Perbezaan utama antara proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan ialah Proteomik yang disasarkan bertujuan untuk mengukur kelimpahan protein tertentu manakala proteomik yang tidak disasarkan tidak menyasarkan protein tertentu.
Proteomik adalah kajian berskala besar protein, struktur, dan fungsi mereka. Ia mengkaji keseluruhan pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma di bawah keadaan tertentu. Terdapat dua jenis proteomik sebagai proteomik yang disasarkan dan proteomik yang tidak disasarkan.
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa yang disasarkan proteomik
3. Apa yang tidak disasarkan proteomik
4. Persamaan antara proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan
5. Perbandingan sampingan - disasarkan vs proteomik yang tidak disasarkan dalam bentuk jadual
6. Ringkasan
Seperti namanya, proteomik yang disasarkan mensasarkan protein tertentu atau peptida dalam campuran kompleks protein untuk analisis. Kemudian ia menganalisis kehadiran dan kuantiti protein tertentu yang dipilih. Kaedah ini mungkin hanya untuk satu sampel atau merentas pelbagai sampel. Kaedah ini sesuai walaupun untuk kumpulan protein tertentu. Ia menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Selain itu, spektrometri massa ditambah dengan proteomik yang disasarkan menghasilkan pengukuran yang lebih tepat. Kaedah ini menggunakan spektrometer massa quadrupole triple (qqq) untuk analisisnya.
Rajah 01: Proteomik
Proteomik yang disasarkan adalah kaedah yang sesuai jika anda ingin mengesahkan jika sasaran knockdown sebenarnya ditebang atau apabila anda ingin mengukur protein/peptida tertentu dalam serum darah, cecair serebrum atau dalam sel lysate dan lain -lain. Anda juga boleh menggunakannya jika anda ingin menyemak sama ada protein tertentu secara berbeza dinyatakan di seluruh sampel atau semasa percubaan kursus masa.
Proteomik yang tidak disasarkan, seperti yang disebutkan nama, tidak mensasarkan protein atau peptida tertentu untuk analisisnya. Penemuan proteomik adalah nama lain untuk proteomik yang tidak disasarkan. Malah, ia adalah analisis yang lebih 'global'. Umumnya, melakukan proteomik yang tidak disasarkan adalah untuk menjawab soalan "Apa protein atau protein dalam sampel ini atau beberapa sampel?". Kaedah ini tidak sensitif seperti proteomik yang disasarkan. Tetapi ia dapat mengenal pasti dan mengukur banyak protein termasuk protein novel. Proteomik yang tidak disasarkan dapat menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.
Pertama, proteomik yang disasarkan adalah penentuan kehadiran dan kuantiti protein atau peptida tertentu dalam campuran kompleks protein. Sebaliknya, proteomik yang tidak disasarkan adalah kajian kuantitatif dan kualitatif protein yang terdapat dalam sampel atau sampel tanpa menargetkan protein tertentu. Proteomik yang disasarkan dilakukan dengan protein yang dipilih atau disasarkan sementara proteomik yang tidak disasarkan dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Selain itu, proteomik yang disasarkan lebih sensitif daripada proteomik yang tidak disasarkan.
Untuk meringkaskan, proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan adalah dua jenis kajian protein. Seperti yang dicadangkan oleh nama mereka, proteomik yang disasarkan mensasarkan protein tertentu sementara proteomik yang tidak disasarkan tidak menyasarkan protein tertentu. Ini adalah perbezaan antara proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan.
1. "Proteomik yang disasarkan."UC Davis Proteomics Core, tersedia di sini.
2. "Proteomik/Pengenalan kepada Proteomik."Teori Muzik/Mod - Wikibooks, Buku Terbuka untuk Dunia Terbuka, tersedia di sini.
1."Proteomics" oleh XXL7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - dipindahkan dari EN.Wikibooks ke Commons (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia