Apakah perbezaan antara ITS1 dan ITS2

The Perbezaan utama antara ITS1 dan ITS2 adalah bahawa ITS1 adalah DNA spacer yang terletak antara 18 dan 5.Gen rRNA 8s dalam eukariota, manakala ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.8s dan 28S gen rRNA dalam eukariot.

Spacer yang ditranskripsikan dalaman (ITS) adalah DNA spacer yang biasanya terletak di antara RNA ribosom subunit kecil dan gen RNA ribosomal subunit besar dalam kromosom atau di rantau yang ditranskripsikan yang sepadan dalam molekul transkrip prekursor rRNA polycistronic. Dalam bakteria dan archaea, hanya ada satu gen antara 16s dan 23s gen. Tetapi dalam eukariota, terdapat dua DNA spacernya: ITS1 (antara 18 dan 5.8s gen rRNA) dan ITS2 (antara 5.8S dan 28S rRNA). Oleh itu, ITS1 dan ITS2 adalah dua DNA spacer yang terdapat di antara gen rRNA dalam eukariot.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu1 
3. Apa itu2
4. Persamaan - ITS1 dan ITS2
5. ITS1 vs ITS2 dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu1?

ITS1 adalah DNA spacer yang terletak antara 18 dan 5.8s gen rRNA dalam eukariot. Ia merujuk kepada sekeping DNA spacer yang tidak berfungsi yang terletak di antara gen rRNA. ITS1 mempunyai variasi panjang yang lebih besar daripada ITS2. Variasi panjang ITS1 adalah kira-kira (200-300bp). Penanda seperti ITS1 telah membuktikan kecekapan mereka dalam menjelaskan hubungan filogenetik di antara taksiran yang berbeza. Selain itu, DNA Spacer ITS1 kurang dipelihara daripada DNA Spacer ITS2. Struktur ITS1 hanya dipelihara dalam unit taksonomi yang lebih kecil. Setiap kluster ribosom eukariotik juga mengandungi kawasan yang disebut spacer transcribed luaran (5 'dan 3' ETS).

Rajah 01: Wilayah ITS1

DNA Spacer ITS1 sangat dekat dengan spacer transkripsi 5'external (5 'ETS). Selain itu, jika ada yang ingin menguatkan rantau ITS1 untuk kajian hubungan filogenetik, mereka perlu menggunakan pasangan primer tertentu (primer terbalik dan ke hadapan) untuk tujuan ini. Untuk menguatkan rantau ITS1, dua set primer biasanya digunakan dalam protokol PCR makmal. Mereka adalah ITS1 ke hadapan dan ITS2 terbalik atau ITS1 Foward dan ITS4 terbalik.

Apa itu2?

ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.8s dan 28S gen rRNA dalam eukariot. Rantau ITS2 mempunyai variasi panjang yang lebih pendek daripada rantau ITS1. Variasi panjang ITS2 adalah kira-kira (180-240bp). Walau bagaimanapun, rantau ITS2 lebih konservasi daripada rantau ITS1 di banyak unit taksonomi. Ia mengenal pasti bahawa semua urutan ITS2 berkongsi teras bersama struktur sekunder. Selain itu, 40% wilayah ITS2 dipelihara di kalangan semua angiosperma, sementara mungkin untuk menyelaraskan 50% rantau ITS2 di seluruh keluarga dan tahap yang lebih tinggi.

Rajah 02: Wilayah ITS2

Terlepas. Untuk menguatkan rantau ITS2, set primer tertentu biasanya digunakan dalam protokol PCR makmal. Iaitu ITS1 Foward dan ITS4 terbalik. Tetapi apabila protokol PCR menggunakan set primer ini, ia juga menguatkan rantau ITS1 bersama -sama dengan wilayah ITS2. Selanjutnya, DNA spacer ITS2 sangat dekat dengan spacer transkripsi 3'external (3 'ETS).

Persamaan antara ITS1 dan ITS2

• ITS1 dan ITS2 adalah dua DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA.
• Mereka hanya hadir di eukariota.
• Kedua -duanya dapat dikuatkan dengan menggunakan pasangan primer tertentu.
• Kedua-duanya dikeluarkan dalam pematangan rRNA sebagai produk sampingan yang tidak berfungsi.
• Kedua -duanya sangat penting untuk kajian hubungan filogenetik, terutamanya dalam barcoding DNA kulat.

Perbezaan antara ITS1 dan ITS2

ITS1 adalah DNA spacer yang hadir antara 18 dan 5.Gen rRNA 8S dalam eukariot manakala ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.8s dan 28S gen rRNA dalam eukariot. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara ITS1 dan ITS2. Tambahan pula, ITS1 mempunyai variasi panjang yang lebih besar berbanding dengan IT2. Sebaliknya, ITS2 mempunyai variasi panjang yang lebih pendek berbanding dengan IT1. Ini adalah perbezaan lain antara ITS1 dan ITS2.

Infographic di bawah menyenaraikan perbezaan antara ITS1 dan ITS2 dalam bentuk jadual untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -ITS1 vs ITS2

Rantau Transkripsi Dalaman (ITS) adalah sekeping DNA spacer yang tidak berfungsi yang terletak di antara gen rRNA. Dalam bakteria dan archaea, hanya ada satu wilayahnya. Tetapi dalam eukariota, terdapat dua wilayahnya: ITS1 dan ITS2. ITS1 adalah DNA spacer yang terletak di antara 18 dan 5.Gen rRNA 8S dalam eukariota, manakala ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.8s dan 28S gen rRNA dalam eukariot. Oleh itu, ini adalah ringkasan perbezaan antara ITS1 dan ITS2.

Rujukan:

1. "Spacer yang ditranskripsikan dalaman."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.
2. Schoch, Conrad L., et al. "Rantau Spacer Transcribed Internal Nuklear (ITS) sebagai penanda kod bar DNA sejagat untuk kulat."PNA, Akademi Sains Kebangsaan.

Ihsan gambar:

1. "Eucaryot RDNA" oleh - Firaun Han Diasumsikan - Tidak ada sumber yang boleh dibaca mesin yang disediakan. Kerja sendiri yang diandaikan (berdasarkan tuntutan hak cipta) (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Molecularmarkerssymbiodinium" oleh Allisonmlewis - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia