Apakah perbezaan antara endonuclease sekatan Jenis 1 2 dan 3

The Perbezaan utama antara jenis 1 2 dan 3 endonuclease sekatan adalah bahawa tapak belahan endonuclease sekatan jenis 1 adalah rawak dan jauh dari tapak pengiktirafan, manakala tapak belahan endonuclease sekatan jenis 2 berada di tapak pengiktirafan dan tapak belahan endonuclease sekatan jenis 3 adalah 20-30 pasang asas hiliran laman pengiktirafan.

Enzim endonuclease atau sekatan sekatan adalah enzim yang membantu untuk memecah DNA menjadi serpihan di atau berhampiran tapak pengiktirafan tertentu dalam molekul yang dikenali sebagai tapak sekatan. Mereka jatuh ke dalam kelas enzim kumpulan endonuclease yang lebih luas. Endonucleases sekatan biasanya diklasifikasikan kepada lima jenis mengikut struktur mereka, tapak pengiktirafan khusus di mana mereka memotong substrat DNA mereka, dan berdasarkan jika tapak pengiktirafan dan belahan dipisahkan antara satu sama lain atau tidak. Untuk memotong atau memecahkan DNA, semua enzim sekatan menghasilkan dua incisions, sekali melalui setiap tulang belakang gula-fosfat DNA double helix. Enzim sekatan hadir dalam bakteria dan archaea untuk memberikan mekanisme pertahanan terhadap pencerobohan virus.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah endonuclease sekatan jenis 1
3. Apakah endonuclease sekatan jenis 2
4. Apakah endonuclease sekatan jenis 3
5. Persamaan - Jenis 1 2 dan 3 Endonuclease sekatan
6. Jenis 1 vs 2 vs 3 endonuclease sekatan dalam bentuk jadual
7. Ringkasan - Jenis 1 vs 2 vs 3 Endonuclease sekatan

Apakah endonuclease sekatan jenis 1?

Endonuclease sekatan jenis 1 adalah kompleks enzim dengan kedua -dua aktiviti sekatan dan metilase. Ia dikenal pasti dalam dua strain yang berbeza E. coli. Enzim sekatan jenis 1 dipotong di tapak yang berbeza dan jarak rawak dari tapak pengiktirafan. Pembelahan di tapak rawak ini mengikuti proses translocation DNA. Enzim -enzim ini pelbagai fungsi dan mempunyai keupayaan untuk kedua -dua aktiviti pencernaan dan pengubahsuaian sekatan bergantung kepada status metilasi DNA yang disasarkan. Faktor-faktor bersama S-adenosil methionine (ADOMET), hidrolisis adenosine triphosphate (ATP), dan ion magnesium (mg ²⁺) adalah penting untuk aktiviti penuh mereka.

Enzim sekatan jenis 1 terdiri daripada tiga subunit yang dipanggil HSDR, HSDM, dan HSD. HSDR diperlukan untuk penghadaman sekatan. HSDM diperlukan untuk penambahan kumpulan metil untuk menjadi tuan rumah DNA. Proses ini dikenali sebagai aktiviti metiltransferase. HSDS diperlukan untuk pengiktirafan tapak pengikat DNA tertentu. Ia juga penting dalam penghadaman sekatan serta aktiviti metiltransferase.

Apakah endonuclease sekatan jenis 2?

Endonuclease sekatan jenis 2 adalah sejenis enzim sekatan yang membantu dalam mengekalkan DNA pada kedudukan tertentu, sama ada dalam atau dekat dengan tapak pengiktirafan sekatan. Mereka membentuk homodimer dengan tapak pengiktirafan yang tidak berbelah bahagi dan palindromik, dengan empat hingga lapan nukleotida panjang. Enzim sekatan jenis 2 tidak memerlukan ATP atau ADOMET untuk aktiviti mereka, tetapi MG²⁺ diperlukan sebagai cofactor. Enzim -enzim ini membantu dalam belahan ikatan fosfodiester DNA double helix. Mereka berpegang teguh di tengah -tengah kedua -dua helai untuk menghasilkan hujung tumpul atau berpegang pada kedudukan yang berperingkat meninggalkan overhangs yang dikenali sebagai hujung melekit.

Endonukleases sekatan jenis 2 adalah enzim sekatan yang paling biasa disediakan kerana ia menghasilkan serpihan diskret dengan penghadaman sekatan dengan memotong secara khusus di atau dekat dengan tapak pengiktirafan. Endonucleases sekatan jenis 2 tergolong dalam keluarga besar; Oleh itu, mereka dibahagikan kepada subfamili berdasarkan sisihan dari ciri -ciri tipikal enzim ini. Subkategori ini termasuk jenis 2b, 2e, 2f, 2g, 2s, dan 2t.

Apakah endonuclease sekatan jenis 3?

Endonuclease sekatan jenis 3 adalah sejenis enzim sekatan yang mengiktiraf dua urutan bukan palindromik berasingan yang berorientasikan terbalik. Mereka biasanya memecah DNA kira-kira 20-30 pasang asas di hilir tapak pengiktirafan. Enzim ini terdiri daripada lebih daripada satu subunit. Mereka juga memerlukan ATP dan Adomet untuk aktiviti mereka. Enzim sekatan jenis 3 adalah penting dalam mekanisme pengubahsuaian sekatan DNA prokariotik. Enzim -enzim ini membantu melindungi organisma daripada menyerang DNA asing.

Enzim jenis 3 adalah protein hetero-oligomerik dan pelbagai fungsi yang terdiri daripada dua subunit. Mereka adalah res dan mod. Subunit res adalah penting dalam penghadaman sekatan; Walau bagaimanapun, ia tidak mempunyai aktiviti enzimatik sendiri. Subunit Mod membantu dalam pengiktirafan urutan DNA yang khusus untuk sistem dan merupakan pengubahsuaian methyltransferase. Enzim sekatan jenis 3 juga mengiktiraf 5-6 pasangan asas urutan DNA asimetrik yang panjang dan berpakaian 25-27 pasang asas hiliran untuk meninggalkan protrusi 5 terkandas satu pendek. Enzim -enzim ini hanya satu helai DNA dan mencukupi untuk melindungi daripada penghadaman sekatan.

Apakah persamaan antara endonuclease sekatan Jenis 1 2 dan 3?

• Type 1, Type 2, dan Type 3 Endonuclease Sekatan adalah tiga enzim sekatan.
• Mereka bertanggungjawab untuk mengekalkan DNA di tapak tertentu yang disebut tapak pengiktirafan sekatan dalam molekul.
• Mereka tergolong dalam kelas endonuclease yang lebih luas.
• Mereka membuat dua insisi, sekali dalam setiap dua tulang belakang gula-gula dari helix double DNA.
• Mereka hadir dalam bakteria dan archaea.
• Lebih -lebih lagi, mereka membantu melindungi daripada menyerang virus.
• Ketiga enzim ini mempunyai keupayaan untuk kedua -dua pembatasan pencernaan dan aktiviti metiltransferase.
• Enzim sekatan memotong DNA asing melalui penghadaman sekatan.
• Methyltransferase adalah enzim pengubahsuaian yang terdapat dalam ketiga -tiga enzim.

Apakah perbezaan antara endonuclease sekatan Jenis 1 2 dan 3?

Tapak belahan endonuclease sekatan jenis 1 adalah rawak dan jauh dari tapak pengiktirafan, sementara dalam endonuclease sekatan jenis 2, ia berada di tapak pengiktirafan. Manakala, dalam endonuclease sekatan jenis 3, tapak belahan adalah 20-30 pasang asas di hilir tapak pengiktirafan. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara endonuclease sekatan Jenis 1 2 dan 3. Selain itu, endonuclease sekatan jenis 1 terdiri daripada tiga subunit dan dianggap sebagai enzim bifunctional dengan kedua -dua aktiviti sekatan dan metilase. Endonuclease sekatan jenis 2 terdiri daripada dua subunit dan mempunyai aktiviti sekatan dan metilase yang berasingan. Dan, endonuclease sekatan jenis 3 terdiri daripada lebih daripada satu subunit, biasanya dua, dan juga enzim bifunctional dengan kedua -dua aktiviti sekatan dan metilase.

Infographic di bawah membentangkan perbezaan antara jenis endonuclease jenis 1 2 dan 3 dalam bentuk tabular untuk perbandingan bersebelahan.

Ringkasan -Jenis 1 vs 2 vs 3 Endonuclease sekatan

Endonuclease sekatan membantu memecah DNA ke dalam serpihan di atau berhampiran tapak pengiktirafan tertentu dalam molekul. Type 1, Type 2 dan Type 3 Endonuclease Sekatan adalah tiga enzim sekatan. Tapak belahan endonuclease sekatan jenis 1 adalah rawak dan jauh dari tapak pengiktirafan. Tapak belahan endonuclease sekatan jenis 2 berada di tapak pengiktirafan, sementara tapak belahan endonuclease sekatan jenis 3 adalah 20-30 pasang asas di hilir tapak pengiktirafan. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara endonuclease sekatan Jenis 1 2 dan 3.

Rujukan:

1. Loenen, w. A., et al. "Jenis I enzim dan saudara mereka."Penyelidikan Asid Nukleik, Vol. 42, no. 1, 2013, pp. 20-44.
2. Rao, Desirazu n., et al. "Jenis enzim pengubahsuaian sekatan III: Perspektif Sejarah."Penyelidikan Asid Nukleik, Vol. 42, no. 1, 2013, pp. 45-55.
3. "Endonucleases sekatan."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.

Ihsan gambar:

1. "Langkah Pengklonan Molekul" oleh Alexpicardal97 - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Tapak Sekatan Hindiii dan Sticky Ends Vector" oleh Helixitta - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
3. "Polimorfisme panjang serpihan sekatan" oleh Lolyas39 - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia