Apakah perbezaan antara tracrRNA dan gRNA crRNA

The Perbezaan utama Antara crRNA tracrRNA dan gRNA ialah crRNA adalah salah satu daripada dua jenis RNA CRISPR, yang melengkapi dengan urutan DNA sasaran, manakala tracrRNA adalah jenis kedua RNA CRISPR, yang berfungsi sebagai perancah mengikat untuk nukleus CAS dan GRNA adalah salah satu daripada dua komponen utama sistem CRISPR-Cas9 bakteria dan archaea yang mengiktiraf sasaran DNA dan membimbing protein CAS untuk membuat rehat dua kali dalam sasaran DNA.

CRISPR bermaksud Berulang -ulang Palindromic yang diselaraskan secara tetap. Ia adalah salah satu sistem imun dalam bakteria dan archaea. Bakteria dan Archaea Gunakan sistem ini untuk melindungi diri mereka dari patogen virus. Ini adalah salah satu mekanisme yang paling menakjubkan yang melibatkan pengubahsuaian genetik yang berjaya. Mekanisme ini (CRISPR-Cas9) digunakan sebagai alat pengeditan gen baru dalam bioteknologi. Ia telah membawa kemajuan baru kepada bioteknologi, terutamanya dalam bidang kejuruteraan genetik.

Terdapat dua komponen utama sistem CRISPR-Cas9. Mereka adalah panduan RNA (GRNA) dan CRISPR yang berkaitan (CAS). Panduan RNA adalah urutan RNA tertentu yang membimbing protein CAS untuk memecah sasaran DNA. Panduan RNA terdiri daripada dua jenis RNA. Mereka adalah RNA CRISPR (cRRNA) dan tracrRNA. Nukleus yang berkaitan. Dengan membuat rehat dua helai dalam sasaran DNA, bakteria dan archaea mengarahkan mekanisme pembaikan endogen mereka untuk menyahaktifkan DNA virus.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu crRNA  
3. Apa itu TracRRNA 
4. Apa itu GRNA
5. Persamaan - CRRNA TracRRNA dan GRNA
6. crRNA vs tracrrna vs gRNA dalam bentuk jadual
7. Ringkasan - crRNA vs tracrrna vs gRNA

Apa itu crRNA?

CrRNA atau CRISPR RNA adalah salah satu daripada dua jenis panduan RNA. Secara strukturnya, ia adalah urutan 17-20 nukleotida. Ciri crRNA yang paling berharga ialah ia melengkapi DNA sasaran. Oleh itu, crRNA sepadan dengan urutan DNA virus. Kekhususan sistem CRISPR-Cas 9 bergantung kepada crRNA. Dalam bakteria, crRNA wujud bersatu dengan urutan tracrRNA, yang merupakan jenis kedua RNA CRIPR. Pengeluaran crRNA dicetuskan oleh pendedahan semula bakteria kepada virus. Apabila terdedah, transkripsi gen yang pengekodan untuk crRNA berlaku. Kemudian, mekanisme pertahanan bermula terhadap virus.

Rajah 01: Sistem CRISPR-Cas9

Apa itu TracRRNA?

Trans-activating crRNA atau tracrRNA adalah bahagian kedua Guiderna atau CRISPR RNA. Ia diucapkan sebagai RNA Tracer.  TracRRNA berfungsi sebagai perancah mengikat untuk protein CAS 9 endonuclease. Dengan kata lain, tracrRNA berfungsi sebagai pemegang untuk membimbing Cas9 ke arah sasaran DNA. Secara struktural, tracrRNA mempunyai 42 nukleotida. Ia wujud digabungkan dengan crRNA.

Apa itu GRNA?

Panduan RNA atau GRNA adalah salah satu daripada dua komponen utama sistem imun CRISPR-Cas9. Ia adalah urutan RNA tertentu yang terdiri daripada dua elemen: crRNA dan tracrRNA. GRNA mengiktiraf DNA sasaran dan mengarahkan protein CAS untuk membuat rehat dua kali dalam sasaran DNA. Untuk melakukannya, crRNA terdiri daripada urutan pelengkap DNA sasaran manakala tracrRNA membimbing protein CAS berfungsi sebagai pemegang.

Rajah 02: GRNA

Merancang GRNA yang betul adalah langkah kritikal dalam alat pengeditan gen CRISPR-Cas9. Oleh itu, kejayaan dan kecekapan penyuntingan sistem CRISPR bergantung pada urutan GRNA yang betul. GRNA boleh dinyatakan dalam sel dari plasmid yang ditransfeksi. Apabila plasmid klon diperkenalkan ke dalam sel, sel -sel tuan rumah menjana gRNA. GRNA yang paling biasa dihasilkan terdiri daripada 100 pasangan asas.

Apakah persamaan antara tracrRNA dan gRNA crRNA?

• crRNA, tracrRNA dan gRNA adalah urutan RNA yang terdapat dalam bakteria dan archaea.
• Mereka semua tergolong dalam sistem CRISPR.
• GRNA diperbuat daripada crRNA dan tracrrna.
• Mereka terlibat dalam mengiktiraf DNA bacteriophage dan membimbing endonucleases ke arah sasaran DNA.
• Oleh itu, ketiga-tiga jenis RNA terlibat dalam mengarahkan nukleus Cas9 untuk membuat rehat dua helai dalam menyerang bahan genetik asing.
• Kejayaan eksperimen CRISPR bergantung kepada ketiga -tiga jenis RNA.

Apakah perbezaan antara tracrRNA dan gRNA crRNA?

CrRNA adalah sebahagian daripada gRNA CRISPR yang melengkapi DNA sasaran, manakala tracrRNA adalah bahagian kedua gRNA, yang berfungsi sebagai perancah yang mengikat untuk nukleus CAS. GRNA adalah gabungan crRNA dan tracrRNA, dan ia adalah salah satu daripada dua komponen sistem CRISPR-Cas9, yang mengiktiraf sasaran DNA dan panduan nukleus untuk membuat rehat dua helai dalam sasaran DNA. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara tracrRNA crRNA dan gRNA.

Jadual berikut meringkaskan perbezaan antara tracrRNA dan gRNA crRNA.

Ringkasan - crRNA vs tracrrna vs gRNA

Sistem CRISPR-Cas9 adalah sistem imun bakteria dan archaea. Sistem ini digunakan sebagai alat pengeditan gen dalam bioteknologi. CRISPR terdiri daripada dua jenis RNA, iaitu CRISPR RNA (CRRNA) dan mengurus RNA CRISPR (tracRRNA). Mereka secara kolektif dikenali sebagai Guiderna atau GRNA. RNA ini mengiktiraf urutan sasaran patogen yang menyerang dan membimbing endonucleases untuk membuat rehat dua helai dalam sasaran DNA. Setelah rehat dua helai dibuat dalam bahan genetik asing, mekanisme pembaikan endogen (akhir nonhomologous bergabung; NHEJ) tidak mengaktifkan DNA asing dengan memperkenalkan mutasi. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara tracrRNA dan gRNA crRNA.

Rujukan:

1. "Panduan RNA."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.
2. Karvelis, Tautvydas, et al. "Panduan CrRNA dan TracRRNA CAS9-Mediated DNA Gangguan di Streptococcus Thermophilus."Biologi RNA, Landes Bioscience, Mei 2013.

Ihsan gambar:

1. "CRISPR-CAS9 ACTION" oleh VIKORIASELM-Kerja Sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2. "GRNA-CAS9" oleh Marius Walter-Fail: GRNA-CAS9.PNG (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia