Perbezaan antara pembaikan pengasingan asas dan pembaikan pengasingan nukleotida
Perbezaan utama - Pembaikan Pengasingan Asas vs Pembaikan Pengecualian Nukleotida
DNA sering tertakluk kepada kerosakan kerana pelbagai faktor dalaman dan luaran. Walau bagaimanapun sistem pembaikan selular dengan serta -merta dan sentiasa membetulkan kerosakan sebelum mereka menjadi mutasi atau sebelum mereka dipindahkan ke generasi yang berjaya. Terdapat tiga jenis sistem pembaikan pengasingan dalam sel: Pembaikan Pengasingan Nukleotida (NER), Pembaikan Pengasingan Asas (BER), dan Pembaikan Mismatch DNA (MMR) untuk membaiki kerosakan DNA terkandas tunggal. Perbezaan utama antara pembaikan pengasingan asas dan pembaikan pengasingan nukleotida ialah Pembaikan Pengasingan Asas adalah sistem pembaikan mudah yang berfungsi di dalam sel untuk membaiki kerosakan nukleotida tunggal yang disebabkan oleh endogen manakala Pembaikan Pengecualian Nukleotida adalah sistem pembaikan yang kompleks yang berfungsi di dalam sel untuk membaiki kawasan yang lebih besar dan rosak menyebabkan eksogen.
Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah pembaikan pengasingan asas
3. Apakah pembaikan pengasingan nukleotida
4. Perbandingan sampingan - Pembaikan Pengasingan Asas vs Pembaikan Pengecualian Nukleotida
5. Ringkasan
Apakah pembaikan pengasingan asas?
Pembaikan Pengasingan Asas adalah versi sistem pembaikan DNA yang paling mudah. Ia digunakan untuk membaiki kerosakan kecil dalam DNA. Pangkalan DNA diubahsuai kerana deaminasi atau alkilasi. Apabila terdapat kerosakan asas, glycosylase DNA mengiktiraf dan mengaktifkan sistem pembaikan pengasingan asas dan memulihkannya dengan bantuan enzim AP endonuclease, polimerase DNA, dan ligase DNA. Langkah -langkah berikut terlibat dalam sistem BER.
- Pengiktirafan dan penyingkiran asas yang salah atau rosak oleh glikosilase DNA untuk mewujudkan tapak abasic (tapak kehilangan asas -apiurinic atau apyrimidinic).
- Incision tapak abasic oleh endonuclease apurinik/apyrimidinic
- Penyingkiran serpihan gula yang tinggal oleh lyase atau fosfodiesterase
- Jurang mengisi oleh polimerase DNA
- Pengedap Nick oleh ligase DNA
Rajah 01: Laluan Pembaikan Pengasingan Asas
Apakah pembaikan pengasingan nukleotida?
Pembaikan Pengasingan Nukleotida (NER) adalah sistem pembaikan pengasingan DNA penting dalam sel. Ia dapat membaiki dan menggantikan kawasan yang rosak sehingga 30 pangkalan panjang dan diarahkan oleh helai templat yang tidak rosak. Kerosakan DNA biasa berlaku disebabkan oleh sinaran ultraviolet dan NER melindungi DNA dengan membaiki kerosakan tersebut sebelum menjadi mutasi dan lulus ke generasi akan datang atau menyebabkan penyakit. NER secara khusus memberikan perlindungan terhadap mutasi yang disebabkan secara tidak langsung oleh faktor eksogen seperti karsinogen alam sekitar dan kimia. NER dilihat dalam hampir semua organisma, dan ia mengiktiraf kerosakan yang menyebabkan herotan yang ketara dalam helix DNA.
Proses NER melibatkan tindakan banyak protein seperti XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, dan lain -lain. dan diteruskan melalui beberapa mekanisme pemotongan dan tampal. Protein -protein tersebut adalah penting untuk menyelesaikan proses pembaikan, dan kecacatan dalam salah satu protein NER adalah penting dan boleh menyebabkan sindrom resesif yang jarang berlaku: Xeroderma pigmentosum (XP), sindrom Cockayne (CS) dan bentuk photosensitif gangguan rambut rapuh Trichothiodystrophy (TTD).
Rajah 02: Pembaikan pengasingan nukleotida
Apakah perbezaan antara pembaikan pengasingan asas dan pembaikan pengasingan nukleotida?
Pembaikan Pengasingan Asas Vs Pembaikan Pengecualian Nukleotida | |
| Pembaikan Pengasingan Asas (BER) adalah sistem pembaikan DNA berlaku di sel. | Pembaikan Pengasingan Nukleotida (NER) adalah satu lagi jenis sistem pembaikan DNA yang terdapat di sel. |
| Mengiktiraf tambahan DNA | |
| BER membaiki kerosakan kepada penambahan DNA kecil. | Pembaikan ner penambahan DNA besar. |
| Kerosakan DNA | |
| Ber mengiktiraf kerosakan yang tidak menyebabkan gangguan besar kepada helix DNA. | Ner mengiktiraf kerosakan yang menyebabkan gangguan besar ke helix DNA. |
| Punca ganti rugi DNA | |
| BER membaiki kerosakan yang disebabkan oleh mutagen endogen. | Pembaikan kerosakan yang disebabkan oleh mutagen eksogen. |
| Kerumitan | |
| Ber adalah sistem pembaikan yang paling kompleks | Ia lebih kompleks daripada beratan. |
| Keperluan untuk protein | |
| Ber tidak memerlukan protein lain. | NER memerlukan beberapa produk gen, terutamanya protein, untuk mendiskriminasi kawasan yang rosak dan tidak rosak. |
| Kesesuaian | |
| BER sesuai untuk membetulkan kerosakan asas tunggal. | NER sesuai untuk menggantikan kawasan yang rosak. |
Ringkasan -Pembaikan Pengasingan Asas vs Pembaikan Pengecualian Nukleotida
NER dan BER adalah dua jenis proses pembaikan pengasingan DNA yang terdapat dalam sel. BER mampu membaiki kerosakan kecil yang disebabkan oleh endogen sementara NER dapat membaiki kawasan kerosakan sehingga 30 panjang pasangan asas yang disebabkan kebanyakannya oleh eksogen. BER berbeza dari NER dalam jenis substrat yang diiktiraf dan dalam acara belahan awal. BER juga boleh mengiktiraf kerosakan yang tidak disebabkan oleh gangguan besar dalam helix DNA manakala NER mengiktiraf gangguan besar helix DNA. Ini adalah perbezaan antara pembaikan pengasingan asas dan pengasingan nukleotida.
Ihsan gambar:
1. "Pembaikan DNA Expersion En" oleh Ladyofhats - (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia
2. “A schematic representation of models for the nucleotide excision repair pathway controlled by Uvr proteins” By Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, and Seiki Kuramitsu - ( CC oleh 1.0) melalui Commons Wikimedia
Rujukan:
1. Kim, Yun-jeong, dan David M. Wilson. "Tinjauan Base Excision Repair Biokimia."Farmakologi molekul semasa. U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, Jan. 2012. Web. 14 Mac. 2017.
2. Boer, Jan de, dan Jan H.J. Hoeijmakers. "Pembaikan pengasingan nukleotida dan sindrom manusia."Karsinogenesis. Oxford University Press, 01 mar. 2000. Web. 28 Mac. 2017
3. Hoogstraten et al. "Pengesanan kerosakan DNA serba boleh oleh protein pembaikan nukleotida genom global XPC."Jurnal Sains Sel. Syarikat Biologi Ltd, 01 Sept. 2008. Web. 28 Mac. 2017
