Perbezaan antara CRISPR dan RNAi

Kunci Beza - CRISPR Vs RNAi
 

Pengeditan genom dan pengubahsuaian gen adalah bidang yang akan datang dalam genetik dan biologi molekul. Pengubahsuaian gen digunakan secara meluas untuk kajian terapi gen dan juga digunakan untuk mengenal pasti sifat -sifat gen, fungsi gen dan bagaimana mutasi dalam gen dapat mempengaruhi fungsinya. Adalah penting untuk membangunkan cara yang cekap dan boleh dipercayai untuk membuat perubahan yang tepat dan sasaran kepada genom sel hidup. Teknik seperti CRISPR dan RNAi digunakan untuk mengubah suai gen dengan ketepatan yang tinggi. CRISPR atau berkerumun secara kerap merentasi Palindromic Repeats pendek adalah mekanisme pertahanan imun prokariotik yang baru -baru ini yang baru -baru ini digunakan untuk penyuntingan dan pengubahsuaian gen eukariotik. Gangguan RNAi atau RNA adalah kaedah khusus urutan untuk membungkam gen dengan memperkenalkan RNA kecil terkandas kecil yang mengantara dengan asid nukleik dan mengawal ekspresi gen. Ini adalah Perbezaan utama Antara CRISPR dan RNAi.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu CRISPR
3. Apa itu RNAi
4. Persamaan antara CRISPR dan RNAi
5. Perbandingan sampingan - CRISPR vs RNAi dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu CRISPR?

Sistem CRISPR adalah mekanisme semulajadi yang terdapat di beberapa bakteria termasuk E. coli dan Archea. Ini adalah perlindungan imun adaptif terhadap pencerobohan berasaskan DNA asing. Ia adalah mekanisme khusus urutan. Sistem CRISPR mengandungi beberapa elemen berulang DNA. Unsur -unsur ini diselingi dengan urutan pendek "spacer" yang diperolehi daripada DNA asing dan pelbagai gen CAS.  Beberapa gen CAS adalah nukleus. Oleh itu, sistem imun lengkap dirujuk sebagai sistem CRISPR/CAS.

Rajah 01: Sistem CRISPR/ CAS

The Sistem CRISPR/CAS fungsi dalam empat langkah.

1. Sistem ini secara genetik tethering menyerang phage dan segmen DNA plasmid (spacers) ke loci CRISPR (dipanggil langkah pemerolehan spacer).
2. Langkah pematangan crRNA - Tuan rumah menyalin dan memproses loci CRISPR untuk menghasilkan RNA CRIPR yang matang (crRNA) yang mengandungi kedua -dua elemen berulang CRISPR dan elemen spacer bersepadu.
3. Pengesanan CrRNA - Ini difasilitasi oleh pasangan asas pelengkap. Ini penting apabila jangkitan hadir dan ejen berjangkit hadir.
4. Langkah Gangguan Sasaran - CRRNA mengesan DNA asing, membentuk kompleks dengan DNA asing dan melindungi tuan rumah terhadap DNA asing.

Pada masa ini, sistem CRISPR/Cas digunakan untuk mengubah atau mengubah suai genom mamalia oleh penindasan atau pengaktifan transkripsi sama ada. Sel -sel mamalia dapat bertindak balas terhadap rehat DNA CRISPR/Cas9 yang dimediasi dengan mengadopsi mekanisme pembaikan. Sama ada boleh dilakukan dengan menggunakan kaedah penyertaan akhir homolog (NHEJ) atau homologi yang diarahkan (HDR). Kedua -dua mekanisme pembaikan ini berlangsung dengan memperkenalkan rehat terkandas berganda. Ini mengakibatkan penyuntingan gen mamalia.  Oleh itu, pada masa ini sistem CRISPR/ CAS digunakan dalam bidang aplikasi terapeutik, bioperubatan, pertanian dan penyelidikan.

Apa itu RNAi?

Gangguan RNA adalah teknik pengantara RNA dua stranded, yang digunakan untuk mengawal ekspresi gen. Kompaun utama yang terlibat adalah RNA yang mengganggu kecil (siRNA). SiRNA adalah jenis khas RNA berganda dengan 3 'overhang dua nukleotida, dan kumpulan fosfat 5'. RNA yang disebabkan oleh kompleks pembasmian (RISC) dibentuk semasa gangguan RNA yang akan mengakibatkan kemerosotan gen yang terikat pada siRNA.

Rajah 02: RNAi

Prosedur RNAi adalah seperti berikut.

1. RNA dua stranded akan diproses dalam sitoplasma oleh endoribonuclease jenis RNase III
2. Pemindahan Dicer terikat siRNA ke Argonaute, dengan bantuan protein mengikat RNA dua kali ganda (DSRNABP).
3. Mengikat Argonaute ke satu helai dupleks (Strand Panduan). Ini akan menggantikan helai yang lain. Ini menghasilkan keseluruhan protein - kompleks RNA yang dipanggil RISC.
4. Pasangan kompleks RISC dengan RNA panduan terkandas tunggal ke Argonaute.
5. Pasangan sasaran RNA homolog dengan RNA panduan.
6. Pengaktifan Argonaute mengakibatkan kemerosotan RNA sasaran

Apakah persamaan antara CRISPR dan RNAi?

• Kedua -duanya digunakan sebagai ekspresi gen yang mengubah alat penyelidikan

Apakah perbezaan antara CRISPR dan RNAi?

Ringkasan -CRISPR vs RNAi

Crispr atau Berkelompok Palindromic pendek berkerumun adalah mekanisme pertahanan imun prokariotik yang baru -baru ini yang telah digunakan untuk penyuntingan dan pengubahsuaian gen eukariotik. Rnai atau Gangguan RNA adalah kaedah khusus urutan untuk membungkam gen dengan memperkenalkan RNA dua stranded kecil yang mengantara dengan asid nukleik dan mengawal ekspresi gen. Ini boleh diambil sebagai perbezaan asas antara CRISPR dan RNAi. Kedua -dua Teknik, CRISPR/CAS dan RNAi, adalah alat yang kuat untuk manipulasi gen walaupun CRISPR/CAS pastinya lebih unggul daripada RNAi kerana ia boleh digunakan untuk mendorong kedua -dua penyisipan dan penghapusan. Kekhususan juga tinggi dalam sistem CRISPR/ CAS.

Muat turun versi PDF CRISPR vs RNAi

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian mengikut nota petikan. Sila muat turun versi pdf di sini perbezaan antara CRISPR dan RNAi 

Rujukan:

1.Biolabs, New England. "CRISPR/CAS9 dan penyuntingan genom yang disasarkan: era baru dalam biologi molekul."CRISPR/CAS9 dan penyuntingan genom yang disasarkan: era baru dalam biologi molekul | NEB. Diakses 22 Sept. 2017. Terdapat di sini 
2."Gangguan RNA (RNAi)."Pusat Kebangsaan Maklumat Bioteknologi, U.S. Perpustakaan Perubatan Negara. Diakses 22 Sept. 2017. Terdapat di sini
3.Unniyampurath, Unnikrishnan, et al. "Gangguan RNA di Zaman CRISPR: Adakah CRISPR mengganggu RNAi?"Jurnal Antarabangsa Sains Molekul, MDPI, MAR. 2016. Diakses 22 Sept. 2017. Terdapat di sini

Ihsan gambar:

1.'Tahap Immunity CRISPR'by Ctskennerton - Kerja Sendiri, (CC BY -SA 4.0) melalui Commons Wikimedia 
2.'RNAi -Simplified'By angka ini disesuaikan dari satu oleh matzke ma, matzke ajm - angka ini disesuaikan dari satu oleh matzke ma, matzke ajm (2004) menanam biji paradigma baru. Plos Biol 2 (5). (CC oleh 2.5) Melalui Comons Wikimedia