Perbezaan antara AFLP dan RFLP

Perbezaan utama - AFLP vs RFLP
 

Kajian DNA mempunyai kepentingan besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan pemetaan genom organisma. Beberapa teknik yang berkaitan dengan analisis DNA juga digunakan untuk mengenal pasti gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenali sebagai penanda molekul. Polimorfisme panjang serpihan diperkuatkan (AFLP) dan Polimorfisme Panjang Fragmen Sekatan (RFLP) adalah dua penanda molekul (kaedah) yang dibangunkan dalam biologi molekul untuk mengesan variasi genetik antara organisma. Kedua -dua kaedah adalah sama penting dan mempunyai kelebihan dan kekurangan. Perbezaan utama antara AFLP dan RFLP ialah AFLP melibatkan penguatan PCR selektif DNA yang dicerna manakala RFLP tidak melibatkan penguatan PCR selektif serpihan DNA.

Kandungan
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu AFLP
3. Apa itu RFLP
4. Perbandingan sampingan - AFLP vs RFLP
5. Ringkasan

Apa itu AFLP?

AFLP (polimorfisme panjang serpihan yang diperkuatkan) adalah alat penting dalam biologi molekul dan digunakan secara meluas dalam analisis variasi genetik. AFLP didasarkan pada penguatan PCR khusus DNA genomik yang berpecah dan pengesanan polimorfisme oleh autoradiografi melalui elektroforesis gel. AFLP menyumbang secara meluas untuk mengenal pasti perbezaan genetik dalam strain atau spesies yang berkait rapat dengan pelbagai kerajaan termasuk tumbuhan, haiwan, bakteria dan kulat. AFLP boleh dijalankan dengan sedikit sampel DNA yang tidak diketahui. Ia tidak memerlukan pengetahuan urutan sebelum dan merancang pemeriksaan.

Langkah -langkah AFLP

1. Pengasingan DNA
2. Pencernaan DNA dengan endonucleases sekatan
3. Ligation terhadap serpihan DNA terhad dengan penyesuai
4. Penguatan selektif serpihan dengan tapak sekatan tertentu
5. Pemisahan produk PCR oleh elektroforesis gel
6. Visualisasi Matriks Gel oleh Autoradiograph

AFLP adalah kaedah yang lebih sensitif dan boleh dihasilkan yang boleh digunakan dalam profil DNA beberapa taksiran termasuk kulat, bakteria, tumbuh -tumbuhan dan haiwan tanpa pengetahuan terlebih dahulu mengenai urutan DNA. Ia membantu dalam mengenal pasti sedikit perbezaan di kalangan individu dalam populasi kerana sifatnya yang sangat sensitif. AFLP juga penting dalam pemetaan genom, kajian forensik, ujian ibu bapa, genotip, dan lain -lain.

Rajah 01: AFLP

Apa itu RFLP?

Polimorfisme Panjang Fragmen Sekatan (RFLPS) adalah teknik yang digunakan untuk mengesan variasi genetik dalam urutan DNA homolog. Ini adalah kaedah pertama yang dibangunkan untuk profil DNA. Organisma mempunyai cap jari DNA yang unik atau profil DNA. RFLP berfungsi sebagai alat penting untuk menganalisis variasi antara profil DNA intraspecific atau organisma yang berkaitan dengan erat kerana urutan homolog mempunyai tapak sekatan yang berbeza (lokasi) yang unik kepada organisma tertentu. Apabila DNA homolog dicerna dengan endonucleases sekatan tertentu, ia akan menghasilkan profil DNA yang berbeza yang unik untuk setiap individu. Oleh itu, pengetua kaedah ini adalah pengesanan variasi genetik di kalangan organisma dengan menyekat DNA homolog dengan enzim sekatan tertentu dan analisis polimorfisme panjang serpihan melalui elektroforesis gel dan pembengkakan. Corak pembengkakan adalah unik untuk setiap organisma dan mencirikan genotip tertentu.

Langkah -langkah RFLP

1. Pengasingan jumlah DNA yang mencukupi dari sampel
2. Pemecahan sampel DNA dengan endonukleases sekatan tertentu ke dalam urutan pendek
3. Pemisahan serpihan yang dihasilkan dengan panjang yang berbeza oleh elektroforesis gel agarose.
4. Pemindahan profil gel ke dalam membran oleh pembengkakan selatan

5. Hibridisasi membran dengan probe berlabel dan analisis polimorfisme panjang serpihan dalam setiap profil

RFLP adalah teknik yang sangat penting dalam mengesan warisan penyakit dan mencari risiko kejadian penyakit di kalangan ahli keluarga. RFLP juga sering digunakan dalam pemetaan genom, mengenal pasti penjenayah dalam forensik, ujian paterniti, dll. RFLP mempunyai beberapa batasan juga. RFLP memerlukan pengetahuan terlebih dahulu mengenai data urutan untuk merancang pemeriksaan untuk hibridisasi. Ia juga memerlukan pengasingan jumlah DNA yang mencukupi dari sampel untuk dianalisis, yang sukar dalam kajian forensik.

Rajah 01: Pemetaan RRFLP

Apakah perbezaan antara AFLP dan RFLP?

Ringkasan -AFLP vs RFLP

AFLP dan RFLP adalah dua teknik yang digunakan sebagai penanda genetik untuk penilaian kepelbagaian dan penilaian hubungan genetik dalam biologi molekul. AFLP berfungsi sebagai kaedah yang cekap dan sensitif untuk mengesan polimorfisme genetik antara organisma daripada RFLP. Walau bagaimanapun, walaupun kedua -dua kaedah ini mempunyai kecekapan yang berbeza dalam mengesan variasi genetik, mereka masih digunakan untuk cap jari DNA dan diagnosis penyakit.

Rujukan:
'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana l. Benchimol, Antomnia m. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio l., dan anete p. De Souza. "Perbandingan penanda RAPD, RFLP, AFLP dan SSR untuk Kajian Kepelbagaian dalam Talian Inbred Jagung Tropika."Genetik dan biologi molekul. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 Mac. 2017
2. "Polimorfisme panjang serpihan sekatan (RFLP)."Pusat Kebangsaan Maklumat Bioteknologi. U.S. Perpustakaan Perubatan Negara, n.d. Web. 19 Mac. 2017
3. Masiga d. K. dan Turner c. M. (2004). "Analisis Polimorfisme Panjang (Sekatan) Panjang (AFLP)" diperkuatkan ". Kaedah Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 Mac. 2017

Ihsan gambar:
1. "ALFP" oleh Barbarossa di Dutch Wikipedia - dipindahkan dari NL.Wikipedia ke Commons. (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Pemetaan RFLP" oleh Retama - Kerja Sendiri (GFDL) melalui Wikimedia Commons