Perbezaan antara proteomik dan transkripsi

Perbezaan utama - proteomik vs transkrip
 

Teknologi OMIC adalah trend semasa, di mana biomolekul yang berbeza dari organisma dipandang sebagai koleksi keseluruhan berkaitan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi OMIC mempunyai pelbagai aplikasi. Omik yang berbeza dari sampel biologi termasuk genomik, proteomik, transkrip dan metabolomik. Proteomik melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. Ia ditakrifkan sebagai set semua protein yang dinyatakan dalam organisma, sifat struktur dan fungsinya. Oleh itu, set protein lengkap membentuk proteome. Transkripsi adalah kajian lengkap mengenai semua molekul RNA RNA (mRNA) yang hadir dalam organisma hidup. Oleh itu, transkripsi berkaitan dengan gen yang secara aktif dinyatakan dalam organisma hidup. Jumlah set mRNA dalam organisma hidup disebut sebagai transkrip. The Perbezaan utama antara proteomik dan transkripik berdasarkan jenis biomolekul. Dalam proteomik, jumlah set protein yang dinyatakan dalam organisma hidup dikaji sedangkan, dalam transkrip, jumlah mRNA organisma hidup dikaji.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu proteomik
3. Apa itu transkrip
4. Persamaan antara proteomik dan transkripsi
5. Perbandingan sampingan - Proteomik vs transkriptomik dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu proteomik?

Istilah proteomik dicipta pada tahun 1995 dan pada mulanya ditakrifkan sebagai pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Dengan kemajuan dalam kajian proteomik, ia kemudian diubahsuai untuk dianggap sebagai istilah payung di mana banyak bidang kajian dimasukkan. Pada masa ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksi, pengubahsuaiannya, aplikasinya dan kepentingan protein dipelajari. Oleh itu, banyak penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.

Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah kejayaan ini, para saintis beralih untuk mencirikan jumlah kandungan protein pada haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Aplikasi proteomik

Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik, kerana protein adalah molekul pentadbiran kebanyakan aktiviti yang disebabkan oleh pemangkin protein. Oleh itu, kajian keseluruhan protein dapat memberikan maklumat mengenai status kesihatan organisma. Sesetengah aplikasi adalah;

1. Anotasi Genom: Dengan mengkaji kandungan protein organisma, genom tepat yang bertanggungjawab untuk sebatian protein aktif dapat ditentukan. Dalam senario ini hasil dari semua genomik, transkrip dan proteomik penting.
2. Pengenalpastian penyakit / diagnostik: Proteomik digunakan dalam mengenal pasti keadaan penyakit, dengan membandingkan yang sihat dan berpenyakit
3. Untuk dilaksanakan ungkapan protein dikaji semasa percubaan.
4. Pengubahsuaian protein dan kajian interaksi: Untuk menggunakan protein di vitro keadaan atau dan dalam vivo syarat, untuk menentukan keadaan penyimpanan protein yang diekstrak ini dan mengkaji tingkah laku protein dalam in vitro, dalam vivo Dan dalam - kaedah silico.

Rajah 01: Proteomik

Terdapat teknik yang berbeza yang terlibat dalam proteomik

1. Pengekstrakan jumlah protein dan memisahkan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga boleh dipisahkan menggunakan kromatografi cecair berprestasi tinggi (HPLC).
2. Penjujukan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri massa.
3. Sebaik sahaja urutan dikenal pasti, sifat struktur dan fungsi kandungan protein dianalisis dengan menggunakan perisian berasaskan komputer dan alat bioinformatik.

Apa itu transkrip?

Istilah transkrip dicipta baru -baru ini. Transkrips adalah kajian mengenai jumlah kandungan mRNA organisma. Jumlah mRNA adalah DNA yang dinyatakan dalam organisma hidup atau sel. Koleksi lengkap mRNA dirujuk sebagai transkrip.

Langkah -langkah ke arah menganalisis transkrip termasuk,

1. Pengekstrakan RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel lajur dengan manik poli DT.
2. Penjujukan mRNA dilakukan.

Teknologi Microarray adalah satu cara biasa untuk mengenal pasti transkrip organisma. Teknik microarray melibatkan plat siasatan dengan helai pelengkap transkrip. Apabila hibridisasi, mRNA yang terdapat dalam organisma atau sel boleh dicirikan.

Rajah 02: Teknik transkripsi

Transkripsi kini digunakan secara meluas dalam bidang perubatan. Diagnostik penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama di mana transkripsi digunakan. Dengan menganalisis transkrip organisma, mRNA asing dapat dikenalpasti, dan jika ada jangkitan, dapat dikenal pasti. RNA pengekodan bukan boleh dipisahkan menggunakan teknologi transkrip. Dan juga ungkapan gen di bawah tekanan alam sekitar yang berbeza dapat dipantau.

 Apakah persamaan antara proteomik dan transkripsi?

• Kedua -duanya menjadi sebahagian daripada konsep teknologi omic.
• Kedua -duanya digunakan dalam diagnostik penyakit dan pencirian penyakit organisma.
• Kedua -dua kawasan kajian melibatkan pengekstrakan biomolekul, pemisahan langkah biomolekul dan penjujukan.

Apakah perbezaan antara proteomik dan transkripsi?

Ringkasan -Proteomik vs transkrip 

Omics memainkan peranan penting dalam bidang sains hayat. Proteomik merujuk kepada kajian protein yang membentuk koleksi protein lengkap dalam sel atau organisma. Transkripik merujuk kepada kajian transkrip yang merupakan set lengkap DNA yang dinyatakan dalam bentuk mRNA. Kedua -dua bidang kajian, proteomik dan transkripsi, diperolehi selepas pengenalan genomik dan kini digunakan secara meluas dalam diagnostik perubatan dan dalam pencirian dan pemeriksaan organisma. Ini adalah perbezaan antara proteomik dan transkripsi.

Muat turun PDF Proteomics vs Transcriptomics

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian mengikut nota petikan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan antara proteomik dan transkripsi

Rujukan:

1.Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. Teknologi "Omic ': Genomik, Transkrip, Proteomik dan Metabolomik."The Obstetrician & Gynecologist, Blackwell Publishing Inc, 18 Julai 2011. Terdapat di sini  
2.Graves, Paul R., dan Timothy a. J. Haystead. "Panduan Biologi Molekul untuk Proteomik."Mikrobiologi dan ulasan biologi molekul, Persatuan Amerika untuk Mikrobiologi, Mar. 2002. Terdapat di sini
3.Lowe, Rohan, et al. "Teknologi Transkrip."PLOS Computational Biology, Perpustakaan Awam Sains, Mei 2017. Terdapat di sini  

Ihsan gambar:

1.'Proteomics'by xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - dipindahkan dari en.Wikibooks ke Commons., (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2.'Microarray dan Sequencing Flow Cell'By Thomas Shafee - Kerja Sendiri, (CC oleh 4.0) melalui Commons Wikimedia