Perbezaan antara polimerase Klenow dan T4 DNA

The Perbezaan utama Antara Klenow dan T4 DNA polimerase ialah Serpihan klenow adalah serpihan besar E. coli Polimerase DNA 1 manakala polimerase DNA T4 adalah polimerase DNA 1 bacteriophage T4.

Polimerase DNA adalah enzim yang memangkin pembentukan DNA dengan menambahkan deoxyribonukleotida ke hujung 3'-oh primer yang sedia ada. Terdapat pelbagai jenis polimerase DNA. Kebanyakan polimerase DNA yang digunakan dalam biologi molekul adalah polimerase DNA prokariotik. Serpihan klenow dan polimerase DNA T4 adalah dua jenis polimerase DNA yang mempunyai asal prokariotik. Serpihan Klenow adalah serpihan besar yang dihasilkan dari belahan E.coli Polimerase DNA 1 menjadi dua serpihan oleh subtilisin protease bakteria. Polimerase DNA T4 ialah polimerase DNA 1 bacteriophage T4. Kedua -dua Klenow dan T4 DNA polimerase mempunyai 5 '→ 3' polimerase dan 3 '→ 5' aktiviti exonuclease. Kedua -duanya kekurangan aktiviti exonuclease 5 '→ 3', menjadikannya lebih sesuai untuk banyak aplikasi dalam biologi molekul.

Kandungan

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Klenow 
3. Apakah polimerase DNA T4
4. Persamaan antara polimerase Klenow dan T4 DNA
5. Perbandingan sampingan - Klenow vs T4 DNA polimerase dalam bentuk jadual
6. Ringkasan

Apa itu Klenow?

Serpihan Klenow adalah polimerase DNA yang berguna dalam biologi molekul. Bila E. coli Polimerase DNA 1 menjalani pencernaan proteolitik oleh protease bakteria, subtilisin, ia menghasilkan dua serpihan: satu adalah serpihan besar, dan yang lain adalah serpihan kecil. Serpihan Klenow adalah serpihan besar yang bersaiz 68 kDa. Serpihan Klenow mempunyai 5 '→ 3' polimerase dan 3 '→ 5' exonuclease (proofreading) Aktiviti DNA Pol I. Aktiviti exonuclease 3 '→ 5' dari serpihan Klenow memudahkan penyingkiran pangkalan ditambah dengan salah apabila pempolimeran berlangsung. Serpihan Klenow tidak mengandungi aktiviti exonuclease 5 '→ 3', yang ditunjukkan dengan penuh panjang atau utuh E. coli DNA polimerase 1. Ia berfaedah apabila hanya aktiviti pempolimeran yang diperlukan sahaja. Serpihan Klenow digunakan untuk mengisi 5 'overhangs, sintesis probe, penjujukan DNA, sintesis DNA double-stranded, sintesis cDNA cDNA kedua dan mutagenesis yang diarahkan tapak.

Rajah 01: Serpihan Klenow

Dalam aplikasi tertentu, aktiviti exonuclease 3 '→ 5' dari serpihan klenow juga menjadi tidak diingini. Ia dapat dikeluarkan dengan memperkenalkan mutasi kepada gen yang kod untuk serpihan klenow. Serpihan Klenow yang dihasilkan dikenali sebagai serpihan exo-klenow. Oleh itu, serpihan exo-klenow hanya mempunyai aktiviti polimerase 5 '→ 3' E. coli polimerase 1.

Apakah polimerase DNA T4?

Polimerase DNA T4 adalah polimerase DNA yang memangkinkan sintesis DNA. Ia adalah protein yang dikodkan oleh bacteriophage T4. Secara struktural, polimerase DNA T4 adalah protein residu asid 898 amino (berat molekul 103.6 kDa). Ia memerlukan templat dan primer untuk memangkin sintesis.

Rajah 02: T4 DNA polimerase

Sama dengan serpihan Klenow, polimerase T4 DNA mempunyai aktiviti exonuclease 5 '→ 3' dan 3 '→ 5'. Selain itu, ia tidak mempunyai aktiviti exonuclease 5 '→ 3' juga. Polimerase DNA T4 berguna dalam pengisian ujung 5'-protruding serpihan DNA. Ia juga sering digunakan untuk 5'-end atau 3'-end pelabelan DNA dua strand. Polimerase T4 DNA sering digunakan dalam pengklonan tumpul. Aktiviti 3 '→ 5' exonuclease (proofreading) T4 DNA polimerase lebih kuat (lebih daripada 200 kali) daripada serpihan klenow. Paling penting, polimerase T4 DNA mempunyai proses yang tinggi (400 nukleotida sesaat).

Apakah persamaan antara Klenow dan T4 DNA polimerase?

• Klenow dan T4 DNA polimerase adalah dua polimerase prokariotik.
• Kedua -dua polimerase mempunyai 5 '→ 3' polimerase dan 3 '→ 5' aktiviti exonuclease.
• Mereka tidak mempamerkan aktiviti exonuclease 5 '→ 3'.
• Kedua -dua enzim memerlukan templat dan primer untuk memangkin sintesis DNA.
• Enzim -enzim ini dapat diaktifkan pada 75 ⁰

Apakah perbezaan antara KLENOW dan T4 DNA polimerase?

Perbezaan utama antara polimerase Klenow dan T4 DNA adalah asal usul setiap enzim. Serpihan Klenow berasal dari bakteria manakala polimerase T4 DNA berasal dari bacteriophage yang merupakan virus. Polimerase T4 DNA mempunyai proses yang tinggi daripada serpihan klenow. Selain itu, polimerase T4 DNA mempunyai aktiviti pembacaan yang kuat daripada serpihan klenow. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara Klenow dan T4 DNA polimerase.

Info-grafik di bawah menyenaraikan lebih banyak perbezaan antara polimerase Klenow dan T4 DNA dalam bentuk jadual.

Ringkasan -Klenow vs T4 DNA polimerase

Serpihan klenow adalah serpihan besar e. coli polimerase 1. Ia hanya mempunyai aktiviti exonuclease 5 '→ 3' dan 3 '→ 5'. Ia tidak mempunyai aktiviti exonuclease 5 '→ 3' yang utuh e. coli DNA Pol 1. Oleh itu, serpihan klenow adalah polimerase bakteria. Sebaliknya, polimerase DNA T4 adalah polimerase yang dikodkan oleh bacteriophage T4. Sama dengan serpihan Klenow, ia mengandungi kedua -dua aktiviti exonuclease 5 '→ 3' dan 3 '→ 5', dan tidak mempunyai aktiviti exonuclease 5 '→ 3'. Walau bagaimanapun, polimerase T4 DNA mempunyai proses yang tinggi dan aktiviti pembacaan bukti yang tinggi daripada serpihan klenow. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara Klenow dan T4 DNA polimerase.

Rujukan:

1. "Polimerase DNA, T4."DNA Polymerase, T4 - Manual Enzim Worthington, boleh didapati di sini.
2. Rittié, Laure, dan Bernard Perbal. "Enzim yang digunakan dalam Biologi Molekul: Panduan Berguna."Jurnal Komunikasi dan Isyarat Sel, Springer Belanda, Jun 2008, boleh didapati di sini.

Ihsan gambar:

1. "Polimeredomains" - Bank Data Protein (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia 

2. "T4-DNA-Polimerase" oleh ChemPro-J. Wang, ms. Yu, t. C. Lin, w. H. Konigsberg, t. A. Steitz (1996). "Struktur kristal serpihan NH2-terminal polimerase DNA T4 dan kompleksnya dengan DNA tunggal dan dengan ion logam divalen" Biokimia 35: 8110-8119. Doi: 10.1021/BI960178R. (CC0) melalui Wikimedia Commons