Perbezaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik

The Perbezaan utama antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik ialah Homologi merujuk kepada pernyataan mengenai keturunan evolusi biasa dua urutan sementara persamaan merujuk kepada tahap rupa antara dua urutan.

Bioinformatik adalah bidang sains yang menggabungkan biologi, kejuruteraan maklumat, sains komputer, matematik dan statistik untuk menganalisis dan mentafsir data biologi. Homologi dan persamaan adalah dua istilah yang kami gunakan dalam bidang bioinformatik. Kita dapat dengan mudah mengira persamaan sebagai peratusan sisa -sisa yang sama sepanjang panjang penjajaran. Walau bagaimanapun, kita tidak dapat mengira homologi kerana ia boleh benar atau palsu dan biasanya bergantung pada hipotesis yang digunakan.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah homologi dalam bioinformatik
3. Apa persamaan dalam bioinformatik
4. Persamaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik
5. Perbandingan sampingan -homologi vs persamaan dalam bioinformatik dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apakah homologi dalam bioinformatik?

Homologi dalam bioinformatik merujuk kepada homologi biologi antara urutan DNA, RNA dan protein yang ditakrifkan dari segi sifat nenek moyang yang dikongsi dalam pokok evolusi kehidupan. Dengan kata lain, ia adalah keturunan evolusi biasa dua urutan. Sebab kejadian sedemikian mungkin disebabkan oleh peristiwa spesiasi (orthologs), peristiwa pemindahan gen mendatar (xenolog) atau peristiwa duplikasi (paralogs).

Rajah 01: Penjajaran urutan berganda

Adalah mungkin untuk menyimpulkan homologi antara DNA, RNA atau protein oleh asid amino atau kesamaan urutan nukleotida mereka. Persamaan yang signifikan berfungsi sebagai harta bukti yang kuat untuk menyimpulkan bahawa dua urutan berkaitan dengan urutan nenek moyang yang sama dengan perubahan evolusi. Penjajaran pelbagai urutan menunjukkan kawasan setiap urutan dengan sifat homologus.

Apa persamaan dalam bioinformatik?

Dalam bioinformatik, persamaan menilai persamaan antara dua protein atau urutan nukleotida. Terdapat dua langkah utama untuk proses ini. Langkah awal adalah penjajaran pasangan yang bijak, yang membantu mencari penjajaran optimum antara dua urutan (termasuk jurang) menggunakan algoritma seperti Blast, Fasta, dan Lalign. Selepas penjajaran pasangan, perlu mendapatkan dua parameter kuantitatif dari setiap perbandingan pasangan. Mereka adalah identiti dan persamaan.  Dalam letupan, persamaan carian dikenali sebagai positif.

Rajah 02: Penjajaran pasangan

Mutasi konservatif berlaku apabila asid amino bermutasi kepada sisa yang sama semasa memelihara sifat fisiokimia. Sebagai contoh, jika arginine bermutasi ke lisin dengan +1 caj positif, ia diterima kerana kedua -dua asid amino adalah serupa dalam harta dan tidak mengubah protein yang diterjemahkan. Oleh itu, pengukuran persamaan bergantung kepada kriteria bagaimana dua residu asid amino antara satu sama lain.

Apakah persamaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik?

• Homologi dan persamaan adalah dua istilah teknikal yang kita hadapi dalam bioinformatik.
• Selain itu, kedua -dua istilah merujuk kepada analisis molekul urutan.

Apakah perbezaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik?

Homologi merujuk kepada pernyataan mengenai keturunan evolusi biasa dua urutan sementara persamaan merujuk kepada tahap rupa antara dua urutan. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik. Di samping itu, homologi tidak dapat dikira kerana ia boleh menjadi benar atau palsu dan biasanya bergantung pada hipotesis sementara persamaan dapat dikira dengan mudah sebagai peratusan sisa -sisa yang serupa dengan panjang penjajaran. Oleh itu, ini adalah perbezaan yang signifikan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik.

Infographic berikut menyenaraikan perbezaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik.

Ringkasan -Homology vs Persamaan dalam Bioinformatik

Ringkasnya, perbezaan utama antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik terletak pada definisi mereka. Homologi adalah pernyataan keturunan evolusi biasa dua urutan manakala persamaan adalah rupa antara dua urutan. Homologi berlaku disebabkan oleh orthologs, paralogs, dan xenologs. Apabila menyimpulkan persamaan, ada kemungkinan untuk menggunakan algoritma seperti fasta, letupan, dan lalign. Homologi tidak dapat dinyatakan sebagai pengiraan, tetapi persamaan dapat dinyatakan sebagai peratusan sisa -sisa yang serupa dengan panjang penjajaran. Oleh itu, ini adalah ringkasan perbezaan antara homologi dan persamaan dalam bioinformatik.

Rujukan:

1."Homolog."Homolog - Bioinformatik.Org wiki, boleh didapati di sini.
2. "Identiti dan persamaan - ukuran kuantitatif."Identiti dan Persamaan - ukuran kuantitatif, tersedia di sini.

Ihsan gambar:

1. "Petikan penjajaran urutan berganda protein TMEM66" oleh Wikid25 - Clustalw sumber terbuka dan urutan dari pangkalan data protein NCBI awam (CC0) melalui Commons Wikimedia
2. "Penjajaran pasangan global" oleh Alfat003 - Kerja Sendiri (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia