Perbezaan antara ligation tumpul dan melekit
Perbezaan utama - ligation akhir tumpul vs melekit
Endonucleases Sekatan adalah enzim khusus yang memotong DNA dua stranded (dsDNA). Mereka juga dikenali sebagai Gunting Molekul dalam Biologi Molekul. Enzim sekatan dapat mengenali urutan pendek dsDNA yang dikenal sebagai tapak pengiktirafan dan ikatan fosfodiester dan hidrogen untuk membuka helai berganda. Hasil daripada belahan oleh enzim ini, serpihan DNA dihasilkan dengan pelbagai jenis hujung seperti hujung melekit dan hujung tumpul. Ligase DNA adalah enzim yang digunakan dalam biologi molekul untuk menyertai dua helai DNA bersebelahan dengan membentuk bon baru. Langkah ini dikenali sebagai ligation dan mengikut jenis akhir DNA yang disambungkan, mereka boleh dirujuk sebagai ligation akhir tumpul dan ligation akhir melekit. Perbezaan utama antara ligation tumpul dan melekit ialah Ligation akhir tumpul berlaku di antara serpihan DNA yang mengandungi dua tumpul hujung sedangkan Ligation akhir melekit berlaku antara 5 'dan 3' overhangs. Berbanding dengan ligation akhir tumpul, ligation akhir melekit lebih efisien dan stabil.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu ligation akhir tumpul
3. Apa itu ligation akhir melekit
4. Perbandingan sampingan - Ligation akhir tumpul vs melekit
5. Ringkasan
Apa itu ligation akhir tumpul?
Beberapa endonukleases sekatan dapat memotong DNA di pangkalan yang bertentangan dan menghasilkan serpihan DNA akhir tumpul. Enzim -enzim ini dikenali sebagai pemotong akhir tumpul; Mereka melangkah terus ke tengah -tengah tapak sekatan tanpa meninggalkan pangkalan yang terkandas. Hujung tumpul juga dikenali sebagai hujung yang tidak overhanging kerana mereka tidak mempunyai pangkalan 3 'dan 5' yang menggantung di hujungnya. Kedua -dua helai itu ditamatkan dari pasangan asas di hujung tumpul. Enzim pemotongan akhir tumpul biasa adalah Ecorv Haeiii, Alui dan Smai.
Ligation Blunt End terlibat di antara dua hujung tumpul. Ia bukan ligation untuk menonjolkan pangkalan. Ligation ini kurang cekap daripada ligation akhir melekit. Walau bagaimanapun, dalam beberapa keadaan, ligation akhir tumpul menjadi lebih berfaedah daripada ligation akhir melekit, terutama ketika ligating produk PCR. Produk PCR sentiasa dihasilkan dengan hujung tumpul. Ligation akhir tumpul tidak memerlukan hujung pelengkap dalam DNA untuk ligation.
Rajah 01: Pengeluaran akhir tumpul oleh enzim Eco RV
Apa itu ligation akhir melekit?
Beberapa endonucleases sekatan dapat memotong dsDNA, meninggalkan sekeping DNA terkandas tunggal pada akhir. Hujung ini dikenali sebagai hujung melekit atau menggantung. Ligation akhir melekit berlaku di antara dua serpihan DNA yang mengandungi overhangs yang sesuai kerana hujung melekit dimiliki dengan pangkalan yang tidak berpasangan dan memerlukan pangkalan pelengkap untuk membentuk bon. Oleh itu, perlu menggunakan enzim sekatan yang sama untuk kedua -dua sumber DNA untuk menghasilkan serpihan ligating yang sepadan.
Ligation akhir melekit lebih cekap dan sering sangat diinginkan dalam proses pengklonan. Terdapat beberapa enzim sekatan yang menghasilkan hujung melekit. Mereka adalah Ecori, Bamhi, Hindiii dll.
Rajah 02: Pengeluaran akhir melekit oleh enzim Eco ri
Apakah perbezaan antara ligation akhir tumpul dan melekit?
Tumpul vs ligation akhir melekit | |
| Ligation akhir tumpul berlaku di antara dua serpihan DNA akhir tumpul. | Ligation akhir melekit berlaku di antara dua serpihan DNA yang sepadan dengan hujung melekit. |
| Enzim | |
| Pemotong akhir tumpul menghasilkan tumpul berakhir. | Pemotong akhir melekit menghasilkan hujung melekit atau kohesif. |
| Keperluan berakhir yang sepadan | |
| Ia tidak memerlukan serpihan yang sepadan atau pangkalan pelengkap. | Ia memerlukan pangkalan pelengkap di hujungnya untuk membentuk pasangan asas. |
| Kecekapan | |
| Ia kurang cekap daripada ligation akhir melekit | Ia lebih cekap daripada ligation akhir tumpul. |
Ringkasan -Ligation End Sticky Blunt vs Sticky
Endonucleases Sekatan dapat menghidupkan dsDNA dan menghasilkan serpihan DNA dengan hujung yang berbeza. Mereka mengiktiraf urutan tertentu dan menyekat DNA mencipta hujung melekit dan tumpul. Hujung melekit mempunyai pangkalan yang tidak berpasangan di hujung serpihan. Hujung tumpul dibuat kerana belahan lurus dan mereka mempunyai pasangan asas di hujungnya. Ligation akhir melekit memerlukan dua kepingan DNA terkandas tunggal pelengkap. Ligation akhir tumpul berlaku di antara mana -mana serpihan akhir tumpul. Ini adalah perbezaan antara ligation tumpul dan melekit.
Rujukan:
1. Roberts, Richard J. "Bagaimana enzim sekatan menjadi kerja biologi molekul."Prosiding Akademi Sains Kebangsaan. Sains Akad.d. Web. 12 Apr. 2017
2. Adnan, Amna. Penggunaan enzim sekatan dalam bioteknologi. N.p., n.d. Web. 12 Apr. 2017
Ihsan gambar:
1. "Laman sekatan ECORV.RSH "oleh Ramin Herati - Dibuat dengan Inkscape (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia
2. "Eco Ri Eco Ri" oleh Tinastella - Kerja Sendiri (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
