The Perbezaan utama antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid adalah bahawa Pengasingan DNA genomik mensasarkan pengekstrakan DNA genomik manakala pengasingan DNA plasmid mensasarkan pengekstrakan DNA plasmid bakteria.
Pengasingan DNA adalah proses kimia yang digunakan untuk mengasingkan DNA dari spesies yang berbeza atau dari pelbagai sampel. Pengasingan DNA adalah penting dalam teknik biologi molekul hiliran, seperti elektroforesis gel, tindak balas rantai polimerase dan teknik penjujukan DNA. Oleh itu, pengasingan DNA adalah proses kimia penting dalam kajian biologi molekul. Berdasarkan tujuan penyelidikan, kadang -kadang perlu mengasingkan DNA genomik. Di samping itu, beberapa kajian memberi tumpuan kepada mengasingkan DNA plasmid dari bakteria. Pengasingan DNA genomik adalah proses mengasingkan DNA genomik dari prokariotik atau sampel eukariotik. Langkah -langkah pengasingan berbeza mengikut jenis sel di mana DNA mengasingkan. Pengasingan DNA plasmid adalah proses mengasingkan DNA plasmid dari sel bakteria. Sebagai perbandingan dengan pengasingan DNA genomik, proses keseluruhannya kompleks dalam pengasingan DNA plasmid.
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah pengasingan DNA genomik
3. Apakah pengasingan DNA plasmid
4. Persamaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid
5. Perbandingan sampingan - DNA genomik vs pengasingan DNA plasmid dalam bentuk jadual
6. Ringkasan
Pengasingan DNA Genomik adalah proses mengekstrak DNA genomik keseluruhan organisma. Proses ini melibatkan tiga peristiwa utama. Mereka adalah, lisis sel atau lisis nuklear, degradasi protein atau proteolisis dan pemendakan DNA genomik. Langkah lisis mungkin berbeza mengikut jenis sel. Dalam prokariot, kerana terdapat dinding sel peptidoglycan, langkah pertama harus menjadi pecahan dinding sel. Sebaliknya, dalam eukariota, langkah lisis melibatkan pecahan membran plasma dan membran nuklear untuk mengeluarkan DNA ke luar. Sebaliknya, langkah -langkah khas adalah penting untuk melengkapkan dinding sel dan kulat.
Rajah 01: Pengasingan DNA genomik
Oleh itu, apabila langkah lisis selesai, akhirnya DNA akan datang ke supernatan. Pada masa yang sama, kemerosotan protein juga berlaku dalam larutan kerana penambahan proteinase k. Langkah seterusnya adalah untuk memisahkan DNA genomik dan protein yang terdegradasi antara satu sama lain. Oleh itu, protein yang terdegradasi terpisah dengan hujan yang membolehkan DNA genomik kekal di supernatan. Selepas pemendakan protein, DNA genomik dapat dicetuskan dan digantung semula dalam penampan yang sesuai sehingga memerlukan eksperimen.
DNA Genomik, yang merupakan DNA linear mengandungi semua maklumat genetik organisma. Dalam erti kata lain, genom adalah bahan keturunan organisma hidup yang bertanggungjawab untuk semua aktiviti struktur dan fungsi sel. Ia terdiri daripada urutan DNA pengekodan dan bukan pengekodan. Apabila mengasingkan DNA genomik, ia termasuk seluruh genom organisma.
Pengasingan DNA plasmid adalah proses pengasingan DNA yang istimewa dan lebih rumit. Plasmid adalah DNA extrachromosomal yang terdapat di kebanyakan sel bakteria. Mereka adalah DNA pekeliling yang tidak aktif yang menyokong bakteria untuk bertahan dalam keadaan persekitaran yang teruk. DNA plasmid terdiri daripada gen tahan khas yang memberikan kelebihan tambahan kepada bakteria seperti rintangan antibiotik, sifat virulensi dan sifat toksik.
Rajah 02: Pengasingan DNA plasmid
Pengasingan DNA plasmid juga melibatkan tiga proses utama; lisis sel, proteinolisis dan pemendakan DNA. Walaupun mekanisme pengasingan biokimia serupa dengan pengasingan DNA genomik, prosesnya lebih kompleks daripada itu. Proses lisis sel adalah proses yang paling penting dalam prosedur ini. Paling penting, DNA DNA genomik dan plasmid tidak boleh dicampur antara satu sama lain. Oleh itu, proses lisis yang lebih ringan menggabungkan prosedur pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, dalam kebanyakan prosedur pengasingan DNA plasmid menggunakan detergen; natrium dodecil sulfat untuk lisis sel.
Pengasingan DNA genomik memberi tumpuan kepada pengekstrakan keseluruhan DNA genomik organisma sasaran manakala pengasingan DNA plasmid memberi tumpuan kepada mengasingkan hanya DNA plasmid dari spesies bakteria tertentu. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid. Selain itu, perbezaan lain antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid ada dalam prosedur. Pengasingan DNA genomik adalah prosedur yang kurang kompleks berbanding dengan pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, apabila mengasingkan DNA plasmid, perlu mengambil langkah berjaga -jaga untuk mencegah pencampuran DNA genomik dan plasmid antara satu sama lain.
Infograohic di bawah memberikan butiran lanjut mengenai perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.
Pengasingan DNA adalah proses penting dalam teknik biologi molekul. Terdapat dua jenis DNA iaitu DNA genomik dan DNA plasmid (DNA ekstra-kromosom). Berdasarkan keperluan, beberapa prosedur yang dijalankan untuk mengasingkan DNA genomik manakala beberapa prosedur memberi tumpuan hanya DNA plasmid dari bakteria. Oleh itu, langkah -langkah yang terlibat dalam kedua -dua proses berbeza sedikit antara satu sama lain. Walau bagaimanapun, proses keseluruhan adalah sama dalam kedua -dua pengasingan. DNA terpencil dari kedua -dua proses mempunyai penggunaan yang besar dalam proses hiliran seperti pengklonan, elektroforesis gel dan tindak balas rantai polimerase. Pada akhir protokol pengasingan DNA genomik, seluruh DNA genomik organisma dapat diasingkan sebagai produk akhir sementara pada akhir protokol pengasingan DNA plasmid, DNA plasmid bakteria masing -masing dapat diasingkan sebagai produk akhir. Oleh itu, ini adalah perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.
1."Pengekstrakan DNA dari bakteria." Pengekstrakan DNA dari bakteria. Terdapat di sini
1."Pengekstrakan DNA" oleh Joo Nath - Kerja Sendiri, (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2."Plasmid Miniprep" oleh Retama - Kerja Sendiri, (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia