Perbezaan antara benzonase dan DNase

Perbezaan utama - Benzonase vs DNase
 

Degradasi asid nukleik adalah penting untuk banyak teknik biologi molekul. Ia digunakan secara meluas dalam teknologi DNA rekombinan untuk menghilangkan serpihan DNA dan RNA yang tidak diingini. Enzim yang merendahkan asid nukleik dirujuk sebagai nukleus, dan ia boleh menjadi pelbagai jenis berdasarkan fungsi yang diperlukan. Nukleus yang merendahkan DNA dikenali sebagai DNAse manakala yang merendahkan RNA diketahui RNASE. Enzim ini kebanyakannya digunakan in vitro Eksperimen di mana dalam vitro Ujian molekul dijalankan untuk mengasingkan DNA tulen, RNA atau protein. Benzonase adalah sejenis nukleus yang merendahkan kedua -dua DNA dan RNA manakala DNAses merendahkan hanya DNA. Ini adalah perbezaan utama antara benzonase dan dnase.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu benzonase
3. Apa itu DNase
4. Persamaan antara benzonase dan DNase
5. Perbandingan sampingan - benzonase vs dnase dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu benzonase?

Benzonase adalah endonuclease yang direka bentuk secara genetik dari Serratia Marcescens. Enzim ini dihasilkan di E. coli Tuan rumah dalam skala perindustrian. Benzonase mampu mengekalkan DNA dua stranded, DNA linear, DNA bulat dan RNA tunggal terkandas. Oleh itu benzonase adalah penting secara komersial.  Enzim benzonase adalah dimer protein yang mempunyai 245 asid amino yang sama, ~ 30 kDa subunit dengan dua ikatan disulfida penting. Benzonase menjaringkan asid nukleik pada akhir 5 'dan menghasilkan serpihan dengan 5'ends percuma. Benzonase boleh memecah asid nukleat di mana -mana urutan tetapi lebih suka kawasan kaya GC.

Benzonase disimpan pada -20 ⁰C. PH optimum untuk aktiviti enzim didapati 8.0 - 9.2. Aplikasi benzonase termasuk penyediaan sampel untuk elektroforesis gel 2D protein di mana benzonase menghilangkan asid nukleik terikat dan penyingkiran bahan pencemar asid nukleik dari persediaan protein rekombinan. Ia juga digunakan untuk mengurangkan kelikatan ekstrak protein dan mencegah sel -sel sel dalam campuran sel.

Apa itu DNase?

DNase adalah enzim nukleus, hidrolisis yang hanya mampu mengekalkan DNA dua stranded. Terdapat dua jenis utama DNAs: DNase I dan DNase II. DNase I mengambil bahagian dalam DNA terkandas dua kali untuk menghasilkan polynucleotides dengan 5 'hujung percuma. DNase II terlibat dalam mengepung DNA berganda untuk menghasilkan helai polynucleotide dengan 3 'hujung percuma atau overhangs.

Dnase i

DNase I berfungsi pada pH optimum antara 7.0 - 8.0. Aktiviti enzim bergantung kepada banyak cofactors ionik yang termasuk, CA²⁺, Mg²⁺ atau Mn²⁺. Aktiviti mg²⁺ dan Mn²⁺ memutuskan fungsi DNase I. Dengan kehadiran mg²⁺, Dnase i cleaves setiap helai dsDNA secara bebas. Ini berlaku secara rawak. Sebaliknya, dengan kehadiran Mn^2+, Enzim itu memecah kedua -dua helai DNA di sekitar tapak yang sama. Pembelahan ini akan menghasilkan dua jenis serpihan DNA; satu jenis dengan hujung tumpul dan jenis lain dengan satu atau dua nukleotida overhangs.

Rajah 02: DNase

DNase II

Fungsi DNase II pada pH optimum 4.5-5.0 dan ion logam divalen diperlukan untuk aktivitinya, sama dengan DNase I. Mekanisme DNase II diketahui terdiri daripada tiga langkah utama.

1. Berbilang hentangan tunggal disebabkan oleh tulang belakang DNA.
2. Nukleotida larut asid dan oligonukleotida dihasilkan.
3. Peralihan hyperchromic bukan linear berlaku pada fasa terakhir.

Inhibitor utama enzim DNase termasuk chelator logam, logam peralihan dan bahan kimia seperti natrium dodecil sulfat dan β - mercaptoethanol.

Aplikasi utama DNase termasuk penyediaan ekstrak RNA bebas DNA dan ekstrak protein, dan penyingkiran DNA templat semasa eksperimen transkripsi in vitro.

Apakah persamaan antara benzonase dan DNase?

• Kedua -duanya adalah enzim hidrolitik.
• Kedua -duanya adalah nukleus.
• Kedua -duanya mengambil bahagian dengan mengekalkan ikatan fosfodiester asid nukleik.
• Kedua -duanya memerlukan suhu pH dan penyimpanan optimum untuk mengekalkan aktiviti enzim.
• Inhibitor enzim termasuk agen chelating, logam peralihan, dan bahan kimia detergen.
• Aplikasi terutamanya tertumpu pada mendapatkan ekstrak kesucian tinggi DNA, RNA, dan protein.
• Kedua -dua enzim boleh dihasilkan melalui kejuruteraan genetik.

Apakah perbezaan antara benzonase dan DNase?

Ringkasan -Benzonase vs DNase

Enzim nukleus digunakan secara meluas dalam prosedur eksperimen yang berbeza berkaitan dengan biologi molekul dan kejuruteraan genetik. Benzonase dan DNase adalah dua jenis nukleus. Benzonase terlibat dalam merendahkan kedua-dua DNA dan RNA manakala DNase terlibat dalam DNA terkandas dua. Ini adalah perbezaan asas antara benzonase dan dnase. Pada masa ini, kedua -dua jenis nukleus ini dihasilkan melalui teknologi DNA rekombinan yang menghasilkan enzim kualiti yang lebih tinggi yang dioptimumkan untuk pengeluaran maksimum.

Muat turun versi PDF Benzonase vs DNase

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian mengikut nota petikan. Sila muat turun versi pdf di sini perbezaan antara benzonase dan dnase

Rujukan:

1."Deoxyribonuclease I dari pankreas bovine D5025."Sigma-Aldrich, boleh didapati di sini. Diakses 19 Sept. 2017.
2. "Deoxyribonuclease II."Deoxyribonuclease II - Manual Enzim Worthington, tersedia di sini. Diakses 19 Sept. 2017.

Ihsan gambar:

1."DNase Hypersensitive Site" oleh Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) Korelasi antara pengedaran tapak hipersensitif DNase I dan ekspresi gen dalam sel HeLa S3. PLOS One 7 (8): E42414. doi: 10.1371/Jurnal.panda.0042414 (CC BY-SA 2.5) Melalui Wikimedia Commons