaedah ini ialah ia adalah lebih cepat dan lebih murah daripada klon dengan kaedah penjujukan klon. Walau bagaimanapun, proses ini tidak melibatkan penggunaan peta genetik. Oleh itu, kesilapan semasa perhimpunan lebih cenderung berlaku. Oleh itu, ini adalah kelemahan utama dalam klon oleh kaedah penjujukan senapang patah.

Apakah persamaan antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah?

  • Kedua -dua klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom.
  • Semasa kedua-dua teknik penjujukan, pemasangan serpihan pecah berlaku dengan mengenal pasti kawasan bertindih.
  • Juga, pecahan DNA ke serpihan yang lebih kecil diperlukan untuk kedua -dua klon dan senapang senapang.

Apakah perbezaan antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah?

Klon oleh teknik penjujukan klon melibatkan dua langkah utama: pemetaan kromosom dan pengklonan. Sebaliknya, klon oleh penjujukan senapang patah tidak mengikuti kedua -dua langkah ini; Ia secara rawak memecahkan urutan DNA ke dalam banyak serpihan kecil dan memasang semula urutan dengan memerhatikan kawasan bertindih. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah. Oleh kerana faktor ini, klon oleh penjujukan klon adalah proses yang mahal dan memakan masa manakala klon oleh penjujukan senapang patah lebih cepat dan lebih murah.

Walau bagaimanapun, kesilapan semasa perhimpunan kurang berkemungkinan berlaku semasa klon oleh penjujukan klon. Oleh itu, ia mempunyai kebolehpercayaan yang tinggi. Walau bagaimanapun, klon oleh penjujukan senapang adalah teknik yang kurang dipercayai. Oleh itu, ini juga merupakan perbezaan yang signifikan antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.

Info-Grafik di bawah ini memberikan lebih banyak maklumat mengenai perbezaan antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.

Ringkasan -Klon oleh Clone Sequencing vs Sequencing SHOSTGUN

Dalam meringkaskan perbezaan antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah, klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom. Walau bagaimanapun, klon oleh teknik penjujukan klon melibatkan kedua -dua proses pemetaan dan kloning genom manakala klon oleh penjujukan senapang patah tidak. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara klon oleh penjujukan klon dan penjujukan senapang patah. Oleh kerana pemetaan genom berlaku semasa klon oleh penjujukan klon, kesilapan kurang berkemungkinan berlaku semasa perhimpunan urutan. Tetapi, klon oleh penjujukan senapang patah adalah proses yang lebih cepat dan lebih murah. Namun, ia agak kurang dipercayai. Clone by Clone Sequencing adalah kaedah penjujukan pilihan semasa 'Projek Genom Manusia'. Tetapi, ahli biologi molekul moden lebih bergantung pada klon dengan penjujukan senapang.

Rujukan:

1. "Apakah penjujukan klon-demi-klon?"Fakta, Pasukan Penglibatan Awam di Kampus Genome Wellcome, 17 Nov. 2014, boleh didapati di sini.
2. "Apakah jujukan senapang patah?"Fakta, Pasukan Penglibatan Awam di Kampus Genome Wellcome, 17 Nov. 2014, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Langkah Pengklonan Molekul" oleh Alexpicardal97 - Kerja Sendiri, CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Penjejakan senapang LG" oleh Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan - Institut Kesihatan Nasional. Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan. "Bercakap Glosari istilah genetik."Diperoleh pada 17 November 2016 (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia