Apakah perbezaan antara retrotransposon LTR dan bukan LTR

The Perbezaan utama Antara LTR dan bukan LTR retrotransposon adalah bahawa retrotransposon LTR adalah sejenis retrotransposon yang mempunyai berulang terminal panjang dalam struktur mereka, sementara retrotransposon bukan LTR adalah sejenis retrotransposon yang tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam struktur mereka.

Retrotransposon (Kelas I Elemen Transposable atau Transposon melalui Perantaraan RNA) adalah sejenis komponen genetik yang boleh menyalin dan menyisipkan diri ke lokasi genomik yang berbeza. Mereka melakukan ini dengan menukar RNA kembali ke DNA melalui proses yang disebut transkripsi terbalik menggunakan transposisi RNA pertengahan. Terdapat dua jenis utama retrotransposon sebagai LTR dan bukan LTR retrotransposon

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah retrotransposon LTR
3. Apakah retrotransposon bukan LTR
4. Persamaan - Retrotransposon LTR dan bukan LTR
5. LTR vs retrotransposon bukan LTR dalam bentuk jadual
6. Ringkasan - LTR vs retrotransposon bukan LTR

Apakah retrotransposon LTR?

LTR retrotransposon adalah sejenis retrotransposon yang mempunyai berulang terminal panjang dalam struktur mereka. DNA berulang yang panjang boleh didapati di setiap hujung retrotransposon LTR. Ini dikenali sebagai ulangan terminal panjang (LTR). Setiap LTR adalah beberapa ratus pasangan asas. LTR retrotransposon biasanya lebih dari 5 kilobase. Selain itu, antara berulang terminal panjang, terdapat gen yang boleh disalin bersamaan dengan gen retrovirus gag dan pol. Gen ini bertindih supaya mereka menyandikan protease yang biasanya memproses transkrip yang dihasilkan ke dalam produk gen berfungsi.

Rajah 01: LTR retrotransposon

Gag Gene of Retrotransposons membuat produk yang dikaitkan dengan transkrip retrotransposon lain untuk membentuk zarah seperti virus. Pol Gene membuat produk yang termasuk enzim seperti transkripase, integrase, dan ribonuclease H domain. Enzim transkrip terbalik menjalankan transkripsi terbalik DNA retrotransposon. Enzim Integrase mengintegrasikan DNA retrotransposon ke DNA genom eukariotik. Domain Ribonuclease H sangat membantu dalam mengikat ikatan phosphodiester antara perantaraan RNA. LTR retrotransposon juga mengodkan transkrip dengan tapak mengikat tRNA supaya mereka dapat menjalani transkripsi terbalik dengan mudah. Tambahan pula, kerana retrotransposon mengandungi maklumat genom eukariotik, ia boleh memasukkan salinan dirinya ke lokasi genom lain dalam sel eukariotik.

Apakah retrotransposon bukan LTR?

Retrotransposon bukan LTR adalah sejenis retrotransposon yang tidak mempunyai berulang terminal panjang dalam struktur mereka. Seperti retrotransposon LTR, retrotransposon bukan LTR juga mengandungi gen untuk transkripase terbalik, protein mengikat RNA, nukleus, dan kadang-kadang ribonuclease H domain. Tetapi mereka tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang; Sebaliknya, mereka mempunyai ulangan pendek yang boleh mempunyai urutan asas yang terbalik antara satu sama lain. Protein mengikat RNA mengikat kepada transposisi RNA pertengahan, dan nukleus memecahkan ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asid nukleik.

Rajah 02: Retrotransposon LTR dan bukan LTR

Walaupun mereka adalah retrotransposon, mereka tidak dapat menjalankan transkripsi terbalik menggunakan RNA pertengahan dengan cara yang sama seperti retrotransposon LTR. Ini kerana retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi urutan yang mengikat tRNA. Oleh itu, retrotransposon bukan LTR yang disalin ke mRNA dan diterjemahkan ke dalam protein bertindak sebagai transkripase terbalik. Transkripase terbalik menjadikan salinan DNA RNA Retrotransposon bukan LTR yang boleh diintegrasikan ke dalam genom di laman web baru. Tambahan pula, retrotransposon bukan LTR jatuh ke dalam dua jenis: garis (elemen nuklear yang diselaraskan) dan sine (unsur nuklear yang diselaraskan pendek).

Apakah persamaan antara retrotransposon LTR dan bukan LTR?

• Retrotransposon LTR dan bukan LTR adalah dua jenis utama retrotransposon.
• Kedua -dua jenis mengandungi gen untuk enzim seperti transkripase terbalik, protein mengikat RNA, nukleus, dan domain ribonuclease H.
• Mereka boleh didapati dalam genom manusia.
• Kedua -dua jenis ini penting evolusi.

Apakah perbezaan antara retrotransposon LTR dan bukan LTR?

LTR retrotransposon mempunyai berulang terminal panjang dalam struktur mereka, sementara retrotransposon bukan LTR kekurangan berulang terminal panjang dalam struktur mereka. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara LTR dan bukan LTR retrotransposon. Tambahan pula, retrotransposon LTR mempunyai ulangan langsung yang panjang yang hanya satu urutan asas mengulangi diri mereka. Sebaliknya, retrotransposon bukan LTR mempunyai ulangan pendek yang boleh mempunyai urutan yang terbalik di sebelah antara satu sama lain.

Infographic di bawah membentangkan perbezaan antara LTR dan bukan LTR retrotransposon dalam bentuk tabular untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -LTR vs retrotransposon bukan LTR

Retrotransposon LTR dan bukan LTR adalah dua jenis utama retrotransposon. LTR retrotransposon mempunyai berulang terminal panjang dalam struktur mereka, sementara retrotransposon bukan LTR tidak mempunyai pengulangan terminal panjang dalam struktur mereka. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara LTR dan bukan LTR retrotransposon.

Rujukan:

1. Havecker, Ericka R, et al. "Kepelbagaian Retrotransposon LTR - Biologi Genom."Biomed Central, Biomed Central, 18 Mei 2004.
2. Han, Jeffrey S. "Retrotransposon berulang terminal (bukan LTR): mekanisme, perkembangan terkini, dan soalan yang tidak dijawab-DNA mudah alih-."Biomed Central, Biomed Central, 12 Mei 2010.

Ihsan gambar:

1. "LTR Retrotransposon" oleh Mariuswalter - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Komponen Genom Manusia" oleh Alglascock - Kerja Sendiri (CC BY -SA 3.0) melalui Commons Wikimedia