Perbezaan antara CD dan ORF

The Perbezaan utama Antara CD dan ORF ialah CD adalah bahawa urutan nukleotida sebenar gen yang diterjemahkan ke dalam protein manakala ORF adalah regangan urutan DNA yang bermula dengan tapak permulaan terjemahan (mula codon) dan berakhir dengan tapak penamatan terjemahan (berhenti codon).

Gen mempunyai urutan pengekodan (CDS). Ia terdiri daripada jumlah exon gen dan codon permulaan dan codon berhenti. Ia adalah bahagian sebenar gen yang diterjemahkan dan menghasilkan protein. Bingkai bacaan terbuka atau ORF adalah urutan nukleotida yang terletak di antara codon permulaan dan kodon berhenti. Tidak ada kodon berhenti di dalam ORF yang mengganggu kod genetik yang diterjemahkan ke dalam protein. Dalam prokariot, CD dan ORF gen adalah sama.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu CD 
3. Apa itu ORF
4. Persamaan antara CD dan ORF
5. Perbandingan sampingan - CDS vs ORF dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu CD?

CD atau urutan pengekodan adalah bahagian gen yang sebenarnya diterjemahkan ke dalam protein. Ia terdiri daripada exon dan dua kodon yang dikenali sebagai codon AUG dan berhenti kodon. CDS tidak mengandungi dua kawasan yang tidak diterjemahkan: 5 'UTR dan 3 "UTR. Selain itu, intron tidak termasuk dalam CD.

Rajah 01: Urutan pengekodan

Apabila dibandingkan dengan keseluruhan genom individu, urutan pengekodan adalah sebahagian kecil. Urutan pengekodan terdiri daripada urutan nukleotida yang diperlukan untuk menjadikan urutan asid amino protein. Oleh itu, CD adalah exon pekat yang boleh dibahagikan kepada tiga kali ganda nukleotida atau kodon. Kodon menimbulkan asid amino.

Apa itu ORF?

Bingkai bacaan terbuka atau ORF adalah regangan urutan nukleotida yang berterusan yang bermula dengan codon permulaan dan berakhir dengan codon berhenti. Dengan kata -kata mudah, ORF merujuk kepada rantau urutan nukleotida yang terletak di antara kodon permulaan dan berhenti. Di antara, tidak ada codon berhenti mengganggu ORF. Urutan nukleotida antara encode start dan stop codon untuk asid amino. Umumnya, Codon Mula ATG manakala Kodon Berhenti Tag, TAA, dan TGA. ORF memberikan protein berfungsi apabila ditranskripsikan dan diterjemahkan. Oleh itu, ORF termasuk kodon permulaan, beberapa kodon di rantau pertengahan dan kodon berhenti. Menariknya, ORF mempunyai panjang yang boleh dibahagikan dengan tiga.

Rajah 02: Bingkai bacaan terbuka

Dalam prokariot, kerana tidak ada introns, orf adalah urutan pengekodan gen yang menyalin terus ke mRNA. Oleh itu, CD dan PRF sama dalam prokariot. Semasa mencari gen dalam prokariot, mudah untuk mengesan ORF dan mencari gen dalam prokariot.  Dalam eukariota, kerana terdapat intron, orf adalah urutan kodon yang terbentuk selepas pemprosesan atau splicing RNA. ORF adalah sekeping bukti yang membantu ramalan gen yang panjang ORF mungkin menjadi sebahagian daripada gen.

Apakah persamaan antara CD dan ORF?

• Dalam prokariot, CD dan ORF adalah sama.
• Kedua -duanya telah memulakan kodon dan berhenti codon.
• Mereka mempunyai sebilangan nukleotida yang boleh dibahagikan dengan tiga.
• Sebaik sahaja mereka diterjemahkan, mereka menghasilkan urutan asid amino.

Apakah perbezaan antara CD dan ORF?

CDS adalah bahagian sebenar gen yang diterjemahkan ke dalam protein manakala ORF adalah regangan DNA antara kodon permulaan dan codon berhenti. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara CD dan ORF. Tambahan pula, CDS tidak mengandungi intron, tetapi ORF mungkin mengandungi intron. CDS menyalin sepenuhnya ke dalam urutan mRNA lengkap manakala ORF boleh menjadi sebahagian daripada urutan mRNA. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara CD dan ORF.

Di bawah infographic tabulates bersebelahan perbezaan antara CD dan ORF.

Ringkasan -CDS vs ORF

CD dan ORF adalah dua bahagian penting gen. CD merujuk kepada kawasan sebenar DNA yang diterjemahkan ke dalam protein. ORF adalah urutan DNA yang bermula dengan codon mula "ATG" dan berakhir dengan mana -mana tiga kodon penamatan (TAA, TAG atau TGA). ORF mungkin menjadi sebahagian daripada mRNA lengkap gen. Walau bagaimanapun, urutan pengekodan gen transkripsi untuk menyelesaikan urutan mRNA. Semua CDS adalah ORFS. Tetapi tidak semua ORFs adalah CDSS. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara CD dan ORF.

Rujukan:

1. “Bingkai bacaan terbuka."Wikipedia, Yayasan Wikimedia, 27 Nov. 2020, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Rantau Pengekodan dalam DNA" oleh Pragpats - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Sampelorf" oleh Luongdl - Kerja Sendiri (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia