Perbezaan antara berjalan kromosom dan melompat
Perbezaan utama - berjalan kromosom vs melompat
Kromosom berjalan dan melompat kromosom adalah dua alat teknikal yang digunakan dalam biologi molekul untuk mencari gen pada kromosom dan pemetaan fizikal genom. Chromosome Walking adalah teknik yang digunakan untuk mengklonkan gen sasaran di perpustakaan genom dengan pengasingan berulang dan pengklonan klon bersebelahan perpustakaan genomik. Jumping Kromosom adalah versi khas berjalan kromosom yang mengatasi titik putus kromosom berjalan. Berjalan kromosom hanya boleh mengurutan dan memetakan panjang kromosom panjang manakala lompatan kromosom membolehkan penjujukan bahagian besar kromosom. Ini adalah perbezaan utama antara berjalan kromosom dan melompat kromosom.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu berjalan kromosom
3. Apa itu Jumping Kromosom
4. Perbandingan sampingan - kromosom berjalan vs melompat
5. Ringkasan
Apa itu berjalan kromosom?
Chromosome Walking adalah alat yang meneroka kawasan urutan yang tidak diketahui kromosom dengan menggunakan serpihan sekatan bertindih. Dalam berjalan kromosom, sebahagian daripada gen yang diketahui digunakan sebagai siasatan dan diteruskan dengan mencirikan panjang penuh kromosom untuk dipetakan atau disusun. Ini pergi dari penanda ke panjang sasaran. Dalam berjalan kromosom, hujung setiap serpihan bertindih digunakan untuk hibridisasi untuk mengenal pasti urutan seterusnya.
Probe disediakan dari kepingan akhir DNA yang diklonkan dan mereka subcloned. Kemudian mereka digunakan untuk mencari serpihan bertindih seterusnya. Semua urutan bertindih ini digunakan untuk membina peta genetik kromosom dan mencari gen sasaran. Ini adalah kaedah menganalisis panjang DNA dengan serpihan kecil yang bertindih dari perpustakaan genomik yang diperbaharui.
Teknik Berjalan Kromosom - Langkah
-
Pengasingan serpihan DNA yang mengandungi gen atau penanda yang diketahui berhampiran gen sasaran
- Penyediaan peta sekatan serpihan yang dipilih dan subcloning rantau akhir serpihan untuk digunakan sebagai siasatan
- Hibridisasi siasatan dengan serpihan bertindih seterusnya
- Penyediaan peta sekatan serpihan 1 dan subcloning rantau akhir serpihan 1 untuk digunakan sebagai siasatan untuk mengenal pasti serpihan bertindih seterusnya.
- Hibridisasi siasatan dengan serpihan bertindih seterusnya 2
-
Penyediaan peta sekatan serpihan 2 dan subcloning rantau akhir serpihan 2 untuk berfungsi sebagai siasatan untuk mengenal pasti serpihan bertindih seterusnya
Langkah -langkah di atas harus diteruskan sehingga gen sasaran atau sehingga 3 'akhir panjang urutan.
Rajah 01: Teknik berjalan kromosom
Berjalan kromosom adalah aspek penting cytogenetic dalam mencari SNP banyak organisma dan menganalisis penyakit genetik yang ditularkan dan mencari mutasi gen yang relevan.
Apa itu Jumping Kromosom?
Jumping kromosom adalah teknik yang digunakan dalam biologi molekul untuk pemetaan fizikal genom organisma. Teknik ini diperkenalkan untuk mengatasi halangan berjalan kromosom yang timbul apabila mencari kawasan DNA berulang semasa proses pengklonan. Oleh itu, teknik melompat kromosom boleh dianggap sebagai versi khas berjalan kromosom. Ini adalah kaedah yang cepat berbanding dengan berjalan kromosom dan membolehkan memintas urutan DNA berulang yang tidak terdedah untuk diklon semasa berjalan kromosom. Jumping kromosom menyempitkan jurang antara gen sasaran dan penanda yang diketahui untuk pemetaan genom.
Alat melompat kromosom bermula dengan pemotongan DNA tertentu dengan endonucleases sekatan khas dan ligation serpihan ke dalam gelung yang beralun. Kemudian primer yang direka dari urutan yang diketahui digunakan untuk menyusun gelung beralun. Primer ini membolehkan melompat dan berjujukan dengan cara alternatif. Oleh itu, ia boleh memintas urutan DNA berulang dan berjalan dengan pantas melalui kromosom untuk mencari gen sasaran.
Penemuan encod gen untuk penyakit fibrosis sista dilakukan menggunakan alat melompat kromosom. Digabungkan bersama, melompat kromosom dan berjalan dapat meningkatkan proses pemetaan genom.
Rajah 02: Jumping kromosom
Apakah perbezaan antara berjalan kromosom dan melompat?
Kromosom berjalan vs melompat | |
| Kromosom adalah alat yang digunakan dalam biologi molekul untuk pemetaan genom dan mencari gen tertentu. | Jumping Kromosom adalah alat yang digunakan untuk pemetaan fizikal genom dan penemuan pesat gen sasaran dalam kromosom. |
| Panjang perbandingan penjujukan | |
| Hanya serpihan kecil yang boleh diklonkan oleh berjalan kromosom. | Panjang yang lebih besar kromosom boleh dipetakan oleh melompat kromosom. |
| Pengklonan DNA berulang dalam kromosom | |
| Teknik berjalan kromosom mempunyai kesukaran dalam berjalan melalui urutan DNA berulang yang terdapat dalam kromosom. | Ia membolehkan melangkaui urutan DNA berulang. Oleh itu tidak ada kesukaran apabila mendapati mereka semasa penjujukan. |
| Faktor yang mempengaruhi proses | |
| Kejayaan proses bergantung pada saiz genom dan jarak yang mesti "berjalan" dari kedudukan genomik yang diketahui ke arah gen yang dikehendaki. | Kejayaan tidak bergantung pada saiz genom jarak dari penanda ke sasaran. |
| Kesan DNA yang tidak terkawal | |
| Berjalan kaki kromosom boleh dihentikan oleh serpihan DNA yang tidak terkawal. | Piccolos nota terendah boleh dimainkan adalah D4. |
| Memerlukan urutan yang diketahui | |
| Prosesnya bermula dengan gen yang diketahui berhampiran sasaran. | Proses ini memerlukan serpihan yang diketahui untuk reka bentuk primer. |
Ringkasan -Kromosom berjalan vs melompat
Berjalan kaki kromosom sering digunakan apabila diketahui bahawa gen tertentu terletak berhampiran dengan gen yang diklon sebelumnya dalam kromosom dan mungkin untuk mengenalinya dengan pengasingan berulang klon genomik bersebelahan dari perpustakaan genomik dari perpustakaan genomik dari perpustakaan genomik. Walau bagaimanapun, apabila kawasan DNA berulang ditemui semasa teknik berjalan kromosom, prosesnya tidak dapat diteruskan. Oleh itu, teknik itu pecah dari titik itu. Jumping Kromosom adalah alat biologi molekul yang mengatasi batasan ini untuk pemetaan genom. Ia memintas kawasan DNA berulang -ulang yang sukar untuk mengklon dan membantu dalam pemetaan fizikal genom. Ini adalah perbezaan utama antara berjalan kromosom dan melompat.
Rujukan:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa, dan Mitsuhiro Yanagida. "Berjalan kromosom menunjukkan urutan berulang yang sangat homolog yang hadir di semua kawasan centromere yeast fision."Jurnal EMBO. U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, Mei 1986. Web. 22 Mac. 2017
2. Taheri, Ali. "Kromosom berjalan dan melompat."Kemajuan dalam kejuruteraan genetik. Omics International, 30 Oktober. 2013. Web. 22 Mac. 2017
