Apakah perbezaan antara CGH dan Array CGH

The Perbezaan utama antara cgh dan array cgh adalah bahawa CGH adalah kaedah cytogenetic molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah, manakala array CGH adalah kaedah sitogenetik molekul sepenuhnya automatik untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai a resolusi yang lebih tinggi.

CGH dan Array CGH adalah dua teknik untuk mengesan variasi nombor salinan pada individu. Salin variasi nombor merujuk kepada bahagian genom yang diulang. Nombor salin berbeza antara individu. Salin Variasi Nombor biasanya dikategorikan kepada dua kumpulan: ulangan pendek dan ulangan panjang. Salah satu contoh yang paling terkenal untuk variasi nombor salinan pendek ialah ulangi cag trinucleotide dalam gen huntingtin. Ini menyebabkan gangguan neurologi yang disebut huntingtin. Contoh terbaik untuk variasi nombor salinan berulang lama ialah gen alpha amilase, yang menyebabkan rintangan insulin. Salin Variasi Nombor boleh dikesan oleh teknik seperti ikan, cgh, dan array cgh.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu CGH 
3. Apa itu CGH Array
4. Persamaan - CGH dan Array CGH
5. Cgh vs array cgh dalam bentuk jadual
6. Ringkasan - CGH vs Array CGH

Apa itu CGH?

CGH adalah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian berbanding dengan sampel rujukan. Ia mempunyai resolusi yang lebih rendah berbanding teknik automatik. Objektif teknik ini adalah dengan cepat dan cekap membandingkan dua sampel DNA genomik yang timbul dari sumber yang berbeza.

Rajah 01: CGH

Prosedur ini melibatkan pengasingan DNA dari dua sumber: ujian dan rujukan. Kemudian langkah seterusnya adalah pelabelan bebas ujian dan sampel DNA rujukan dengan fluorophores warna yang berbeza. Kemudian, kedua-dua sampel DNA itu dinyahdan untuk mendapatkan sampel DNA tunggal yang terkandas. Akhir. Perbezaan kromosom dapat dikenalpasti antara kedua -dua sumber menggunakan mikroskop pendarfluor dan perisian komputer. Tambahan pula, teknik CGH hanya dapat mengesan keabnormalan kromosom yang tidak seimbang.

Apa itu CGH Array?

Array CGH adalah kaedah sitogenetik molekul sepenuhnya automatik untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian berbanding dengan sampel rujukan. Ia mempunyai resolusi yang lebih tinggi, dan ia dibangunkan untuk meminimumkan batasan CGH tradisional. Array CGH menggabungkan prinsip CGH dengan penggunaan microarrays. Daripada menggunakan kromosom metaphase, kaedah ini menggunakan slaid yang disusun dengan segmen kecil DNA sebagai sasaran. Microarrays ini dibuat dengan mendepositkan dan melumpuhkan sedikit DNA (probe) pada sokongan kaca pepejal. Saiz probe boleh berbeza dari oligonukleotida ke kromosom buatan bakteria.

Rajah 02: Array CGH

Tidak kira probe, kaedah asas cGH array adalah serupa dengan cgh. Setelah probe yang mengandungi microarray disediakan, kedua -dua sampel DNA (ujian dan rujukan) dilabelkan dengan fluorophores warna yang berbeza dicampur bersama dan ditambah ke microarray. Oleh kerana DNA dalam sampel adalah satu terkandas disebabkan oleh denaturasi, DNA ini hibrida dengan probe tunggal terkandas. Menggunakan sistem pengimejan digital, adalah mungkin untuk mengenal pasti perbezaan kromosom antara kedua -dua sumber.

Apakah persamaan antara cgh dan array cgh?

• CGH dan Array CGH adalah dua teknik untuk mengesan variasi nombor salinan.
• Mereka adalah kaedah sitogenetik molekul.
• Kedua -dua kaedah mendiagnosis keabnormalan kromosom yang tidak seimbang.
• Fluorophores terlibat dalam kedua -dua kaedah.
• Kedua -dua kaedah boleh digunakan untuk mengesan gangguan genetik kerana menyalin variasi nombor.
• Mereka digunakan secara meluas dalam analisis genomik perbandingan.

Apakah perbezaan antara CGH dan Array CGH?

CGH adalah kaedah cytogenetic molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah, sementara array CGH adalah kaedah sitogenetik molekul sepenuhnya automatik untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih tinggi. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara CGH dan Array CGH. Tambahan pula, dalam CGH, ujian DNA ujian dan rujukan hibrida dengan penyebaran metafase normal kromosom, tetapi dalam array CGH, ujian dan sampel DNA rujukan hibrida dengan probe DNA yang tidak bergerak yang mengandungi microarray.

Infographic di bawah menyenaraikan perbezaan antara CGH dan Array CGH dalam bentuk tabular untuk perbandingan sampingan.

Ringkasan -CGH vs Array CGH

CGH dan Array CGH adalah dua teknik sitogenetik molekul untuk mengesan keabnormalan kromosom yang tidak seimbang. Mereka digunakan secara meluas dalam analisis genomik perbandingan. CGH adalah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah. Sebaliknya, Array CGH adalah kaedah sitogenetik molekul sepenuhnya automatik untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih tinggi. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara CGH dan Array CGH.

Rujukan:

1. "Hibridasi genomik perbandingan."Gambaran Keseluruhan | Topik Sciencedirect.
2. Heather, James M., dan Benjamin Chain. "Urutan Sequencers: Sejarah penjujukan DNA."Genomik, Akademik Akhbar, 10 Nov. 2015.

Ihsan gambar:

1. "Skema CGH" oleh Mbaudis (Talk) (Muat naik) - Kerja Sendiri (CC oleh 2.5) Melalui Wikimedia Commons
2. "Protokol Array-CGH" oleh Philippe Hupé-Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Biologi Sistem Komputasi Kanser Chapman & "Hall/CRC Mathematical" Biologi, 2012 (CC By-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia